2013-2017 : Doctorat d’Écologie (école doctorale GAIA, Montpellier)
Titre : Dynamique d'un système social écologique dans les plaines inondables du fleuve Congo
https://theses.hal.science/tel-01678017
Directeur.rices de thèse : Doyle McKey et Sophie Caillon.
Financement : Bourse de l’école doctorale SIBAGHE et fonctionnement par l’Institut Universitaire de France (IUF).
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Résumé
L’agriculture sur champs surélevés était un type d’agriculture répandu dans les marais et dans les savanes saisonnièrement inondées de la région néotropicale avant la conquête européenne. La compréhension de ce système agricole suscite beaucoup d’intérêt auprès des chercheurs et soulève de nombreuses questions et débats d’ordres écologique, agronomique et social. Les sources d’informations principales actuelles (études géoarchéologiques et expériences de réhabilitation) sont incomplètes et imparfaites. Une autre source d’information, pertinente mais peu explorée, est l’étude de systèmes analogues, encore cultivés dans d’autres régions du Monde, qui peuvent servir de modèles pour approcher les multiples questions ouvertes sur le fonctionnement de l’agriculture sur champs surélevés.
Il s’agit ainsi dans ce sujet de thèse de réaliser une étude ethnoécologique de l’agriculture sur champs surélevés encore pratiquée en République du Congo, plus exactement dans les plaines inondables du fleuve Congo. Marion Comptour s’intéresse aux pratiques et savoirs locaux liés aux champs surélevés (agrobiodiversité et calendrier agricole, gestion de la fertilité des sols, rendements, organisation sociale…). Plus largement cette thèse s’interroge sur les interactions entre les humains et un paysage inondé, explorant la complémentarité des activités de production (agriculture sur champs surélevés, agriculture de décrue, et activités de pêche) et la dynamique de ce socio-écosystème face à des changements démographiques, écologiques, économiques et sociaux.
Cette étude est novatrice car elle examine de manière intégrée la pluriactivité comme une adaptation à un milieu intrinsèquement rythmé par la saisonnalité des crues et comme facteur de résilience face aux risques et aux changements. Elle fournit également de nouveaux éléments dans la compréhension du fonctionnement des champs surélevés et de leur potentiel en tant qu’agriculture durable dans les zones humides.
Questions de recherche
- Comment fonctionne l’agriculture sur champs surélevés d’un point de vue agronomique, économique, et social ?
- Quelles sont les stratégies développées par les populations pour s'adapter aux variations spatio-temporelles des ressources naturelles et aux risques d'inondations et pour optimiser la productivité de l’écosystème ?
- Quelles sont les capacités adaptatives des populations face aux changements environnementaux mais également économiques et sociaux, et quelle est la résilience de ce socio-écosystème ?
Méthodologie
Marion Comptour adopte pour ce travail de recherche une approche interdisciplinaire, systémique et diachronique pour analyser les interactions entre les différentes activités composant le système de production (agriculture sur champs surélevé, agriculture de décrue et pêche) et pour comprendre quelles sont les variables environnementales, sociales et économiques agissant à différentes échelles temporelles (temps long, temps saisonnier et temps de l’individu) et spatiales (locales, nationales, internationales) dans la dynamique de ce socio-écosystème.
Ce travail de thèse s’appuie sur des données et méthodes d’enquêtes et d’analyse de sciences naturelles (écologie, agronomie, hydrologie) et sciences humaines et sociales (anthropologie, géographie, histoire).
Mots clefs
ethno-écologie, géographie culturelle, savoirs locaux, socio-écosystème, pluriactivité, champs surélevés, plaines inondables, République du Congo
Publications
Comptour M, Moracchini V (2019). Cartographie et toponymie des quartiers de Saint-Laurent du Maroni, In Noucher M et Polidori L (Dir), Atlas critique de la Guyane, Paris, CNRS Edition, pp 78-79
Comptour M, Palisse M (2019). Saint-Laurent du Maroni, un territoire urbain lié aux circulations des dynamiques agricoles, In Noucher M et Polidori L (Dir), Atlas critique de la Guyane, Paris, CNRS Edition, pp 210-211
Moracchini V, Comptour M (2019). Les oubliés de la cartographie : les quartiers informels de Saint-Laurent du Maroni, In Noucher M et Polidori L (Dir), Atlas critique de la Guyane, Paris, CNRS Edition, pp 304-305
Comptour M (2019). Les jardins dans les quartiers spontanés : bénéfices certains, futur incertain, In Noucher M et Polidori L (Dir), Atlas critique de la Guyane, Paris, CNRS Edition, pp 308-309
Comptour M, Cosiaux A, Coomes OT, Bader J-C, Malaterre P-O, Yoka J, Caillon S, McKey D (2019). Agricultural innovation and environmental change on the floodplains of the Congo River. The Geographical Journal 186 (1).
