Directrice de recherche (DRCE)

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier 5

E-mail : anne.charmantier[at]cefe.cnrs.fr

Thèmes de recherche: Evolution et génétique quantitative dans les populations naturelles; sénescence; sélection sexuelle.

Maître de conférences (Lecturer), Université de Montpellier

HDR (Habilitée à diriger des recherches)

I work at the interface between population dynamics and conservation biology.  My research encompasses the effects of anthropic factors on population dynamics and their implications for the conservation of biodiversity.  I have mainly worked in the Mediterranean region, focusing on environmental drivers such as climatic change, environmental variability and species introductions to explain ecological and evolutionary dynamics of plant populations.  Recently, I have developed a particular interest in historical ecology by studying ancient human impacts on whale populations. 

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https://www.researchgate.net/profile/Anne_Charpentier

Senior Lecturer / Directeur d'Etudes de l'EPHE

HDR depuis le 04/09/2013mémoire à télécharger ici

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier 5
France 

Tél. :     +33 (0)4 67 61 32 94
Fax      :+33 (0)4 67 41 21 38

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Keywords:Biostatistics; Conservation biology; Amphibians; Birds, Reptiles, Quantitative ecology; Population Dynamics and Demography, Sampling designs.

 

Doctorant EPHE-PSL / SPYGEN

PhD advisors : Stéphanie Manel (CEFE, EPHE - PSL)
Co-supervisor : Erwan Delrieu-Trottin (CEFE, EPHE - PSL)
Co-supervisor: Alice Valentini (SPYGEN)

ORCID – ResearchGate – Google Scholar 

Contact: bastien.mace[a]cefe.cnrs.fr

Ingénieur d'Etude CNRS Responsable du plateau technique d' Electrophysiologie de la Plateforme d’Analyses Chimiques en Ecologie (PACE) CEFE UMR5175 Campus du CNRS 1919, route de Mende F-34293 Montpellier cedex 5 France Tél : +33 (0) 4 67 61 32 32 Courriel : This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. Orcid ID 0009-0001-3913-0019 2e Etage Aile C bureau 205

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Thématique de recherche

Etude de la communication chimique dans les interactions intra- et inter- spécifiques impliquant des arthropodes.

Mes domaines d'expertise sont : l'Ecologie Chimique, l'Electrophysiologie et l'Ecologie Comportementale.   

 

Mots clés : 

Ecologie Chimique ; Electrophysiologie ; Ecologie Comportementale ; Arthropodes ; Communication Chimique ; Olfaction.

 

Activités de recherche

Je mets en œuvre et adapte des techniques biologiques et des protocoles expérimentaux en Ecologie Chimique dans le but d'analyser l'écologie des interactions impliquant des arthropodes, dans le cadre de différents projets de recherches mené au sein de l’équipe. Elle s'étend de mesure in natura, au choix des protocoles expérimentaux, à l'analyse d'échantillons par des techniques biologiques au laboratoire et à l'élevage des arthropodes, incluant tests comportementaux, études morphologiques et analyses des molécules impliquées. Mon domaine d’expertise principal est l’électrophysiologie. Je visualise la détection de composés organiques volatils (COVs) par les arthropodes en utilisant le dispositif expérimental de chromatographie en phase gazeuse couplé à l’électro-antennographie. Cet outil permet de détecter une réponse électrique des organes sensoriels olfactifs, lors de l’exposition à des COVs. J’identifie ces composés par la technique de chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse. Ces analyses nous permettent de déterminer parmi les COVs émis, ceux qui sont perçus par les arthropodes étudiés. Complétés par des analyses comportementales, pour déterminer le type d’affinité vis-à-vis de ces composés. Je réalise également, des mesures de facteurs abiotiques et des colectes de COVs, en laboratoire et sur le terrain.

 

 

Publications

Full list : https://www.researchgate.net/profile/Benoit-Lapeyre/research

Gimonneau G, Buatois B, Lapeyre B, Salou-Wendemanegde E, Sanon N, Ranaivoarisoa A, Roux O, Dormont L, 2024. Identification of semiochemical candidates involved in Glossina palpalis gambiensis larviposition site selection and behavioural responses of adult gravid females. Journal of Chemical Ecology DOI:10.18167/DVN1/XZ8IAF

Dubuisson C, Wortham H, Garinie T, Hossaert-McKey M, Lapeyre B, Buatois B, Temime-Roussel B, Ormeño E, Staudt M, Proffit M. 2024. Ozone alters the chemical signal required for plant-insect pollination: The case of the Mediterranean fig tree and its specific pollinator. The Science of The Total Environment, 919: 170861. DOI: 10.1016/j.scitotenv.2024.170861

Démares F, Gibert L, Lapeyre B, Creusot P, Renault D, Proffit M. 2023. Ozone exposure induces metabolic stress and olfactory memory disturbance in honey bees. Chemosphere, 346, 140647 DOI: 10.1016/j.chemosphere.2023.140647

Menacer K, Hervé M, Lapeyre B, Vedrenne M, Cortesero AM. 2023 Plant volatiles play differential roles in pre and post alighting phases in a specialist phytophagous insect. Comptes Rendus Chimie DOI: 10.5802/crchim.233

