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Thèses de l'équipe

2010 Catherine Soler

2009 Noppol Kobmoo

2009 Julien Renoult

2009 Mélanie Roy

2007 Céline Born

2007 Guillaume Léotard

2007 Magali Proffit

2006 François Munoz

2003 Ambroise Dalecky

2003 Gabriel Debout

Doctorant    

CEFE/CNRS

Campus du CNRS

1919, route de Mende

34293 Montpellier

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Thèse

Dynamique écologique et évolutive des réseaux ectomycorhiziens potentiels et réalisés en Corse : influence des feux sur les interactions plantes-champignons en forêts montagnardes de pin laricio

Directeurs de thèse : Franck Richard (CEFE) et Christopher Carcaillet (CBAE)

Financement : concours doctorale Pres HESAM et Conservatoire Botanique National de Corse

Résumé : L’étude de la biodiversité requiert une prise en compte des interactions et de la dynamique des espèces sous l’effet des perturbations. Dans ce cadre, j'étudie la structure et la dynamique de réseaux d’interactions mutualistes entre les arbres et les champignons. Je cherche en particulier à comprendre comment les perturbations influence la structure des réseaux à deux niveaux. J'étudie ainsi (i) les réseaux d’interactions interspécifiques potentielles à l’échelle de la Corse et (ii) des réseaux réalisés localement et soumis à différents régimes de feux dans des forêts montagnardes de pin laricio (Pinus nigra subsp. laricio) en Corse. Cet écosystème concentre des richesses biologiques et culturelles élevées mais menacées, en particulier par les feux. La meilleure compréhension du système plantes / champignons / feux contribuera à fournir des éléments rationnels pour mener une politique de conservation intégrative de la biodiversité en Corse

Mots-clefs : ectomycorhize ; réseaux d’interactions ; écologie des communautés ; feux ; conservation

Travaux précédents :

Coexistence des espèces et variations des traits intra et inter-spécifiques : le cas des communautés d'arbres tropicaux en Guyane.

Stage de M2 S2 Environnement et Gestion de la Biodiversité (EPHE)

Sous la direction de Cyrille Violle (CEFE) et Christopher Baraloto (UMR ECOFOG).

Conservation d'un réseau d'interactions mutualistes : apport d'une approche systémique plante-centrée en Corse

Stage de M2 S1 Environnement et Gestion de la Biodiversité (EPHE)

Sous la direction de Franck Richard (CEFE), François Munoz (AMAP) & Annick Lesne (LPTMC).

Analyse des réseaux d'interactions plantes-champignons ectomycorhiziens

Stage de M2 Biologie Évolutive et Écologie (UM2)

Sous la direction de François Munoz (AMAP), Franck Richard (CEFE) & Annick Lesne (LPTMC).

Ecologie et évolution des réseaux plantes-macromycètes en Corse

Stage de M1 Biologie Évolutive et Écologie (UM2)

Sous la direction de Franck Richard (CEFE) & François Munoz (AMAP)

Communications :

Conservation d'un réseau d'interactions mutualistes : apport d'une approche systémique plante-centrée en Corse (Poster)

Beyond Common Mycorrhizal Networks: interspecific interaction networks underlying ectomycorrhizal community ecology (Poster présentées au colloque Network dynamics à Montpellier mars 2013 )

Publications :

Articles soumis :

Interspecific interaction networks underlying ectomycorrhizal community ecology. A. Taudiere, F. Munoz , A. Lesne, A.-C. Monnet, M.-A. Selosse, P.-A. Moreau, F. Richard

Articles en preparation :

Collaborations :

Pierre-Arthur Moreau : MCF Université, Lille Département de Botanique, Faculté des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques 

Annick Lesne : DR CNRS, laboratoire de Physique Théorique de la Matière condensée

Cyrille Violle : CR1 CNRS, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive

Laetitia Hugot : responsable du Conservatoire Botanique National de Corse, Office de l'Environnement de la Corse

Enseignement :

Je suis moniteur UM2 depuis octobre 2013. J’enseigne la génétique (L1), la diversité fongique (L3 & M1) et l’écologie des communautés (M1 & M2).

Post-doctorante
UMR-CEFE
CNRS
1919 route de Mende
34293 Montpellier cedex 5
Tel : +33/0 4 67 61 32 32
Fax : +33/0 4 67 61 33 36
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Activités de Recherche

