Doctorante 2014-2017
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5

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Tel: 04 67 61 33 27

Bureau 201-1 (Aile B 2ème étage)

Comment les tissus durs nous informent sur les relations entre régime alimentaire, physiologie, environnement et trait d'histoire de vie? Le cas des mandrills sauvages du Gabon.

Encadrants : Marie Charpentier, Alejandro Romero & Jordi Galbany.

Mots clés : Régime alimentaire, primates, usures dentaires, Mandrillus, Gabon, traits d'histoire de vie.

    Dans le cadre de ma thèse je m'intéresse aux marqueurs de l'écologie alimentaire chez les vertébrés, et en particulier dans une population sauvage de mandrills (Mandrillus sphinx) vivant actuellement dans le parc de la Lékédi au Gabon. Ces marqueurs sont localisés dans les tissus biologiques (émail dentaire, poils, sang...), et retracent l'alimentation des individus sur une échelle de temps plus ou moins longue.

Etude de l'usure dentaire

    Je m'intéresse principalement à l'usure dentaire causée par le contact des dents avec des éléments extérieurs (aliments abrasifs - principalement des végétaux, poussière présente dans l'habitat...). L'usure, qui entraîne une modification progressive de la morphologie dentaire, peut être observée aux niveaux macroscopiques et microscopiques.

    Les patterns de micro-usures de l'émail sont traditionnellement étudiés en archéologie ou paléontologie afin de reconstituer le régime alimentaire et les paléoenvironnements, car on les associe à un type de végétaux particulier, plus ou moins riche en phytolithes (microrestes minéraux). On peut notamment différencier des animaux consommant essentiellement des graminés (exemples du cheval, de la vache, du gnou...), de ceux qui se nourrissent principalement de feuilles (chevreuil, girafe, gorille...). On sait aujourd'hui que les patterns d'usure sont également liés à la stratégie de mastication adoptée par une espèce, en fonction de l'aliment. Cependant, les mécanismes à l'origine des micro-usures sont encore mal compris, en ce qui concerne les rôles joués par l'alimentation, l'environnement, la mastication ou les traits d'histoire de vie.

    Les missions de terrain du projet mandrillus ont permis, depuis 2012, de récupérer des moulages de dents de nombreux mandrills, et qui correspondent à différentes saisons. L'effet de l'âge, du sexe et de la saisonnalité vont être testés sur mon échantillon. Je m'intéresserai également aux données comportementales des mandrills, récoltées sur le terrain afin de comparer l'alimentation observée aux tendances suggérées par l'analyse des usures dentaires.

    Enfin, l'usure générale et le stress physiologique (hypoplasies linéaires de l'émail) seront quantifiés grâce à d'autres moulages et aideront à l'interprétation des patterns de micro-usures.

Analyse des ratios d'isotopes stables dans les tissus

    L’analyse des ratios d’isotopes stables du carbone et de l’azote permet aussi d’accéder à des informations sur le régime alimentaire. Les poils gardent les signatures isotopiques de manière relativement stable dans le temps et informent sur l’alimentation de l’individu au cours des derniers mois (période correspondant à la croissance du poil). Ils sont couramment utilisés en primatologie dans l’étude de l’écologie alimentaire et permettent de compléter les observations faites sur le terrain. 

Les principales questions auxquelles ma thèse va tenter de répondre sont les suivantes :
1. Quelles sont les conséquences de la macro-usure dentaire sur la valeur adaptative, les traits d’histoire de vie et la capacité à se nourrir des mandrills ?
2. Est-ce que les micro-usures dentaires et les ratios isotopiques transcrivent les préférences alimentaires des individus, qui peuvent varier en fonction de l’âge, des saisons et des traits d’histoire de vie ?
3. Les pathologies dentaires sont-elles associées à une alimentation, une usure dentaire et une signature isotopique particulières ? Sont-elles plus fréquentes chez des individus de bas rang social et/ou d’état de santé dégradé ?

    Grâce à l'étude de l'usure dentaire in vivo sur une population sauvage de primates non humains, mon travail va permettre de contribuer à une meilleure connaissance des facteurs impliqués dans le phénomène d'usure au cours de la vie des individus, et de mieux comprendre les relations qui existent entre la morphologie dentaire, la signature isotopique et l’écologie alimentaire observée.

Liste des anciens membres de l'équipe:

Alice Baniel

Alice Percher

Aloïs Robert

Amélie Fargevieille

Anne-Sophie Deville

Aurore Ponchon

Claire Dufour

Clara Péron

Clémence Poirotte

Elisa Lobato

Elise Huchard

Françoise Amelineau

Hugo Gruson

Jérémy Tornos

Marie Charpentier

Marie-Jeanne Holveck

Maria Moiron

Mathieu Paquet

Nicolas Courbin

Paul Ramos

Philippe Perret

Sara Kada

Timo Brockmeyer

Virginie Demeyrier

Liste des projets de l'équipe

Doctorante

CEFE-CNRS

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Habitats urbanisés : des trappes écologiques potentielles pour les oiseaux sauvages ? Un exemple chez un oiseau cavicole : la mésange charbonnière, Parus major.

