Maître de conférences (Lecturer), Université de Montpellier

HDR (Habilitée à diriger des recherches)

I work at the interface between population dynamics and conservation biology.  My research encompasses the effects of anthropic factors on population dynamics and their implications for the conservation of biodiversity.  I have mainly worked in the Mediterranean region, focusing on environmental drivers such as climatic change, environmental variability and species introductions to explain ecological and evolutionary dynamics of plant populations.  Recently, I have developed a particular interest in historical ecology by studying ancient human impacts on whale populations. 

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https://www.researchgate.net/profile/Anne_Charpentier

Maître de Conférences à l'Université de Montpellier
Faculté des Sciences, département d'enseignement Biologie Ecologie

&

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5
Tél : +33/0 4 67 61 32 58
Fax : +33/0 4 67 61 33 36

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Mots clés

Discipline :Ecologie

Thématiques : Ecologie évolutive et comportementale, Interactions durables
Organismes biologiques : Oiseaux, Arthropodes
Milieu : Terrestre, Marin
Techniques : Analyse de données, Expérimentation et suivis sur le terrain, Analyses au laboratoire (immunologie), Capture-Marquage-Recapture, Spectrophotométrie
Autres mots clés : Ecologie Urbaine, Sélection sexuelle, Interactions hôte-parasite, Effets maternels,

Senior Lecturer / Directeur d'Etudes de l'EPHE

HDR depuis le 04/09/2013mémoire à télécharger ici

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier 5
France 

Tél. :     +33 (0)4 67 61 32 94
Fax      :+33 (0)4 67 41 21 38

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Keywords:Biostatistics; Conservation biology; Amphibians; Birds, Reptiles, Quantitative ecology; Population Dynamics and Demography, Sampling designs.

Post-doctorante – FRB-CESAB

Postdoc for the DISCAR Synthesis Project.

Research projects:DISCAR Synthesis Project – Olivier Gimenez (CEFE, CNRS) & Sandrine Ruette (OFB).

Contact information

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https://www.fondationbiodiversite.fr/membre/cassie-speakman/

Orcid: https://orcid.org/0000-0002-0023-518X
Bluesky: https://bsky.app/profile/cassiespeakman.bsky.social
Github: https://cassiespeakman.github.io/
Cesab, Institut Bouisson Bertrand, Montpellier

 ClaireDoutrelant

Tenure CNRS research scientist (DR)

CEFE CNRS 1919 Rte de Mende, 34293 Montpellier

Tél : +33/0 4 67 61 32 60 / This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

My research is centered in the theoretical framework of evolutionary ecology, population biology and behavioural ecology. My projects aim at understanding life history variation in order to determine the adaptive and evolutionary processes that explain and maintain animal diversity. I´m particularly interested by three kinds of life history traits linked to behavior: cooperation, animal communication and maternal invesment. I'm mainly using birds as biological models. I'm mainly using empirical methods, including large-scale experiments and analyses of long-term data sets on different populations of passerine birds in the field.

I'm currently working on four main projects. 1) Evolution of colour ormentation in birds(with a special focus on female coloration and blue tits) 2) the cause and life history traits consequences of cooperation in sociable weavers ; 3) Sexual and social evolution on islands, and 4) the evolution of weaver nests.

I'm also part of  the Arts-Sciences project Obô and the association https://plumesetracines.net/

1 - Evolution of ornementation in birds

 Photos: Claire Doutrelant

Team: Arnaud GREGOIRE(Lecturer, Univ Montpellier), Amélie FARGEVIEILLE (post Doc), David LóPEZ-IDIáQUEZ (Post doc), Lisa SANDMEYER (PhD Student)

Collaborations: Anne CHARMANTIER(CEFE),  Denis REALE(UQUAM, Canada), Céline TEPLITSKY(CEFE), Doris GOMEZ(CEFE),   Julien RENOULT (CEFE),  RIta COVAS(CIBIO Portugal, FizPatrick Institute SA); Maria DEL REY (spectrophotometric measurements), Christophe de FRANCESCHI(field work and data base management), Samuel PERRET(Field work and Patch measurements), Annick LUCAS(Field work and Patch measurements), Pablo GIOVANNINI(Field work)

* Evolution of female colour ornementation

In this project we use a combination of empirical and comparative approaches to address three fundamental questions on sexual and social selection in both monomorphic species and dimorphic species in which females present conspicuous traits. Our questions are the following (i) Are female conspicuous traits under sexual /social selection ? (ii) Do female conspicuous traits reflect female quality and which mechanisms maintain signal honesty? (iii) What are the population consequences of female signalling and mutual sexual selection.