Dynamique évolutive des espèces en réponse aux changements climatiques passés.
Les événements historiques responsables de la fragmentation des populations suivie d’événements de recolonisation ont fortement modifié la structure de la diversité génétique des espèces. La glaciation ou l’aridification au cours du Dernier Maximum Glaciaire (DMG) ont été très intenses et les tailles des populations survivantes probablement très réduites. J’ai eu l’occasion d’étudier l’importance des événements historiques associés à de fortes réductions démographiques sous deux latitudes extrêmes : en Afrique centrale équatoriale, en confrontant la distribution de la diversité génétique de l’okoumé (Aucoumea klaineana Pierre) aux patrons de diversités spécifiques et à travers l’Océan Austral, en analysant la structure spatiale de la diversité génétique de deux plantes Azorella selago Hook et Acaena magellanica (Lam.) Vahl sur l’ensemble de leurs distributions continentales et insulaires subantarctiques.
Au sein de l’UMR-CEFE, j’étudie actuellement, l’importance des changements climatiques passés sur des espèces en interactions obligatoires. La stabilité de ces mutualismes dépend directement de la survie de chaque partenaire lors des changements climatiques passés or ces espèces ont souvent des traits d’histoire de vie très différents. Plus particulièrement, j’étudie l’influence des changements climatiques passés sur association symbiotique obligatoire entre une plante, une fourmi et un champignon d’Afrique centrale : l’arbre Barteria fistulosa se caractérise pas des branches creuses, les domaties, dans lesquelles vivent et se reproduisent une colonie de fourmi de l’espèce des Tetraponera aethiops qui y cultivent un champignon de l’ordre des Chaetothyriale.

Syndromes de dispersion et dynamique de colonisation.
Les syndromes de dispersion ont une importance cruciale pour la dynamique de colonisation et la survie des espèces. Je me suis plus particulièrement intéressée aux conséquences de l’anémochorie et l’anémophilie, processus de dispersion fortement orientés sur la structure des populations fragmentées, en Afrique centrale et en région sub-Antarctique.

Formation et Recherches

o   2012-2013 : Projet post-doctoral à l’UMR5175-CEFE de Montpellier. Stabilité d'un mutualisme complexe le long d’un gradient climatique.
o   2010-2011 : Projet post-doctoral dans le département de Botanique et de Zoologie, Université de Stellenbosch (Afrique du Sud). Comment les changements climatiques affectent les capacités de dispersion des plantes ? Étude de la structure génétique spatiale d’Azorella selago sur l’île sub-Antarctique Marion.
o   2008-2009 : Projet post-doctoral dans le département de Botanique et de Zoologie, Université de Stellenbosch (Afrique du Sud). Importance des événements de dispersion longue distance à travers l’Océan Austral.
o   2007 : Doctorat en Écologie et Biologie Évolutive, Université de Montpellier II. Diversité génétique et dynamique des forêts d’Afrique centrale. Une étude multi-échelles de la structure de la diversité génétique d’un arbre pionnier Aucoumea klaineana (Burseraceae).
o   2002-2004  : Ingénieur d’étude en Écologie à l’UMR5175-CEFE de Montpellier. Caractérisation de l’introgression génétique entre deux espèces de chênes méditerranéens.
o   2001-2002 : DEA en Biologie Forestière de l’Université de Nancy I & Magistère de Génétique de l’Université de Paris VII. Analyse des associations entre statuts successionnels, discrimination isotopique et traits fonctionnels foliaires des arbres forestiers amazoniens (UMR-EcoFoG, Kourou).

Bourses

o    2010 : Bourse post-doctorale des Fonds de Recherche AXA (AXA Research Fund) dans le Département de Botanique et de Zoologie, Université de Stellenbosch (Afrique du Sud).
o    2008-2009 : Bourse post-doctorale SANAP-NRF dans le Département de Botanique et de Zoologie, Université de Stellenbosch (Afrique du Sud).
o    2006-2007 : Bourse doctorale de l’Agence Universitaire de la Francophonie, Unité de Génétique Tropicale, CIRMF (Gabon).

Publications

Blatrix R, Debaud S, Salas-Lopez A, Born C, Benoit L, McKey DB, Atteke C, Djiéto-Lordon C (In press). Convergent evolution of fungal cultivar specificity in independently evolved ant-plant-fungus symbioses. PLOS One.

Hardy OJ, Born C, Budde K, Daïnou K, Dauby G, Duminil J, Ewédjé E-E, Heuertz M, Koffi G-K, , Lowe A, Micheneau C, Ndiade Bourobou D, Poncet V (In press) Comparative phylogeography of African rainforest trees: a review of genetic signatures of vegetation history in the Guineo-Congolian domain. Comptes Rendus Geoscience.

Blatrix R, Born C, McKey D (In press) Consequences of past climate change on population and evolutionary dynamics of obligatory interacting species. Comptes Rendus Geoscience.

Benoit L, Blatrix R, Djiéto-Lordon C, Atteke C, l Mezui-M’Eko J, Dubois M-P, McKey DB, Born C (2013) Characterization of microsatellite loci for a fungal symbiont (Ascomycota, Chaetothyriales) in an ant-plant-fungus symbiosis. Molecular Ecology Resources, 13 : 760-762.

Peccoud J, Piatscheck F, Yockteng R, Garcia M, Sauve M, Djieto-Lordon C, Harris DJ, Wieringa JJ, Breteler FJ, Born C, McKey D, Blatrix R (2013) Multi-locus phylogenies of the genus Barteria (Passifloraceae) portray complex patterns in the evolution of myrmecophytism. Molecular Phylogeny and Evolution, 66: 824-832.

