ORCID : 0009-0007-7489-1722

Directeur de thèse : Thibaud DECAENS

Co-encadré par : Mickaël HEDDE (INRAE Eco & Sols, Montpellier)

Sujet : Analyse de la diversité et des déterminismes des communautés de vers de terre dans les écosystèmes de Guyane

Résumé :

Cette thèse s’attèle à comprendre comment s’organise la diversité actuelle des vers de terre en Guyane, quels sont les facteurs environnementaux et les interactions biotiques influençant les patterns de diversité et quels sont les mécanismes évolutifs aboutissant à ces patterns. Ces questions sont abordées grâce à des approches d’écologie des communautés alliant partitions de diversité, courbes de raréfactions et modèles généralisés, des approches de génétique des populations et des approches macroévolutives et s’organisent autour de quatre axes majeurs :

- Axe 1 : Organisation de la diversité inter-spécifique observée des vers de terre en Guyane et l’estimation de leur diversité régionale

-  Axe 2 : Effets des différents facteurs (biotiques ou abiotiques) qui influencent la richesse spécifique et la diversité bêta aux différentes échelles étudiées

- Axe 3 : Effet des grands fleuves en tant que barrières biogéographiques, des événements répétés de fragmentation forestière lors des alternances glaciaires/interglaciaires du Pléistocène, et des gradients environnementaux à grande échelle sur la diversité intra-spécifique et les patterns phylogéographiques de 11 espèces de vers de terre

- Axe 4 : Test des deux hypothèses évolutives qui permettent de théoriser comment la diversité des différents taxons de cette région a augmenté au cours des années : Théorie du berceau vs théorie du musée

Liste de Publications

Publiées ou acceptées:

Goulpeau, A., Penel, B., Maggia, M.-E., Marchán, D.F., Steinke, D., Hedde, M., Decaëns, T., 2022. OTU Delimitation with Earthworm DNA Barcodes: A Comparison of Methods. Diversity 14, 866. https://doi.org/10.3390/d14100866

Hedde, M., Blight, O., Briones, M.J.I., Bonfanti, J., Brauman, A., Brondani, M., Calderón Sanou, I., Clause, J., Conti, E., Cortet, J., Decaëns, T., Erktan, A., Gérard, S., Goulpeau, A., Iannelli, M., Joimel-Boulanger, S., Jouquet, P., Le Guillarme, N., Marsden, C., Martinez Almoyna, C., Mulder, C., Perrin, W., Pétillon, J., Pey, B., Potapov, A.M., Si-moussi, S., Thuiller, W., Trap, J., Vergnes, A., Zaitsev, A., Capowiez, Y., 2022. A common framework for developing robust soil fauna classifications. Geoderma 426, 116073. https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2022.116073

Decaëns, T., Carolina Bartz, M.L., Feijoo-Martínez†, A., Goulpeau, A., Lapied, E., Marchán, D.F., Maggia, M.-E., Papuga, G., James, S.W., 2024. Earthworms (Oligochaeta, Clitellata) of the Mitaraka range (French Guiana): commented checklist with description of one genus and eighteen species new to science. Zoosystema 46. https://doi.org/10.5252/zoosystema2024v46a9

Goulpeau, A., Hedde, M., Maggia, M.E., Gérard, S., Lapied, E., Decaëns, T. Data on earthworm communities in French Guiana.

Publication soumise ou en préparation :

Goulpeau, A., Hedde, M., Ganault, P., Lapied, E., Maggia, M.E., Marcon, E., Decaëns, T. Dissecting earthworm diversity in tropical rainforests.

Goulpeau, A., Hedde, M., Ganault, P., Lapied, E., Maggia, M.E., Marcon, E., Decaëns, T. Environmental drivers on earthworm alpha and beta diversity in tropical rainforests.

Goulpeau, A., Hedde, M., Maggia, M.E., Marchán, D.F., Decaëns, T. Comparative phylogeography and population genetics of earthworms in neotropical rainforests of French Guiana