https://rgs-ibg.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/geoj.12314
Comptour M, Caillon S, Rodrigues L, McKey D (2018). Wetland raised-field agriculture and its contribution to sustainability: ethnoecology of a present-day African system and questions about pre-Columbian systems in the American tropics. Sustainability 10 (9) : 3120
https://www.mdpi.com/2071-1050/10/9/3120
Comptour M (2017). Entre pêche, agriculture et commerce, jouer avec la variabilité écologique et sociale : Dynamique d’un système social-écologique dans les plaines inondables du fleuve Congo. Thèse de doctorat sous la direction de D McKey et S Caillon, Montpellier, Ecole doctorale GAIA, 250p. https://theses.hal.science/tel-01678017
McKey D, Renard D, Comptour M (2017). Will the real raised-field agriculture please rise ? Indigenous knowledge and the resolution of competing visions of one way to farm wetlands. In Indigenous Knowledge. Enhancing its Contribution to Natural Resources Management. Wallingford, UK, 116-129.
Comptour M, Caillon S, McKey D (2016). Pond fishing in the Congolese cuvette: a story of fishermen, animals and water spirits. Revue d’ethnoécologie 10(10), 29 p.
https://journals.openedition.org/ethnoecologie/2795
Labrière N, Laumonier Y, Locatelli B, Vieilledent G, Comptour M (2015). Ecosystem services and biodiversity in a rapidly transforming landscape in Northern Borneo. PLoS One 10, 18 p.
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0140423
McKey D, Renard D, Zangerlé A, Iriarte J, Adame KL, Jimenez LES, Solibiéda A, Durécu M, Comptour M, Rostain S, Raimond C (2014). New approaches to pre-Columbian raised-field agriculture: the ecology of seasonally flooded savannas, and living raised fields in Africa, as windows on the past and the future. In Amazonia. Memorias de las Conferencias Magistrales del 3er Encuentro Internacional de Arqueología Amazónica. Quito, Ecuador, 91-136.
Liste des projets de l'équipe
Doctorante de l'Université Montpellier II
UMR 113
Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes
Tél : +33/0 4 67 59 38 01
Fax : +33/0 4 67 59 38 02
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Mots-clés : Organismes biologiques : Plantes / Bactéries - Discipline : Physiologie végétale et microbienne - Technique : Microbiologie, Phytochimie, Chromatographie, Cytologie. Thématique : Etude de la symbiose entre les légumineuses du genre Crotalaria et les bactéries du genre Methylobacterium - Autres mots-clés: dialogue moléculaire, métabolites secondaires, nodules.
Soutenance de thèse le 18 janvier 2008 : couverture, résumé.
Dans le cadre des problématiques de recherches de l’équipe Substances Naturelles et Médiation Chimique, l’étude de la symbiose entre les légumineuses du genre Crotalaria et les bactéries du genre Methylobacterium apporte de nouveaux éléments dans la compréhension du dialogue moléculaire s'établissant entre les plantes et les microorganismes de sa rhizosphère.
Les légumineuses du genre Crotalaria comprennent plus de 600 espèces dont la majorité sont fixatrices d’azote. Comme chez la plupart des légumineuses, le siège de la fixation de l'azote est un organe racinaire appelé nodule. Dans cet organe se met en place une symbiose entre une bactérie fixatrice d’azote (appelée communément rhizobium) et la plante. La plupart des souches bactériennes fixatrices d’azote développant une symbiose avec les Crotalaires, appartiennent au genre Bradyrhizobium, bactéries que l’on trouve communément associées à de nombreuses autres légumineuses (Samba et al., 1999 ; You et al., 2002). Récemment, il a été montré que trois espèces de Crotalaires, Crotalaria glaucoïdes, C. perrottetii et C. podocarpa, développent une symbiose fixatrice d’azote très originale avec des bactéries appartenant au genre Methylobacterium conduisant à la caractérisation d’une nouvelle espèce bactérienne : Methylobacterium nodulans (Sy et al., 2001 ; Jourand et al., 2004).