Examples of publications (full list below)

Fargevieille, A., Grégoire, A., Gomez, D. & Doutrelant, C. 2023Evolution of female color in birds: the role of paternal care and female reproductive costs.Journal of evolutionary ecology. 36(3), 579-588

Doutrelant, C., Fargevieille, A., Grégoire, A.  2020.Evolution of female coloration: what have we learned from birds in general and blue tits in particular. Adv. Study in Behaviour PDF

 Photo Claire Doutrelant

 * Evolution of plumage ornement in space and time

Selection often varies in space and time and long-term research that spans broad spatial scales is needed to understand the factors driving phenotypic variation and to assess the links between traits and fitness.  To assess the importance of spatiotemporal variation  and its consequences on selection estimates, we collected data on two study systems: (i) the blue tit (yellow and UV-blue colorationsmeasured by spectrophotometry since 2005, 600 birds measured each year); (ii) the  size of the sociable weaver melanin patch  since 2010 (the bib patch is photographied each year on 400 individuals)

Examples of publications (full list below)

 Lopez-Idiaquez, D.; Teplitsky, C.; Grégoire, A.; Fargevieille, F.; del Rey, M.; de Franceschi, C.; Charmantier, A.; Doutrelant, C. 2022. Long-term decrease in colouration: a consequence of climate change? American Naturalist https://doi.org/10.1086/719655   

Dominance interaction -  Photo Franck Théron

2 -Evolution and consequences of cooperation

 *TEAM: Co Pi: Rita COVAS(http://www.fitzpatrick.uct.ac.za/fitz/staff/research/covas; CIBIO, Portugal), André FERREIRA (Univ. Zurich), Franck THERON (data base managmer and field), Liliana SILVA (video manager and machine Learning methods) Jorge Garcia Campa (Post doc),  Gabriel Munar(Post doc), Babette FOURIE (PhD Student), Nicolas  SILVA(PhD Student), Marta MARMELO (PhD Student); , Fanny RYBAK(Univ Orsay, FR),

*Collaboration:  Matthieu PAQUET(Swenden), François CRISCUOLO& Sandrine ZAHN(Univ Strasbourg, FR),  Julien Renoult(CEFE, FR)

           Website: https://sociableweaverproject.com/

The project aims at understanding the fitness bases of cooperation and the consequences of cooperation for population dynamics through its effects on reproductive output, survival and dispersal. Our study model is an endemic passerine bird from southern African passerine. This bird is a cooperative breeder. In cooperatively breeding species, mature individuals called ‘helpers’ assist the breeding pairs by bringing additional food to the nest. We work on the evolution of different cooperative behaviours – cooperative breeding, nest building and predator mobbing and on the relationship between cooperation, fitness, dispersal and long-term population dynamics.

Currently our project has two main aims: (i) determining whether sexual or social selection play a role in the evolution of cooperation and thus the role of partner choice ; (ii) determining  how presence / absence of co-operators affects maternal effects and parental investments

This project is suppported by the PercyFizpatric Institute of the University of Cape Town & the INEE - CNRS: Long-term Studies in Ecology and Evolution (SEE-Life)

http://www.fitzpatrick.uct.ac.za/fitz/research/programmes/longterm/sociableweaver

Examples of publications (full list below)

D'Amelio, P.; Ferreira, A.; Fortuna, R.; Paquet, M.; Silva, L. ; Theron, F.; Doutrelant, C.; Covas, R. 2022. Disentangling climatic and nest predator impact on reproductive output reveals adverse high temperature effects regardless of helper number in an arid-region cooperative bird Ecology Letter25(1), 151-162

Covas, R., Lardy, S.; Silva, L.; Rey, B.; Ferreira, A. C.; Théron, F.; Tognetti, A.; Faivre, B. Doutrelant, C. 2022.The oxidative cost of helping and its minimisation in a cooperative breeder Behavioural Ecology33(3), 504-517

Ferreira, A., Silva, L., Renna, F., Brandl, H. B., Renoult, J., Farine, D., Covas, R. & Doutelant, C.  2020 Deep learning based methods for individual recognition in small birds. Method in Ecol Evol PDF

Covas, R. & Doutrelant, C.* 2019. Testing the sexual and social benefits of cooperation in animals. Trends Ecol Evol In press. *Both authors contributed equally to the manuscript PDF

Photos: Claire Doutrelant

  3- Evolution on islands

TEAM:  Rita Covas (CIBIO, Portugal), FitzPatrick Institute, Univ Cape Town), Martim Melo(CIBIO),  Claire Loiseau ( Univ Montpellier), Ana Leitao (Post doc ); Raquel Ponti (Post doc)

