Biogéographie et Ecologie des Vertébrés
Elodie PORTANIER
- Publication : 14 décembre 2023
Postdoctorante
Etage 1, aile A, bureau 119
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Supervisor : Stéphanie Manel (CEFE, EPHE - PSL)
Co-supervisor : Sebastien Devillard (LBBE)
Projet: Génomique des populations du raton-laveur en France
Mots clés : Espèce invasive, génétique du paysage, génomique du paysage, potentiel adaptatif
Dans ce projet, nous proposons de mettre en place une approche de génomique du paysage sur les populations françaises de raton-laveurs (Procyon lotor) afin de :
- Comprendre quels sont les éléments du paysage qui assurent la continuité fonctionnelle des populations pour mettre en place des stratégies de gestion plus adaptées aux déplacements réels des animaux.
- Estimer la taille des populations par des approches de CMR génétique pour cerner les meilleurs outils de monitoring de la variation de la taille de population et de l'efficacité des mesures de gestion.
- Mieux comprendre le niveau de diversité génétique afin d'évaluer le potentiel adaptatif et le niveau de consanguinité, directement lié aux probabilités de persistance et au pouvoir invasif.
- Identifier le patron des gènes sous sélection en prenant avantage du génome de référence du raton-laveur.
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Supervisor : Stéphanie Manel (CEFE), Sébastien Devillard (LBBE)
Project : Raccoons population genomics in France.
Key words : Invasive species, landscape genetics, landscape genomics, adaptive potential
In this project, we aim to apply landscape genomics approaches on French raccoons (Procyon lotor) populations in order to :
- Understand which landscape features favour landscape functional connectivity and design management strategies in accordance with animal movements
- Estimate population census sizes using genetic capture-mark-recapture to identify the best approach for monitoring and assess the efficiency of management strategies and monitor population
- Better understand the genetic diversity to evaluate the adaptive potential and consanguinity, which are link to persistence and invasiveness of populations
- Identify genes under selection taking advantage of the raccoons reference genome.