Quatre axes scientifiques transversaux complètent les thèmes des départements par des sujets sur lesquels le CEFE se positionne actuellement à travers l’engagement de certains de ses scientifiques :

• biodiversité numérique,
• écologie et agronomie,
• évolution expérimentale,
• sciences et sociétés,

Ces propositions sont complétées par un cinquième axe sur le cycle de vie des données, porté par des personnels des plateformes, et qui viendra s’articuler avec chacun des autres axes.