             Website: https://islandbirdproject.com/

Islands are unique ecosystems sharing a distinctive set of characteristics that make them particularly interesting to study adaptation by organisms. The isolation and reduced area of islands result in simplified ecological ecosystems and an impoverished fauna that are expected to lead to convergent patterns of adaptation (the ‘insularity syndrome’). Our aim is to establish, using comparative work , whether island birds worldwide display such convergent shift for ornamentation, songs, behaviour and morphology. Then we aim at determining which factors lead to those changes and are particularly interested by the role of parasitism and interspecific competition. We worked on data collected in natural history museum and in the field (Sao Tome, Madeira, Gabon, Cameroun).

Examples of publications (full list below)

Ponti, R., Doutrelant, C., & Covas, R. (2023). Strength of the ‘island rule’in birds is positively associated with absence of avian predators.Biology Letters, 19(3), 20220536

Barthe, M., Doutrelant, C., Covas, R., Melo, M., Illera, J. C., Tilak, M. K.,... & Nabholz, B. (2022). Evolution of immune genes in island birds: reduction in population sizes can explain island syndrome. Peer Community Journal, 2.

Robert, A., Melo, M., Lengagne, T.,. Julien, S..& Doutrelant, C. 2021Patterns of bird song evolution on islands support the character release hypothesis in tropical but not in temperate latitudes. Journal of Evolutionary Biology34(10), 1580-1591

Bliard, L., Robert, A. Paquet, M, Renoult, J., Grégoire, A., Crochet, P.A. Covas, R & Doutrelant, C. 2020 Examining the link between relaxed predation and bird colouration on islands.  Biol Lett PDF

Robert, A., Lengagne, T., Melo, M., Julien, S.., Gardette, V. Covas, R. & Doutrelant, C.2019. The Theory of Island Biogeography and Soundscapes: species diversity and the organization of acoustic communities. J. Biogeography PDF

Doutrelant, C.,Paquet,Renoult, J. M. Grégoire, A., Crochet, P.A. Covas, R. 2016 Worldwide patterns of bird colouration on islands. Ecology Letter  19: 537–545 PDF

 Photos: Claire Doutrelant & Martim Melo
 

 4 - Weaver nest as an extended phenotype

Team : Rita Covas (CIBIO, Portugal), FitzPatrick Institute, Univ Cape Town), Julien Renoult (CEFE), Erwan Harscouet(phD CEFE),  Dieter Oschadleus(Univ. Cape Town) , Staffan Andersson(Univ.  Gothenburg), Fanny Rybak(Univ. Paris Sud)

 We investigate the role of sexual selection on the evolution and diversification of i) nest weaving (the extended phenotype) and on colours, songs, and flight displays.

5-Long term monitoring of blue tit (worked initiated by Jacques Blondel in 1976)

Researchers: Jacques Blondel, Samuel Caro,Anne Charmantier, Claire Doutrelant,,Christophe de Francheschi,  Pablo Giovannini, Arnaud Grégoire, Marcel Lambrechts, Annick Lucas, Samuel Perret,  Philippe Perret,Denis Réale(Canada),Céline Teplltsky

This program  is supported but the INEE - CNRS: Long-term Studies in Ecology and  Evolution (SEE-Life)

https://data.oreme.org/tit/home   & https://oreme.org/observation/ecopop/mesanges/

https://mesangecefe1.wixsite.com/mesangecefe

Photos Claire Doutrelant

 6 - Obô, an art science projet

An art science project with Claire Loiseau, Martim Melo, Hélène Fromen & Maya Cylarem

Project funded by European comission - Biopolis with the help of the CNRS, CEFE. A first sponsor: Ornithomedia

Posted by Maya Cyclarem & Ayline Le Sourd

website: https://plumesetracines.net/

7- Short CV

8 - Publications

update list: https://scholar.google.fr/citations?hl=fr&user=Fap-wf0AAAAJ

Do not hesitate to ask for reprint !

9 - Funding

Investigatrice principale (PI)

* 2020-2024        ANR Extended phenotype.The evolution of extended phenotypes and associated signals in animals: weaverbirds’ nests and sexual selection as a case study?  With R Covas (CIBIO, Univ Porto, F Rybak (Univ Paris Sud), Julien Renoult

* 2018-2019        CEMEB Montpellier Explanatory Research Project Relaxed selection at immunity genes in insular populations ? A test using a population genomics approach With B Naboltz R Covas, M Melo, C. Loiseau

* 2018- ..             OSU OREME Suivi de la phénologie de reproduction du Républicain Social.

