Doctorante

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Mots-clés : Organisme biologique : Laccaria amethystina - Milieu : forêts européennes tempérées - Discipline : génétique des populations - Techniques : biologie moléculaire - Thématique : structuration multi-échelles des populations du Basidiomycète ectomycorhizien Laccaria amethystina en Europe - Autres mots-clés : phylogéographie, spéciation

Laccaria amethystina est un champignon Basidiomycète s’associant en symbioses avec de nombreuses essences de forêts tempérées eurasiatiques, conifères ou feuillus. Le genre Laccaria a largement été étudié pour des inoculations contrôlées appliquées à la foresterie, et est considéré comme un modèle de champignon ectomycorhizien, depuis que le génome de L. bicolor a été séquencé en 2006. L. amethystina a été plus étudié en termes de génétique des populations, en Europe et au Japon.

Ces études montrent une diversité génétique locale élevée, mais peu de structuration par la distance sur 500 km. Afin de mieux comprendre les mécanismes structurant les populations de L. amethystina, j’ai choisi d’étendre leur étude au niveau continental européen. A l’aide de marqueurs microsatellites, j’ai décrit les flux géniques et étudié la structuration géographique entre 16 populations européennes de ce champignon. Par une phylogéographie complémentaire, basée sur des séquences codantes et non-codantes, j’ai précisé la variabilité génétique au sein de l’espèce en Europe, et détecté des traces de spéciation cryptique d’une extrémité à l’autre de l’Eurasie.

D’autre part, la forte diversité génétique locale des populations de L. amethystina est encore mal comprise. Dans le but de préciser leur dynamique, j’ai mis en place des suivis pluriannuels des fructifications sur des sites forestiers cévenols. Ces relevés permettent d’étudier finement l’organisation spatiale des génotypes et leur persistance, et d’améliorer la connaissance des stratégies écologiques de l’espèce.

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