Encadrants : Anne Charmantier et Arnaud Grégoire

Mots clés : oiseaux, ville, nuisances, indice, ressources, trappe écologique, adaptation

Objectif central : Evaluer le potentiel adaptatif des oiseaux en milieu urbanisé.

L’urbanisation croissante impose de nouvelles contraintes à la faune sauvage en termes de sites de reproduction, de ressources et de perturbations anthropiques. Alors que l’urbanisation est considérée comme une situation extrême où l’Homme influence le milieu, elle peut aussi représenter une opportunité pour l’étude des mécanismes d’adaptation.

Les organismes utilisent des indices environnementaux de qualité de l’habitat afin d’effectuer le meilleur choix de site de vie et de reproduction. Si les indices utilisés pour leur choix correspondent à la qualité réelle du milieu, cela peut aboutir démographiquement à une dynamique source-puits. En revanche, dans les milieux perturbés, il est possible que les indices ne correspondent pas ou plus à la qualité réelle du milieu. Les organismes peuvent alors présenter une préférence forte pour un habitat de qualité faible, ce qui aboutit à une trappe/piège écologique. Les trappes écologiques se maintiennent dans le milieu si les espèces n’ont pas le temps d’apprendre à décrypter les nouveaux indices ou si elles ne s’y adaptent pas rapidement.

Mon projet de thèse s’articule autour de trois questionnements :

1. Est-ce que la taille de la cavité est l’indice utilisé par les oiseaux pour estimer l’investissement reproductif initial à fournir ? Est-ce que cela peut conduire à une trappe écologique ?
2. Est-ce que le succès reproducteur des oiseaux est impacté par le manque ou la mauvaise qualité des ressources en milieu urbain ?
3. Est-ce que les contraintes associées au milieu urbain favorisent certains phénotypes ?

Grâce à un dispositif urbain conséquent et à la collaboration des services des espaces verts et du parc zoologique de la Ville de Montpellier, un suivi populationnel de mésanges charbonnière est réalisé depuis 2011. Les données sur des traits d’histoire de vie et de comportement des mésanges permettront de comparer les forces de sélection qui agissent dans le milieu urbanisé par rapport au milieu rural. Le ‘cocktail’ artificiel comme les pollutions lumineuse, sonore et chimique ainsi que la contrainte urbaine sur la ressource sont quantifiés et considérés comme facteur explicatif dans la compréhension de la variation observée dans les traits démographiques et individuels des oiseaux. Plusieurs aspects expérimentaux ont également été mis en place tel que des tests de préférence de taille de cavité, une expérience de supplémentation, des tests de personnalité ou encore un volet de génomique.

Si les patrons d’abondance et de diversité des espèces en habitat urbanisé ont été largement décrits, les études s’intéressant aux mécanismes sous-jacents sont encore très peu abondantes à ce jour. Ainsi, à travers une approche expérimentale rigoureuse, le présent projet permettra de décrire le rôle peu connu de la taille des cavités artificielles sur les oiseaux cavicoles, et plus largement l’impact de l’artificialisation du milieu sur les processus évolutifs s’opérant en milieu urbain. Outre leur intérêt fondamental, les résultats obtenus auront des applications dans la gestion des espaces urbains ou pour les organismes de conservation qui recommandent largement le recours aux nichoirs artificiels.

Publications :

Demeyrier V., Lambrechts M. M., Perret P. & Grégoire A. 2016. Experimental demonstration of an ecological trap for a wild bird in a human-transformed environment. Animal Behaviour, 118, 181-190.

Vaugoyeau M., Adriaensen F., Artemyev A., Ba
nbura J., Barba E., Biard C., Blondel J., Bouslama Z., Bouvier J.-C., Camprodon J., Cecere F., Charmantier A., Charter M., Cicho
n M., Cusimano C., Czeszczewik D., Demeyrier V., Doligez B., Doutrelant C., Dubiec A., Eens M., Eeva T., Faivre B., Ferns P.N., Forsman J.T., Garc
ıa-del-Rey E., Goldshtein A., Goodenough A.E., Gosler A.G., Gr
egoire A., Gustafsson L., Harnist I., Hartley I.R., Heeb P., Hinsley S.H., Isenmann P., Jacob S., Juskaitis R., Korpimaki E., Krams I., Laaksonen T., Lambrechts M.M, Leclercq B., Lehikoinen E., Loukola O., Lundberg A., Mainwaring M.C., Mand R., Massa B., Mazgajski T.D., Merino S., Mitrus C., Monkkonen M., Morin X., Nager R.G., Nilsson J.-A., Nilsson S.G., Norte A.C., Orell M., Perret P., Perrins C.M., Pimentel C.S., Pinxten R., Richner H., Robles H., Rytkonen S., Senar J.C., Seppanen J.T., da Silva L.P., Slagsvold T., Solonen T., Sorace A., Stenning M.J., Tryjanowski P., von Numers M., Walankiewicz W. & Møller A.P. 2016. Interspecific variation in the relationship between clutch size, laying date and intensity of urbanization in four species of hole-nesting birds. Ecology and Evolution, doi: 10.1002/ece3.2335.