* 2015-2019       ANR défis de tous les savoir Can cooperation be under social or sexual selection?  With R Covas (CIBIO, Univ Porto, B Faivre (Univ Dijon), F Rybak (Univ Paris Sud)

* 2016-2018                 PEPS CNRS INEE Paysage Rôle de la compétition interspécifique dans la structuration des paysages acoustiques .  With A Robert (Phd), M Melo (Univ Porto), T Lengagne (CNRS, Lyon).

* 2012-2015         Bourse chercheur d'avenir Région Languedoc Roussillon Sélection sexuelle femelle chez les oiseaux : réalité, origine et conséquences populationnelles - With Arnaud Grégoire, Doris Gomez, Anne Charmantier

*2009-2013         ANR JCJCSélection sexuelle, sociale et évolution des ornements femelles. WithArnaud Grégoire, Doris Gomez, Anne Charmantier, B. Doligez

Co Pi

* 2020-2025        ERC Consolidator COOPERATIVE PARTNER. Pi R Covas

* 2016-2018         Portuguese Science and Technology Foundation (FCT)- Direct benefits of cooperation.PI Rita Covas

*2013-2016         Programme Européen Marie Curie-IRSES Cooperation. Pi Rita Covas. coPI C. Doutrelant, B. Hatchwell,

*2013-2015         FCT + National geographic:Parasite pressure, immunity and sexual ornaments in island and mainland birds.

* 2010-2013         FCT Maternal effects and cooperation Pi Rita Covas,

* 2010- ..             OSU OREME. Suivi de la phénologie de reproduction de la mésange bleue. co Pi A. Charmantier C. Doutrelant, A. Grégoire, M. Lambrechts, C. Téplitsky

*2008 – …         Centre of Excellence FitzPatrick Institute (Af du Sud): Cooperative breeding in sociable weavers Co Pi Rita Covas C. Doutrelant

 I'm always looking for motivated students and post doc to build / work on project! Do not hesitate to contact me with a CV to share your interest!

Directeur d'Etudes EPHE-PSL

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34293 Montpellier cedex 5

Tel. : +33(0)4 67 61 33 43

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My research is in the field of evolutionary ecology, often with a conservation point of view. I study variation among populations (mostly amphibians) along gradients (altitude, pollutants), to identify eg local adaptations in life history traits. More recently, I developped research in epidemiology to understand the dynamics of diseases affecting amphibian populations. Finally, I continue some eco-ethological studies mainly with amphibian dispersal by direct (eg radiotracking) and indirect (eg genetic markers) methods.

Post-doc researcher

 
I am a quantitative ecologist studying how global change influences the spatio-temporal dynamics of species and communities. My work in conservation biology bridges field practitioners, stakeholders, and biostatisticians, with a focus on developing statistical models to evaluate anthropogenic impacts on biodiversity and explore mitigation strategies. Utilizing diverse modeling approaches (including capture-recapture, trend analysis, species distribution models, and flight height models, etc) I build integrated models that that make the most of existing data and inform improvements in sampling methodologies.

Research projects:Migralion (Aurélien Besnard)

Contact information

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Orcid: https://orcid.org/0000-0001-7638-597X
Researchgate: https://www.researchgate.net/profile/Coline-Canonne
CEFE, 2ème étage aile C, bureau 202

Notre équipe travaille sur les interactions entre humains et animaux selon une approche interdisciplinaire qui tient explicitement compte de leurs caractéristiques biologiques, comportementales, sociales et culturelles. Nous nous intéressons en particuliers aux questions de gestion de la faune sauvage et des animaux domestiques en interaction avec les activités humaines. Nous évoluons le long d’un gradient qui va de la conception et de la mise en place de protocoles d’échantillonnage, l’étude de la dynamique et de la distribution des populations, l'étude des savoirs écologiques, des perceptions et des pratiques des acteurs impliqués dans la gestion, jusqu’aux recommandations de gestion et la contribution aux processus de prise de décision et d’élaboration ou d’évaluation de politiques publiques de gestion et de conservation de la nature.

Afin d’étudier la dynamique des populations sauvages nous développons des méthodes et outils statistiques. La plupart de nos travaux s’inscrivent en biologie et géographie de la conservation. Ceux-ci cherchent à développer des interfaces entre spécialistes en statistiques et gestionnaires d’aires protégées ou conservationnistes pour mieux étudier l’évolution des paramètres démographiques et populationnels des espèces et ainsi définir des politiques de protection, de prélèvement et de gestion plus adaptées.

