Doctorant 

jonathan.bonfanti[at]univ-montp3.fr
jonathan.bonfanti[at]cefe.cnrs.fr

(+33)(0)4 67 14 24 24
Bat. J, Campus route de Mende
Université Paul-Valéry Montpellier 3

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Résumé : 

Les concepts d'écologie fonctionnelle sont actuellement appliqués dans les écosystèmes des sols de manière croissante. Ils permettent d'explorer la biodiversité au travers de la facette qui lie les organismes des sols aux fonctions écologiques et aux services écosystémiques fournis par ces écosystèmes. Dans un contexte de changements globaux, les sols sont des systèmes particulièrement menacés, notamment par les changements climatiques. Les collemboles sont des organismes considérés comme de bons bioindicateurs dans les sols. Les connaissances accumulées sur ces organismes, notamment concernant leurs traits, permettent aujourd'hui d'appréhender leurs relations avec des contraintes environnementales, en particulier climatiques, via une approche fonctionnelle. J'étudie avec des analyses basées sur les traits des collemboles, les liens entre la faune du sol et les contraintes climatiques à différentes échelles spatiales et temporelles, sur le continent européen. 
Axes de réflexion :
1) Les traits des collemboles permettent-ils de dégager des patrons de variabilité, notamment intraspécifique, à l'échelle du continent européen ?
2) Face à une pression climatique brutale, comment réagissent sur le terrain les communautés de collemboles - supposées stables et présentant des adaptations à long terme à leur milieu - notamment au travers de leur structure et de leur composition fonctionnelle ?
3) Peut-on décrire les liens traits des organismes <-> fonctions écologiques chez les collemboles, (i) en conditions climatiques contrôlées au laboratoire, (ii) au terrain dans une zone climatique d'intérêt ? 

Mots-clés : 

Faune du sol, Collemboles, communautés, traits, base de donnée, gradient climatique, décomposition, holobionte, variabilité intraspécifique

Encadrement de thèse (par odre alphabétique) : Jérôme CORTET, Mickaël HEDDE, Paul Henning KROGH

Membre actif du réseau TEBIS (Le réseau international francophone sur les Traits Écologiques et Biologiques des organIsmes du Sol) : http://www.reseau-tebis.fr/

Contributeur et utilisateur de la base de données BETSI : http://betsi.cesab.org/

Publications : 

Bonfanti J, Hedde M, Joimel S, Krogh PH, Violle C, Nahmani J, Cortet J. (2018) Intraspecific body size variability in soil organisms at a European scale: implications for functional biogeography. Functional Ecology 32: 2562-2570.
https://doi.org/10.1111/1365-2435.13194 

Communications orales : 

- Trait patterns of soil decomposers under climate manipulation field experiment: Collembola communities in the ‘CLIMAITE’ study. Auteurs : Bonfanti J, Krogh PH, Cortet J, Hedde M, Holmstrup M.
Congrès International Conference on Ecological Sciences, à Rennes (FR), 22-25 octobre 2018

- Dynamique des traits de décomposeurs au sein d’une simulation climatique expérimentale sur le terrain : les communautés de collemboles dans l’étude « CLIMAITE ». Auteurs : Bonfanti J, Krogh PH, Cortet J, Hedde M, Holmstrup M.
Congrès Journées TEBIS VII, à Avignon (FR), 1-3 octobre 2018

- Variabilité intraspécifique de la longueur du corps chez les collemboles au sein d’une base de données de traits : une comparaison multi-échelles (approches de biogéographie fonctionnelle, gradients environnementaux). Auteurs : Bonfanti J, Hedde M, Cortet J, Krogh PH, Violle C, Joimel S.
Congrès Journées TEBIS VI, à Metz (FR), 2-4 octobre 2017

- Le microbiote intestinal comme potentiel trait fonctionnel chez les Collemboles ? Auteurs : Bonfanti J, Ellegaard-Jensen L, Hansen LH, Cortet J, Hedde M, Vergnes A, Krogh PH.
Congrès Journées TEBIS VI, à Metz (FR), 2-4 octobre 2017

- Collembolan trait patterns with climate modifications along a European gradient: the VULCAN case study. Auteurs : Bonfanti J, Cortet J, Hedde M, Joimel S, Krogh PH, Petersen H.
Congrès Journées TEBIS V, à Toulouse (FR), 3-5 octobre 2016

Posters :

- Collembolan trait patterns with climate modifications along a European gradient: the VULCAN case study. Auteurs : Bonfanti J, Cortet J, Hedde M, Joimel S, Krogh PH, Petersen H.
Congrès International Conference on Ecological Sciences, à Marseille (FR), 24-28 octobre 2016

Ateliers, workshops, formations, animation scientifique :

- Présentation «Loi République Numérique (Art. 30)», Auteur : Bonfanti J.
Séminaire CEFE «Libérez-vos publications !», à Montpellier (FR), 15 octobre 2018, Organisation (par ordre alphabétique) : Bonfanti J, Gorgeon A, Grenié M, Gruson H, Quidoz M-C, Rodrigues A.