Les bactéries du genre Methylobacterium sont habituellement connues pour leur fonction métabolique méthylotrophique leur permettant d’assimiler les composés mono-carbonés comme le méthanol, un substrat rarement utilisé par les bactéries. Methylobacterium nodulans présente donc non seulement cette fonction métabolique méthylotrophique mais aussi les capacités à noduler et à fixer l’azote. Ainsi, les Crotalaires nodulées par les Methylobacterium apparaissent comme un modèle très original de relation plante-microorganismes.
Les Crotalaires sont par ailleurs des plantes productrices de substances naturelles actives variées. En outre, des extraits aqueux de racines de plusieurs espèces de ces crotalaires paralysent réversiblement les nématodes juvéniles au stade infestant, suggérant un fort potentiel nématostatique de ces plantes (Jourand, 2003).
Au cours de cette thèse, nous souhaitons étudier non seulement les mécanismes moléculaires et biochimiques des interactions entre la légumineuse Crotalaria et la bactérie Methylobacterium, mais aussi les conséquences de l’utilisation de cette symbiose dans la lutte contre les nématodes phytoparasites, en particulier du genre Meloidogyne.
Nos recherches portent sur la caractérisation moléculaire de la symbiose fixatrice d’azote Crotalaria / Methylobacterium ainsi que sur le implication de la fonction méthylotrophique dans ce processus de symbiose. Ces travaux permettent de comparer la nodulation des Methylobacterium à celle des rhizobium classiques, et de mieux comprendre comment la plante a pu sélectionner des partenaires bactériens aussi particuliers.
Nous cherchons également à caractériser les métabolites secondaires produits par les Crotalaires et impliqués dans l’activité nématostatique. Nous utilisons pour cela des techniques de cytologie (coupes de tissus racinaires et de nodules), d’histochimie (coloration des métabolites secondaires : flavonoïdes, polyphénols, alcaloïdes), et d’analyses biochimiques (CCM, HPLC...). Nous recherchons en particulier s’il existe des mécanismes et/ou des médiateurs chimiques communs impliqués dans les processus de symbiose et de résistance de la plante aux nématodes.
Sélection de publications
Renier A., Jourand P., Rapior S., Poinsot V., Sy A., Dreyfus B. et Moulin L. (2008) Symbiotic properties of Methylobacterium nodulans ORS 2060T: a classic process for an atypical symbiont. Soil Biology and Biochemistry, 40, 1404-1412
Renier A., Vivien E., Cociancich S., Letourmy P., Perrier X., Rott P.C. et Royer M. (2007) Substrate specificity-conferring regions of the nonribosomal peptide synthetase adenylation domains involved in albicidin pathotoxin biosynthesis are highly conserved within the species Xanthomonas albilineans. Appl Environ Microbiol. 73(17) : 5523-5530.
P. Jourand, A. Renier, S. Rapior, S. Miana de Faria, Y. Prin, A. Galiana, E. Giraud, and B. Dreyfus (2005) Role of Methylotrophy During Symbiosis Between Methylobacterium nodulans and Crotalaria podocarpa. Molecular Plant-Microbe Interactions 18:1061-1068.
Posters
Renier A. et Rapior S. The Methylobacterium nodulans / Crotalaria podocarpa symbiosis: a classic process for an original model. International Conference Rhizosphere 2 (Montpellier, France, 26-31/08/2007). Poster.
Renier A., Rapior S., Dreyfus B. et Jourand P. 2006. Methylotrophy: from a great assess in symbiosis process to the molecular dialog elucidation. 7èmes Rencontres Plantes-Bactéries (Aussois, France, 20-24/03/2006). (Poster)
Renier A., Rapior S., Prin Y., Miana de Faria S., Galiana A., Giraud E., Dreyfus B. et Jourand P. 2005. Methylotrophy: a great asset in symbiosis process. 14th Australian Nitrogen Fixation Conference (Katoomba, Australie, 21-25/11/2005). (Poster)
Liste des anciens membres de l'équipe
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Maître de Conférences, Université de Montpellier
Etude in situ des médiateurs chimiques des plantes (métabolites phénoliques surtout), intervenant lors de stress biotiques (modèle Helianthus/Sclerotinia ; Vitis/Plasmopara Vitis/Eutypa ; Leonardoxa/fourmis ; Coffea/Nématodes ; Oriza/Nématodes) ou abiotiques (détection de l'activité herbicide sur des graminées nuisibles…), ainsi que lors de variations du milieu (cas de la domestication chez le Manioc…), ou lors de variations physiologiques (cycle végétatif du caféier, exposition aux rayonnements UV de caféiers et de Centella asiatica …)
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