Nos travaux mobilisent également des approches et méthodes sociologiques, ethnologiques et de géographie humaine afin de mieux comprendre les relations entre humains et animaux. Nous étudions les savoirs écologiques et éthologiques des populations locales et les rétroactions entre dynamiques de population, écologie spatiale et géographie animale selon les perceptions et pratiques des chasseurs, éleveurs, bergers, agriculteurs, gestionnaires d’aires protégées et environnementalistes.

A partir de l’analyse des controverses sociopolitiques ou dans le cadre de projets de recherche-action relatifs à la gestion de populations gibiers, des dégâts liés au gibier ou aux grands prédateurs, de populations d’espèces menacées, nous explorons dans différents contextes socio-écologiques, comment l’écologie et les comportements des animaux domestiques et sauvages façonnent les relations des humains avec ces animaux et les réseaux de relations complexes et dynamiques entre acteurs humains ; et comment en retour ces relations façonnent l’écologie et les comportements animaux dans le temps et l’espace.

Notre équipe a ainsi une activité fortement interdisciplinaire, croisant l’écologie, la géographie, l’ethnologie, la statistique et la modélisation mathématique et multi-agents spatialisée ou non. Nous réalisons une approche critique de nos approches interdisciplinaires et conduisons une réflexion spécifique de longue haleine sur l’interface science/gestion et l’efficacité des politiques publiques. Nous nous impliquons dans de nombreuses missions de conseil scientifiques auprès des services de l’Etat, des gestionnaires d’aires protégées, des organismes locaux, régionaux et internationaux en liens avec la gestion, l’exploitation et la conservation de la faune sauvage. Nous enseignons dans des masters et spécialisations de plusieurs Grandes Ecoles et Universités, en France principalement. Enfin, nous organisons régulièrement des formations spécifiques pour le milieu socio-professionnel des gestionnaires de la nature, les étudiants et les chercheurs.

Nous entretenons de solides partenariats de long terme avec des acteurs publics (OFB, ex. AFB et ONCFS, Parcs Nationaux), para-publics (CBN, ONF, Réserves naturelles de France, Fédération des Parcs naturels régionaux) et privés (bureaux d’étude, zoos, associations). Partant du constat que nos doctorant.e.s et post-doctorant.e.s ne trouveront pas tou.te.s un poste académique, nous entretenons des liens étroits avec le milieu non-académique dans le souci de leur intégration professionnelle.

Les trois axes qui structurent l’équipe sont :

Axe 1 : gestion des populations animales exploitées

Modèles d’étude : ongulés (sangliers) et oiseaux.

Partenariat fort avec OFB (ex. ONCFS/AFB) et Fédérations départementales de chasseurs   

Axe 2 : gestion des populations de grands mammifères

Grands carnivores (ours, loup, lynx) et cétacés (grands dauphins)

Partenariat avec fort ONCFS, FDC, associations

Axe 3 : formation

Outre l’enseignement académique classique dans lequel nous sommes investis, notre équipe a une activité conséquente dans la formation sous forme d’ateliers pour l’OFB, les bureaux d’étude, la formation continue et les collègues universitaires. Ces formations ont clairement une forte composante de transfert soit des méthodes de modélisation mathématique et d’analyses statistiques de données de sciences écologiques ou humaines, soit des méthodes d’intégration des sciences humaines et sociales avec l’écologie dans des dispositifs interdisciplinaires de recherche ou de recherche-action dans le contexte des interactions humains/animaux ou aires protégées/non protégées.

Chargée de recherche (CR1) 

Responsable de l’équipe BIOFLUX

Campus du CNRS

1919, route de Mende
34293 Montpellier 5
tel:+33 (0)4 67 61 32 43
fax:+33 (0)4 67 41 33 36

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Mots clés : 

Macroinvertébrés du sol, Diversité, Rôle fonctionnel (Structuration des sols, Décomposition des litières), Perturbations anthropiques et changements globaux, Traits biologiques, écologiques et fonctionnels

John D. Thompson

Directeur de recherches, première classe

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Programme de recherche

Depuis le début ma carrière de scientifique à Montpellier en 1989 mes recherches se placent toujours dans le cadre historique, bio-géographique et paysager particulièrement fascinant de la région Méditerranéenne et se focalisent sur l’écologie, l’évolution et la conservation de la flore.

Dans cette région les changements historiques et contemporains pourraient avoir des conséquences profondes aussi bien pour la dynamique et la viabilité des populations et des communautés, que pour la capacité de réponse évolutive rapide des espèces, aspect scientifique trop souvent négligé. n élément clé dans mes recherches concerne mon investissement dans une recherche qui s'articule autour de collaborations interdisciplinaires très étroites (sciences humaines) et l'animation d'une interface fonctionnelle entre problématique scientifique et enjeux de conservation.

