GEMEX

GEMEX est une plateforme technique dédiée à tous les personnels du CEFE, et parfois aussi à des personnes hors CEFE.

Elle accueille une centaine d’utilisateurs par an dans un espace de travail de 400 m².

Les trois pôles de compétences de la plateforme GEMEX sont :

• la génomique

• l'écologie moléculaire

• l'évolution expérimentale

Les missions de plateforme GEMEX sont :

• la mise au point d'outils et de techniques dans les domaines d'expertise

• la mise à disposition de ces outils et techniques aux utilisateurs de la plateforme

• le conseil sur le choix des outils et méthodes

• les élevages d'invertébrés aquatiques et la culture de microorganismes

• le transfert de compétences et la formation des utilisateurs de la plateforme

• la veille technologique

La plateforme GEMEX est engagée dans une démarche de respect de l’environnement et des ressources, notamment en adhérant au programme LEAF (Laboratory Efficiency Assessment Framework). Ainsi les actions suivantes sont mises en œuvre dans la mesure du possible :

• Economie d’énergie (par exemple en diminuant la température des congélateurs -80°C à -70°c)

• Economie de plastiques (par exemple leur remplacement par du verre)

• Tri sélectif des déchets

• Récupération et réutilisation de certains consommables

• Economie d’eau

La plateforme GEMEX est constituée de plusieurs salles laboratoires :

• quatre laboratoires de biologie moléculaire (deux pré-PCR, post-PCR, électrophorèse)

• un laboratoire "ADN sensible"

• deux laboratoires de bactériologie (dont un L2)

• un laboratoire de virologie

• trois animaleries aquatiques avec salles d'élevage

• une salle de culture de microalgues

La plateforme GEMEX collabore étroitement avec le plateau Génotypage-Séquençage (GenSeq), de l’UAR MEEB, ainsi qu’avec les plateaux MBB, qPCR, ADN dégradé de l’ancien labex CEMEB, et bénéficie de leurs infrastructures et appareillages.

Equipement GEMEX :

1 séquenceur PromethION P2solo

1 séquenceur MinIon portable

Matériel de biologie moléculaire (centrifugeuses, cuves d’électrophorèse, pipettes…)

1 Bead Blaster 24

1 Robot pipeteur 

5 Thermocycleurs

3 Hottes PCR

1 spectromètre Nanodrop

1 Qubit 4, 1 qubit flex

Logiciels: GeneMapper, Codoncode,...

Matériel de microbiologie (4 PSM, 2 Hottes flux laminaire, 3 agitateurs incubateurs, 5 incubateurs)

2 spectrofluoromètres TECAN, 1 cytomètre en flux

Laverie (1 autoclave, 1 autoclave de paillasse, lave-vaisselle…)