- Atelier «Traits fonctionnels à l’échelle du paysage et plus...». Co-animation : Vergnes A, Bonfanti J.
Congrès Journées TEBIS VI, à Metz (FR), 2-4 octobre 2017 

Centre d’Écologie Fonctionnelle et Évolutive
UMR 5175 CEFE Bât J-H Fabre
Université Paul Valéry Montpellier 3
Route de Mende
34 199 Montpellier Cedex 5
Tél : 04 67 14 23 14

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Actuellement en thèse CIFRE avec le bureau d’études CREOCEAN, je travaille sur la mise en place de la compensation écologique sur le milieu marin. La réglementation actuelle impose aux maîtres d’ouvrage de respecter le principe « éviter – réduire – compenser » lors de la conception de les projets d’exploitation et d’aménagement. Concernant les écosystèmes marins, ces mesures compensatoires font appel à des actions écologiques ainsi qu’à des mesures de gestion et d’amélioration des connaissances sur le milieu marin. Alors que le développement de l’activité économique maritime est encouragé, en particulier, suite aux appels à la croissance bleue (e.g. tourisme maritime, énergie marine renouvelable, ressources minérales marines, biotechnologies, transport maritime), il est primordial de questionner nos capacités à prendre en compte les impacts de ces activités. Plus largement, je m’intéresse à l’application des politiques publiques environnementales sur le milieu marin comme la Directive Cadre Stratégie sur le Milieu Marin (DCSMM).

Références

Jacob, C., Quétier, F., Aronson, J., Pioch, S., & Levrel, H. (2015). Vers une politique française de compensation des impacts sur la biodiversité plus efficace: défis et perspectives. VertigO-la revue électronique en sciences de l'environnement, 14(3).

Bas, A., Jacob, C., Hay, J., Pioch, S., & Thorin, S. (2016). Improving marine biodiversity offsetting: A proposed methodology for better assessing losses and gains. Journal of environmental management, 175, 46-59.

Jacob, C., Pioch, S., & Thorin, S. (2016). The effectiveness of the mitigation hierarchy in environmental impact studies on marine ecosystems: A case study in France. Environmental Impact Assessment Review, 60, 83-98.

Jacob, C., Vaissière A-C., Bas A., & Calvet C. (accepted). Investigating the inclusion of ecosystem services in biodiversity offsetting. Ecosystem Services.

Cotutelle PhD student

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UMR 5175 CEFE
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route de Mende
34199 Montpellier cedex 5
tel (+33)(0)4 67 14 23 15

Research goals

I revisited the environmental filtering metaphor in urban ecology context, in particular zooming on urban parks in Mediterranean Region (Naples and Montpellier cities).Even though urban parks are considered as biodiversity hot-spots within the cities, they are usually still far from reaching this status. Indeed, spatial and temporal landscape discontinuities, as well as the management disturbances may be exacerbated, causing decays of soil biodiversity.

The main goals of the thesis are to understand whether the collembolan species and trait communities are shaped by: 1- factors which are indicators of management practices of urban parks; 2- the landscape and the temporal heterogeneity of the studied sites.

Lire la suite : Vittoria MILANO

Stagiaire Master 2

Contact : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

Encadrant : Jean-Pierre LUMARET

Sujet de stage

Organisation des communautés de coléoptères coprophages (Coleoptera:  Scarabeidae, Geotrupidae et Aphodiidae) dans les garrigues du sud de la France en fonction de l’ouverture du milieu et des ressources trophiques.

Objectif

Nous aurons pour objectif, l’analyse de successions temporelles et spatiales.        

 Pour cela nous effectuerons des relevés séparer par trois semaines en piégeage standard où tout dépôt de pièges sera relevé sept jours plus tard, en effet au-delà de sept jours l’appât perd son attractivité ce qui est dû à des substances volatiles spécifiques.

Nous diviserons cette étude en deux parties analytiques, pour tester deux facteurs : l’ouverture du milieu et la nature des  ressources alimentaires disponibles sur la structuration des communautés.

- Analyse de la transition hiver-printemps (Février-Mai) entre deux stations qui diffèrent par leur degré d’ouverture, ouvert et fermé (deux réplicats par modalité à la suite ; donc deux relevés en deux semaines).

-Dans un même temps nous étudierons le choix alimentaire des espèces durant le printemps (en principe forte activité des insectes en Avril-Mai) en utilisant deux types d’appâts  (bouses de vache et crottin de cheval) ; nous verrons quels en sont les effets sur la diversité des Coléoptères. Nous effectuerons trois réplicats de chacun des appâts ; relevé hebdomadaire des pièges pendant deux semaines consécutives de manière à pallier les aléas climatiques. Nous attendrons trois semaines entre chaque série de relevés, afin d’avoir des communautés différentes dans le temps.

Curriculum Vitae

Scolarité

- M2 «Biologie des Organismes, des populations et des Ecosystèmes» Université d’Orléans, année -2013

- M1 « Ecosystème Terrestre », Université d’Orléans, année - 2012

- Licence de biologie à l’Université de Bordeaux I, année - 2011

Stages

- Février-Juin 2013 : « Organisation des communautés de coléoptères coprophages dans les garrigues du sud de la France en fonction de l’ouverture du milieu et des ressources trophiques. » au CEFE de Montpelier 3

- Juillet 2012 : Stage « ECOMED» organisé par l’UPMC, Observatoire océanologique, Laboratoire Arago de Banyuls sur mer.

- Avril-Juin 2012 : stage de M1 «identification biogéographique, morphologique de coléoptères (Monochamus)»,  Laboratoire de zoologie forestière INRA d’Ardon

- Juin 2011 : « étude des macro-invertébrés benthiques du bassin d’Arcachon »,  EPOC.CNRS.Arcachon

- Juin 2010 : stage-découverte « comportement d’une espèce invasive d’écrevisses,  (Procambarus clarkii) », CNIC, Bordeaux_I

- Juin 2006 : stage d’initiation à l’OPIE de Guyancourt

Travaux

- Octobre-Novembre 2012 : Responsable de l’UE Initiation au monde des insectes  (5 cours) à l’UTL d’Orléans.

- Janvier 2012 : Intervention orale de présentation de « Les Dytiscinae » au Museum d’Orléans (SoMOS)

- Janvier 2011 : Animation « La biodiversité expliqué aux enfants », responsable du stand Arthropodes