Doctorante

Étage 1 - Aile C - Bureau 114

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Google Scholar - ResearchGate - ORCID

Directrice de thèse: Stéphanie Manel (CEFE, EPHE - PSL)
Co-directeur : Fabien Leprieur (MARBEC)

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Projet de thèse : Sur la diversité à travers les échelles d'organisation biologique : un cas d’étude chez les poissons tropicaux

        Les échelles micro- et macro-évolutives sont régies par des forces évolutives similaires (dérive, dispersion et sélection), il est donc attendu que les patrons de diversité intra- et interspécifique soient liés. Ma thèse porte donc sur l'hypothèse d'un continuum de diversité à travers les différentes échelles d'organisation biologique. Plus précisément, j’explore les relations entre la diversité génétique au sein des espèces et la diversité spécifique au sein des communautés (species-genetic diversity correlations, SGDCs) chez les poissons tropicaux, dans le but d’avancer sur la compréhension des processus sous-jacents à la formation des communautés à travers les différents niveaux d’organisation de biodiversité.

De cette problématique générale s’articulent 3 objectifs de recherche :

  I.  Etudier l’impact de la dispersion sur la corrélation entre diversité génétique et diversité spécifique (SGDCs) chez les poissons des récifs coralliens (ANR-FNS REEFISH)
 II.  Explorer le rôle de la délimitation des communautés dans le continuum micro-macro : application à un poisson d’eaux profondes, Etelis coruscans (ANR SEAMOUNTS)
III.  Examiner le potentiel de l’ADN environnemental comme outil d’étude des patrons de diversité à travers les échelles d’organisation biologique

Mots-clés : génétique des populations, écologie des communautés, écologie marine, β-diversité, macrogénétique, ADNe

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Thesis project: On the diversity across scales of biological organization: a case study in tropical fishes

         Micro- and macro-evolutionary scales are governed by similar evolutionary forces (drift, dispersal and selection), so intra- and interspecific diversity patterns are expected to be linked. My thesis therefore addresses the hypothesis of a diversity continuum across different scales of biological organization. More specifically, I explore the relationships between genetic diversity within species and specific diversity within communities (species-genetic diversity correlations, SGDCs) in tropical fish, with the aim of gaining a better understanding of the processes underlying community formation across different levels of biodiversity organization.

From this general problem arise 3 research objectives:

Keywords: population genetics, community ecology, marine ecology, β-diversity, macrogenetics, eDNA

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Publications :

Chase, M. A., Vilcot, M., & Mugal, C. F. (2024). The role of recombination dynamics in shaping signatures of direct and indirect selection across the Ficedula flycatcher genome. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 291(2015), 20232382. https://doi.org/10.1098/rspb.2023.2382

Chase, M. A., Vilcot, M., & Mugal, C. F. (2024). Evidence that genetic drift not adaptation drives fast-Z and large-Z effects in Ficedula flycatchers. Molecular Ecology, n/a(n/a), e17262. https://doi.org/10.1111/mec.17262

Andrello, M., Manel, S., Vilcot, M., Xuereb, A., & D’Aloia, C. C. (2023). Benefits of genetic data for spatial conservation planning in coastal habitats. Cambridge Prisms: Coastal Futures, 1‑38. https://doi.org/10.1017/cft.2023.16

Vilcot, M., Albouy, C., Donati, G. F. A., Claverie, T., Julius, P., Manel, S., Pellissier, L., & Leprieur, F. (2023). Spatial genetic differentiation correlates with species assemblage turnover across tropical reef fish lineages. Global Ecology and Biogeography, 32(4), 535‑547. https://doi.org/10.1111/geb.13637

Morgan-Richards, M., Vilcot, M., & Trewick, S. A. (2021). Lack of assortative mating might explain reduced phenotypic differentiation where two grasshopper species meet. Journal of Evolutionary Biology, 35(4), 509‑519. https://doi.org/10.1111/jeb.13879

Hayden, L., Lochovska, K., Sémon, M., Renaud, S., Delignette-Muller, M.-L., Vilcot, M., Peterkova, R., Hovorakova, M., and Pantalacci, S. (2020). Developmental variability channels mouse molar evolution. ELife. https://doi.org/10.7554/eLife.50103