Depuis 2024, Assistante ingénieure sur le projet WATERISK, étude des bactéries résistantes aux carbapénèmes dans les compartiments hydriques de Montpellier :

• Echantillonnage d’eau dans 4 lieux de Montpellier (Source du Lez, Verdanson, Station d’épuration MAERA, égout de l’hôpital Lapeyronie). Stockage d’environ 5000 souches bactériennes identifiés au MALDI-TOF
• Etude de la diversité en bactérie résistante aux carbapénèmes entre les 4 lieux.
• Séquençage longread de plus 500 souches via Oxford Nanopore Technologie (Minion, Promethion, multiplexage jusqu’à 96 souches)
• Caractérisation phénotypique de la résistance des mêmes 500 souches :
  • Antibiogramme et CMI (Concentration Minimum Inhibitrice)
  • Etude des plasmides : taux de conjugaison, gamme d’hôtes, stabilité des plasmides
  • Evolution expérimentale

Entre 2021 et 2023 : Ingénieure d’étude en génomique bactérienne.

Etude du rôle potentiel des différences d’usage de code génétique entre espèces bactériennes dans la propagation des résistances aux antibiotiques (travail technique avec un doctorant) :

• Stabilité d’un plasmide : étude de la stabilité des différents plasmides contenant des variants du gène de résistance à la gentamicine. Calcul du taux de perte du plasmide.
• Etude de la quantification du nombre de plasmide par cellule par qPCR.
• Etude de la quantification de l’expression du plasmide par cellule par RT-qPCR.
  • Microbiologie : suivi de croissance, transformation bactérienne, spectrométrie, évolution expérimentale.
  • Biologie moléculaire : extraction ADN/ARN, PCR, qPCR ; RT-qPCR, préparation de librairies pour séquençage Illumina, quantification de l’ADN (Qubit, Nanodrop).
• Etude de la pollution aux microplastiques sur la santé humaine et sur les communautés microbiennes associées (Travail technique avec une post-doc) :
  • Echantillonnage, traitement des échantillons
  • Biologie moléculaire : extraction de l’ADN de biofilm, préparation de librairies pour séquençage Illumina, quantification de l’ADN (Qubit, Nanodrop).
• Etude de l’adaptation de Pseudomonas aeruginosa à 2 stress seuls ou combinés :
  • Mesure de fitness, tests de niche, traitement de données avec R.
  • Evolution expérimentale.
• Etude la dynamique de fixation de l’élément génétique mobile IS10 dans une communauté bactérienne :
  • Biologie moléculaire : design des amorces, PCR, mise au point de la quantification des fragments de PCR par électrophorèse capillaire

2016 - 2019 : Master en Microbiologie, Génome, Environnement et physiologie microbienne, option Bioprocédés Microbiens, Université Clermont Auvergne.

2016 – 2017 : Licence professionnelle en alternance, Microbiologie Industrielle et Biotechnologie, Université Paris Diderot et ESTBA Paris. Alternance au laboratoire de Contrôle Qualité de l’entreprise Dupont – Danisco.

Since 2024, Assistant Engineer on the WATERISK project, studying carbapenem-resistant bacteria in Montpellier's aquatic systems:

• Water sampling at four locations in Montpellier (Source du Lez, Verdanson, MAERA wastewater treatment plant, Lapeyronie Hospital sewer). Storage of approximately 5,000 bacterial strains identified by MALDI-TOF
• Study of the diversity of carbapenem-resistant bacteria between the four locations
• Long-read sequencing of more than 500 strains using Oxford Nanopore Technology (Minion, Promethion, multiplexing up to 96 strains)
• Phenotypic characterization of the resistance of the same 500 strains:
  • Antibiogram and MIC (Minimum Inhibitory Concentration)
  • Study of plasmids: conjugation rate, host range, plasmid stability
  • Experimental evolution

Between 2021 and 2023: Research engineer in bacterial genomics

Study of the potential role of differences in genetic code usage, between bacterial species, in the spread of antibiotic resistance (technical work with a doctoral student):

• Plasmid stability: study of the stability of different plasmids containing variants of the gentamicin resistance gene. Calculation of the plasmid loss rate
• Study of plasmid quantification per cell by qPCR
• Study of plasmid expression quantification per cell by RT-qPCR
  • Microbiology: growth monitoring, bacterial transformation, spectrometry, experimental evolution
  • Molecular biology: DNA/RNA extraction, PCR, qPCR; RT-qPCR, preparation of libraries for Illumina sequencing, DNA quantification (Qubit, Nanodrop)
• Study of microplastic pollution on human health and associated microbial communities (technical work with a post-doc):
  • Sampling, sample processing
  • Molecular biology: biofilm DNA extraction, library preparation for Illumina sequencing, DNA quantification (Qubit, Nanodrop)
• Study of the adaptation of Pseudomonas aeruginosa to two stresses, alone or in combination:
  • Fitness measurement, niche tests, data processing with R.
  • Experimental evolution.
• Study of the dynamics of IS10 mobile genetic element insertion in a bacterial community:
  • Molecular biology: primer design, PCR, development of PCR fragment quantification by capillary electrophoresis

2016 - 2019: Master’s degree in microbiology,gGenome, environment and microbial physiology, with a specialization in microbial Bbioprocesses, Clermont Auvergne University.

 2016–2017: Professional bachelor's degree in industrial microbiology and biotechnology, University of Paris Diderot and ESTBA Paris. Work-study program at the quality control laboratory of Dupont–Danisco.