Ces recherches s’articulent autour des thèmes suivants :

• L’application de notre connaissance sur l’évolution de la flore à la conservation conservation du potentiel évolutif.
• L’ évaluation de l’état de conservation des populations d’espèces rares, endémique où en limite d’aire.
• La connaissance de la niche fine des espèces en tant que connaissance fondamentale pour la gestion de la flore.
• L’analyse des interfaces entre connaissances écologique, perceptions culturelles et savoirs-faire locaux (notamment pour la cueillette) dans la conservation de la flore.

Actuellement je mène des recherches dans le cadre du programme « Transitions écologiques et flore protégée : la gestion conservatoire à l’échelle de la niche (TRANECOL) financé par l’OFB et le CEMEB. Ce programme a pour but d’analyser la variabilité de la niche des espèces végétales protégées en situations de transitions écologiques où le fonctionnement des milieux est particulièrement contrasté en région méditerranéenne: en l’occurence la mosaïque de milieux côtiers où la micro-topographie et la salinité varie de manière très forte sur des espaces très restraints, les gradients d’altitude en arrière pays et sur les écotones entre grands types de substrat. L’objectif ici est d’informer les stratégies et actions des gestionnaires sur l’importance d’identifier la niche écologique des espèces à l’échelle très fine du fonctionnement des individus en milieu hétérogène.

Notre travail se fait en étroite collaboration avec les gestionnaires dans trois contextes :

• le territoire du Parc National du Mercantour,
• la Réserve Naturelle Régionale de Sainte Lucie et d’autres sites sur le territoire du Parc Naturel Régional de la Narbonnaise en Méditerranée,
• le site Natura 2000 de la Grande Maïre à Portiragnes dont la gestion est attribuée à la Communauté d’Agglomération Hérault Méditerranée et d’autres espaces de près salés sur le pourtour Méditerranéen.

Plant Evolution in the Mediterranean

My first book - Plant Evolution in the Mediterranean - was published in 2005. It provided the first synthetic account of the majors processes of evolution in the Mediterranean flora in relation to the history and ecology of the region. It analyzed patterns of species’ distributions and traits in the evolution of the remarkable diversity and degree of endemism that characterize the Mediterranean flora.

Ever since 2005 here has been an immense amount of new and fascinating work on the history, ecology, and evolution of the Mediterranean flora. During this time, human impacts have continued to increase dramatically, significantly influencing both the ecology and evolution of the region’s biota.

My second book, Plant Evolution in the Mediterranean - Insights for conservation, published in 2020 represents a comprehensive update on these issues.

This is not a traditional book on plant evolution, but rather a novel integration of a diverse and scattered literature to produce a synthetic account of Mediterranean plant evolutionary ecology that maintains the accessible style of the previous version but in a new structural framework. History, ecology, biogeography, and evolution are all set in the context of a dramatically increasing footprint. I argue how an understanding of the evolutionary ecology of the region’s flora can be used to provide insights into its conservation and management.

Conseils scientifiques

Sur le thème de la protection de la nature en région Méditerranéenne et ces montagnes, j’ai établi les liens très forts avec les gestionnaires de sites et d’aires protégées. Cet engagement se concrétise par mon rôle en tant que président de deux conseils scientifiques et membre de deux autres.

• Président

Conseil scientifique du Parc National du Mercantour

Conseil scientifique du Parc Naturel Régional de la Narbonnaise en Méditerranée

• Membre

Conseil scientifique du Conservatoire Botanique National Méditerranéen

Conseil scientifique du Parc National des Calanques

A lire

Raevel, V., Munoz, F., Pons, V., Renaux, A., Martin, A. & Thompson, J.D. 2013. Changing assembly processes during a primary succession of plant communities on Mediterranean roadcuts. Journal of Plant Ecology, 6, 19-28.

Thompson, J. D., Charpentier, A., Bouguet, G., Charmasson, F., Roset, S., Buatois, B., Vernet, P. & Gouyon, P.-H. 2013. Evolution of a genetic polymorphism with climate change in a Mediterranean landscape. Proceedings of the National Academy of Science (USA), 110, 2893-2897.

Gauthier, P., Foulon, Y., Jupille, O. & Thompson, J.D. 2013. Quantifying vulnerability to assess priorities for conservation management. Biological Conservation,158, 321-325.