Lambrechts, M.M., Marrot, P., Fargevieille, A., Giovannini, P., Lucas, A., Demeyrier, V., Midamegbe, A., Perret, P., Charmantier, A., Grégoire, A. &   Doutrelant, C. 2016. Nest-size is not closely related to breeding success in Blue Tits: A long-term nest-box study in a Mediterranean oak habitat. The Auk, Vol. 133, 198-204.

Lambrechts M.M, Blondel J., Bernard C., Caro S., Charmantier A., Demeyrier V., Doutrelant C., Dubuc-Messier G., Fargevieille A., de Franceschi C., Giovannini P, Grégoire A., Hurtrez-Boussès S., Lucas A., Mainwaring M.C., Marrot P, Mennerat A., Perret S. & Perret P. 2015. Exploring biotic and abiotic determinants of nest size in Mediterranean great tits (Parus major) and blue tits (Cyanistes caeruleus). Ethology, doi:10.1111/eth.12 49.

Lambrechts, M.M., Demeyrier, V., Fargevieille, A., Giovannini, P., Lucas, A., Marrot, P., Midamegbe, A., Perret, P., Charmantier, A., Doutrelant, C. & Grégoire, A.   2014. Great Tits build shallower nests than Blue Tits. Avian Biology Research. 7(4): 251-254. DOI: 10.3184/175815514X14162394225987

Moller A. P., Adriaensen F., Artemyey A., Banbura J., Barba E., Biard C., Blondel J., Bouslama Z., Bouvier J.-C., Camprodon J., Cecere F., Charmantier A., Charter M., Cichon M., Cusimano C., Czeszczewick D., Demeyrier V., Doligez B., Doutrelant C., Eens M. Eeva T., Faivre B., Ferns P. N., Forsman J. T., Garcia-del-Rel E., Goldshtein A., Goodenough A. E., Gosler A. G., Gozdz I., Grégoire A., Gustafsson L. Hartley I. R., Heeb P., Hinsley S. A., Isenmann P., Jacobs S., Järvinen A., Juskaitis R., Korpimäki E., Krams I., Laaksonen T., Leclercq B., Lehikoinen E., Loukola O., Lundberg A., Mainwaring C., Mänd R., Massa B., Mazgajski T. D., Merino S., Mitrus C., Mönkkönen M., Morales-Fernaz J., Morin X., Nager R. G., Nilsson J.-A., Nilsson S. G., Norte A. C., Orell M., Perret P., Pimentel C. S., Pinxten R.,Priedeniece I., Quidoz M.-C.,Remes V., Richner H., Robles Diez H., Rytkönen S., Senar J. C., Seppänen J. T., Pascoal da Silva L. F., Slagsvold T. Solonen T., Sorace A., Stenning M. J., Török J., Tryjanowski P. van Noordwijk A. J., von Numers M., Walankiewicz W., Lambrechts M. M., 2014. Variation in clutch size in relation to nest size in birds. Ecology and Evolution. 4(18): 3583-3595. DOI: 10.1002/ece3.1189

Lambrechts M.M., Abouladzé M., Bonnet M., Demeyrier V., Doutrelant C., Faucon V., le Prado G., Lidon F., Noell T., Pagano P., Perret P., Pouplard S., Spitaliéry R., Grégoire A., 2013. Nest-box size influences where secondary-cavity exploiters roost and nest: a choice experiment . Journal of Ornithology. DOI: 10.1007/s10336-012-0919-y

Oral presentations:

Artificial cavities : potential ecological traps in urbanized habitats ? Workshop on Parids, Moulis (France), February 24th-25th 2014.

Ma thèse en 180 secondes : finaliste régionale 2014, PRES Sud de France.

Maladaptive reproductive investment and behavioral variation in urban habitat. ESEB 2015, Lausanne (Switzerland), August 10th-14th 2015.

Comparative approach on Great Tits personality in cities. Workshop on Parids, Montpellier (France), February 4th-5th 2016.

 Maladaptive reproductive investment in urban habitat. Ecology and Behaviour, Lyon (France), June 27th-July 1st 2016.

Poster:

Maladaptive reproductive investment and behavioral variation in urban habitat. BOU 2016, Leicester (UK), April 5th-7th 2016.