Born C, le Roux PC, Spohr C, McGeoch MA, Jansen van Vuuren B (2012) Plant dispersal in the sub-Antarctic inferred from anisotropic genetic structure. Molecular Ecology, 21: 184-194.

Webber BL, Born C, Conn BJ, Hadiah JT, Zalamea PC (2011) What is in a name ? That which we call Cecropia peltata by any other name would be as invasive ? Plant Ecology and Diversity, 4: 289-293.

Cerfonteyn ME, le Roux PC, Jansen van Vuuren B, Born C (2011) Cryptic spatial aggregation of the cushion plant Azorella selago revealed by a multilocus molecular approach suggests frequent intraspecific facilitation under sub-Antarctic conditions. American Journal of Botany, 98(5): 909-914.

Benoit L, Born C,Vignes H,Chevallier M-H,Todou G, Debain C, Joly HI (2011) Polymorphic microsatellite loci from Dacryodes edulis (Burseraceae), a central African rainforest and fruit–tree species. American Journal of Botany, 2011:e74-e75.

Groenewald CW, Born C, Chown SL,Jansen van Vuuren B (2011) Development of a microsatellite library for the flightless mothPringleophaga marioniViette(Lepidoptera: Tineidae).ConservationGeneticsResources,3(2):291-294.

Born C,Alvarez N,McKey D,Ossari S,Wickings EJ,Hossaert-McKey M,Chevallier MH (2011) Insights into the biogeographical history of the Lower Guinea Forest Domain:  evidence for the role of refugia in the intraspecific differentiation of Aucoumea klaineana. MolecularEcology, 20:131-142.

Bout N, Born C, Spohr C (2010) Evidence that the spotted hyena is present in the rainforest-savannah mosaic of south-east Gabon. Mammalian Biology-Zeitschriftfur Saugetierkunde,75:175-179.

Born C, McGeoch M,Jansen van Vuuren B (2010) Eight polymorphic microsatellite markers developed to study the genetic diversity of Azorella selago (Apiaceae),a keystone species on sub-Antarctic Marion Island. In MERPD Consortium, Molecular Ecology Resources,10,232-236.

Born C, Kjellberg F, Vignes H,Wickings EJ,Chevallier MH,Hossaert-McKey M (2008) Colonization processes and the maintenance of genetic diversity:insights from a pioneer rainforest tree,Aucoumea klaineana.Proceedings of the Royal Society of London, B, 275 (1647):2171-2179.

Born C, Hardy O,Ossari S, Attéké C, Wickings EJ, Chevallier MH, Hossaert-McKey M (2008) Small-scale spatial genetic structure in the Central African rainforest tree species, Aucoumea klaineana: a stepwise approach to infer the impact of limited gene dispersal, population history and habitat fragmentation. Molecular Ecology,17:2041-2050. See also Dick (2008) Molecular Ecology,17:1873-1874 for aPerspective on this paper.

Bonal D, Born C, Brechet C, Coste S, Marcon E,Roggy JC,Guehl JM(2007) The successional status of tropical rainforest tree species is associated with differences in leaf carbon isotope discrimination and functional traits. Annals of Forest Sciences, 64:169-176.

Born C, Vignes H, Wickings EJ, Hossaert-McKey M,Chevallier MH (2006) Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci from Aucoumea klaineana Pierre (Burseraceae), a tropical tree endemic to the Congo Basin. Molecular Ecology Notes, 6: 1054-1056.

Alvarez N, McKey D,Hossaert-McKey M, Born C, Mercier L,Benrey B (2005) Ancient and recent evolutionary history of the bruchid beetle, Acanthoscelides obtectus Say, a cosmopolitan pest of beans.Molecular Ecology,14:1015-1024.

Coste S,Roggy JC,Imbert P,Born C,Bonal D,Dreyer E (2005) Diversity in leaf traits related to photosynthesis among seedlings from 14 rainforest tree species: is there a relationship with the ecological grouping of the species? Tree Physiology, 25:1127-1137.

Lumaret R,Tryphon-Dionnet M, Michaud H, Sanuy A,Ipotesi E, Born C, MirC (2005) Phylogeographical variation of chloroplast DNA in Cork Oak(Quercus suber). Annals of Botany, 96:853-861.

Alvarez N, Born C ,Risterucci AM,Sourrouille P,Benrey B,Hossaert-McKey M (2004) Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in Acanthoscelides obtectus Say (Coleoptera:Bruchidae).Molecular Ecology Notes, 4:683-685.

Chapitre de livre

Ouwe Missi Oukem-Boyer O, Migot-Nabias F, Born C, Aubouy A, Nkenfou C (2012) Application of PCR Technologies to Humans, Animals, Plants and Pathogens from Central Africa. In Polymerase Chain Reaction (Eds Hernandez-Rodriguez and Ramirez-Gomez), InTech, 566pp.

Thèse de doctorat 

Born C (2007) Diversité génétique et dynamique des forêts d’Afrique centrale. Une étude multi-échelle de la structure de la diversité génétique d’un arbre pionnier, Aucoumea klaineana. Université Montpellier II, Montpellier, France.