Berjano R., Gauthier P., Fisogni A., Doblas, D., Pons V. & Thompson J.D. 2013. Mate limitation in populations of the endangered Convolvulus lineatus L.: a case for genetic rescue ? Journal for Nature Conservation, 21, 334-341.

Schatz, B. Gauthier, P. Debussche, M. & Thompson, J.D. 2014. A decision tool for listing species for protection on different geographic scales and administrative levels. Journal for Nature Conservation, 22, 75-83

Borie, M., Mathevet, R., Letourneau, A., Ring, I., Thompson^,J.D. & Marty, P. 2014. Exploring the contribution of fiscal transfers to protected area policy. Ecology and Society, 19(1): 9. http://dx.doi.org/10.5751/ES-05716-190109

Mathevet, R., Thompson, J.D., Folke, C. & Chapin III, F.S. 2016 Protected areas and their surrounding territory: socio-ecological systems in the context of ecological solidarity. Ecological Applications, 26, 5-16.

Pironon, S. Papuga, G., Villellas, J., Angert, A.L., García, M.B. & Thompson, J.D. 2017. Geographic variation in genetic and demographic performance: new insights from the analysis of an old biogeographical paradigm. Biological Reviews, 92, 1877-1909.

Bigard, C., Pioch, S. & Thompson, J.D. 2017. The inclusion of biodiversity in impact assessment for urban development projects: policy-related progress limited by gaps and blurred by semantic confusion. Journal of Environmental Management, 200, 35-45.

Vimal, R., Fonderflick, J., Thompson, J.D., Pluvinet, P., Debussche, M., Cheylan, M., Géniez, P., Mathevet, R., Acquarone, A., & Lepart, J. 2018. Integrating habitat diversity into species conservation in the Mediterranean mosaic landscape. Basic and Applied Ecology, 22, 36–43. 

Thompson, J.D., Gauthier, P., Papuga, G., Pons, V., Debussche, M. & Farris, E. 2018. The conservation significance of natural hybridisation in Mediterranean plants: from a case study on Cyclamen (Primulaceae) to a general perspective. Plant Biology, 20 (Suppl. 1), 128-138.

Papuga, G. Gauthier, P., Pons, V., Farris, E. & Thompson, J.D. 2018. Eological niche differentiation in peripheral populations: a comparative analysis of eleven Mediterranean plant species, Ecography, 41, 1-15.

Thompson, J.D., Amiot, J., Borron, C., Linhart, Y.B., Keefover-Ring, K. & Gauthier, P. 2019. Spatial heterogeneity of gall formation in relation to chemotype distribution in Thymus vulgaris.Plant

Gauthier, P., Bernard, C. & Thompson, J.D. 2019. Assessing landscape vulnerability for populations of listed Mediterranean plants. Journal for Nature Conservation,51, Article 125736.

Gauthier, P., Pons, V., Fisogni, A., Murru, V., Berjano, R., Dessena, S. Maccioni, A., Chelo, C., Doncieux., A., Papuga, G. & Thompson, J.D. 2019. Monitoring population dynamics in rare and endangered Mediterranean plants. Journal for Nature Conservation,52, Article 125758.

Bigard, C., Thiriet, P., Pioch, S. & Thompson, J.D. 2020. Strategic landscape-scale planning to improve mitigation hierarchy implementation: an empirical case study in Mediterranean France. Land-Use Policy, 90, Article 104286.

Thompson, J.D. & Mathevet, R. 2017. Solidarité écologique. Espaces Naturels, 58, 13.

A regarder

Fleurs sauvages de la Méditerranée, « Sous le soleil ». ARTE 2019 https://www.arte.tv/fr/videos/069769-001-A/les-secrets-des-fleurs-sauvages-sous-le-soleil/

PhD student – University of Montpellier

I’m a PhD student interested in animal behaviour and cognition, and how they translate into the spatial and demographic dynamics of populations. During my PhD, I focus on the interplay between individual movements and the dynamics of population networks through two case studies: 1) migratory connectivity and its relationship with the demography of migratory populations; 2) informed dispersal and its implications for the structuring and the stability of larid colonies. Linking individual and population-level processes leads me to draw on methods from both behavioural ecology and population biology.

Supervisors: Pierre-André CROCHET (DR, CNRS), Aurélien BESNARD (DE, EPHE).

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Orcid: https://orcid.org/0000-0002-0316-5041
CEFE, 2ème étage aile C, bureau 202A

PhD candidate – EPHE, IMBE, CEN PACA

Long-lived predatory birds ecology, demography and movement.

I am interested in the population dynamics of long-lived (seabirds and raptors). I study how demography and behavioural mechanisms such as movement are influenced by inter- and intraspecific relationships and the environment (climate, weather, habitat). The aim of my PhD thesis is to investigate the relationship between individual movement and demographic variability in the French population of the Bonelli's eagle (Aquila fasciata).

Supervisors: Aurélien Besnard (DE, EPHE) & Alexandre Millon (MCF, HDR, IMBE).
Co-supervised by Cécile Ponchon (CEN PACA).

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Orcid: https://orcid.org/0000-0002-1382-213X
Twitter / X: https://twitter.com/LiseViollat

CEFE, bureau 202 (2^e etage)

Chargée de recherche CNRS

CEFE/CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5, France
Tél : +33/0 4 67 61 xx xx

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Google scholar : https://scholar.google.com/citations?user=yyjumocAAAAJ&hl=fr

Orcid : https://orcid.org/0000-0002-6715-9898

PhD candidate – Université de Montpellier

Doctorante en écologie statistique, j’étudie l’apport des méthodes de suivi non-invasif, de l’intégration de données et de la modélisation statistique à la compréhension de l’écologie des populations de carnivores en France. Je travaille en particulier sur les questions de connectivité.

I’m a PhD student in statistical ecology. I study the contribution of non-invasive monitoring, data integration and statistical modelling to study the ecology of carnivore populations in France. I work in particular on connectivity issues.

Supervisor: Olivier Gimenez (CEFE-CNRS)
Co-supervisor: Cyril Milleret (NMBU, University of Life Sciences, Ås, Norway)

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Twitter / X: @MaelisKervellec
Bureau 202, 2ème étage aile C

Directeur de recherche au CNRS

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5

Tél : +33/0 4 67 61 33 10
Fax : +33/0 4 67 61 33 36
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Mots clés

Discipline : Ecologie évolutive, Ecologie comportementale, Ecophysiologie
Thématiques : Biologie des populations, Traits d’histoire de vie, Changements environnementaux, Hétérogénéité de l’habitat
Organismes biologiques : Aves, Parus (Mésanges)
Milieux : Région méditerranéenne, Milieux forestiers
Techniques :  Suivi d’individus marqués dans le cadre d’un programme à long terme
Autres mots clés : Interactions entre espèces, Ressources, Climat

Researcher CNRS

" Movement, Abundance, Distribution" (MAD) Team Leader

CEFE

1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5
Tél : +33/0 4 67 61 33 02

Office 311, 3rd floor

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PhD candidate – Université de Montpellier

I’m a PhD student interested in evolutionary demography and population dynamics of wild populations. I’m currently working on the demography of Svalbard polar bears. I’m relying on 30+ years of data including mark-recapture data, tracking data, and more. I’m mainly using linear models, mark-recapture models and path analysis models in a Bayesian framework to study the determinants of reproductive output, trade-offs between traits, and such.

Supervisors: Sarah Cubaynes (EPHE, CEFE-CNRS), Jon Aars (Norwegian Polar Institute)

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Orcid: 0000-0003-1489-9363
GitHub: MarwanNaciri

Directeur de Recherche / Senior scientist

I study the evolution of adaptive diversity, using colour patterns in butterflies as a model. In my group, we integrate many different approaches, including ecology, genetics, and modelling, to try and untangle how multiple factors influence the evolution and maintenance of diversity and polymorphisms.

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Directeur de Recherche (DR2)

CNRS Researcher 

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5

Tél : +33 (0)4 67 61 32 89
Fax : +33 (0)4 67 61 33 36

xavier dot morin @ cefe dot cnrs dot fr

HDR : Impact des changements globaux sur la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes forestiers - soutenue le 11/2/2021
Lien : HDR Xavier Morin

Thèmes de recherche

(English follows)

Mes travaux cherchent à parvenir à une meilleure compréhension du déterminisme de la diversité végétale aux différentes échelles spatiales et temporelles, sa réponse aux changements futurs, et son rôle dans le fonctionnement des écosystèmes forestiers. En particulier, je cherche donc à comprendre et prédire comment la biodiversité des écosystèmes forestiers s’organise selon différentes échelles spatiales, comment elle sera modifiée par les changements globaux, et quelles en seront les conséquences sur le fonctionnement de ces écosystèmes. Pour ce faire j’essaie de développer une approche intégratrice basée sur les processus. Mes travaux se focalisent principalement sur les espèces d'arbres et arbustes. Pour mener à bien ces objectifs, j’utilise aussi bien des résultats issus d’expérimentation, d’observations le long de gradients écologiques in situ, et de modélisation.