Auffray T, Arriaga-Jiménez A, Taudière A, Roy L.J.-M., Lapeyre B, Roy L. 2022. Attractant activity of host-related chemical blends on the poultry red mite at different spatial scales. Journal of Chemical Ecology DOI: 10.1007/s10886-022-01399-72022

Bèwadéyir Poda S, Buatois B, Lapeyre B, Dormont L, Abdoulaye Diabaté, Olivier Gnankiné, Roch K. Dabiré, Roux O. 2022. No evidence for long-range male sex pheromones in two malaria mosquitoes. Nature Ecology & Evolution... DOI: 10.1038/s41559-022-01869-x

Démares F, Gibert L, Creusot P, Lapeyre B, Proffit M. 2022. Acute ozone exposure impairs detection of floral odor, learning, and memory of honey bees, through olfactory generalization. Science of The Total Environment DOI : 10.1016/j.scitotenv.2022.154342

Vanderplanck M, Lapeyre B, Lucas S, Proffit M. 2021 Ozone Induces Distress Behaviors in Fig Wasps with a Reduced Chance of Recovery. Insects DOI : 10.3390/insects12110995

Vanderplanck M, Lapeyre B, Brondani M, Opsommer M, Dufay M, Hossaert-McKey M, Proffit M. 2021. Ozone Pollution Alters Olfaction and Behavior of Pollinators. Antioxidants DOI : 10.3390/antiox10050636

Mondet F, Blanchard S, Barthes N, Beslay D, Bordier C, Costagliola G, Hervé M, Lapeyre B, Kim S-H, Basso B, R. Mercer A, Le Conte Y. 2021 Chemical detection triggers honey bee defense against a destructive parasitic threat. Nature Chemical Biology DOI : 10.1038/s41589-020-00720-3

Proffit M, Lapeyre B, Buatois B, Deng X, Arnal P, Gouzerh F, Carrasco D, Hossaert-McKey M. 2020. Chemical signal is in the blend: bases of plant-pollinator encounter in a highly specialized interaction Scientific Reports DOI: 10.1038/s41598-020-66655-w

 

 

 

CPJ Université de Montpellier   Je travaille principalement sur la conservation des insectes, en particulier des arthropodes du sol, tels que les bousiers. Mes travaux portent sur trois domaines principaux : Méthodes d'ADN environnemental (eDNA) Modélisation distribution spatiale d’espèces et communautés (SDM/JSDM) Perceptions de la nature   I am a researcher and lecturer at the Université de Montpellier, France, with a focus on insect conservation, especially arthropods like dung beetles. My work spans three primary areas: Environmental DNA (eDNA) Methods Species Distribution Modeling (SDM) Cultural Perceptions of Nature    Courriel : This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Maitre de Conférences (EPHE)

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier 5

 tél : 33 (0)4 67 61 33 04
 fax: 33 (0)4 67 41 21 38

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 THEMES DE RECHERCHE

Mes thèmes de recherche concernent la phylogénie, la phylogéographie et l'évolution moléculaire à partir de l'analyse des séquences de gènes mitochondriaux et nucléaires. L’objectif est de répondre, à l’aide de l’outil moléculaire, à des questions de biodiversité et systématique évolutive à l’échelle des vertébrés (mammifères, amphibiens et reptiles). Je m’intéresse aussi à l’échelle temporelle (datations moléculaires) des différents niveaux de diversifications ce qui permet de confronter les inférences moléculaires avec les données morphologiques, paléontologiques et biogéographiques.

Directeur de recherche CNRS

CEFE/CNRS
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A l’interface entre écologie fonctionnelle et écologie des communautés, je cherche à comprendre les causes de variation de la biodiversité, aussi bien à l’échelle locale que continentale, et l’effet de changements de la biodiversité sur la dynamique et le fonctionnement des écosystèmes.

Doctorant

CEFE/CNRS Campus du CNRS
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34293 Montpellier cedex 5

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Sujet de thèse : Dynamiques socio-écologiques en région méditerranéenne : analyse comparée de réponses locales au défi de protection de la nature.

Mots-clés : Socio-écosystèmes, biodiversité méditerranéenne, espaces ruraux, projets de territoire.

Keywords : Social-ecological systems, mediterranean biodiversity, rural areas, local development projects.

Contexte : Dans les arrière-pays méditerranéens français, de profonds changements socio-économiques ont eu lieu depuis la révolution industrielle et les « trente glorieuses ». Ces changements sont aussi socio-environnementaux : ils marquent fortement les écosystèmes méditerranéens et les priorités actuelles de leur gestion ou de leur protection. De nombreux projets, initiatives ou dispositifs structurent ainsi les territoires ruraux autour de dynamiques socio-écologiques en conjuguant des objectifs multiples d’aménagement, de protection de l’environnement, d’animation et de valorisation de ces territoires.

C’est cette interdépendance entre société et environnement que ce projet veut explorer, pour comprendre son importance dans le déploiement d’actions locales et dans le changement des territoires. En comparant différentes initiatives en Languedoc-Roussillon, il s’agit de comprendre la mobilisation de ces liens d’interdépendance non seulement en fonction des formats d’initiatives différentes, mais aussi du rôle qu’ils jouent dans leur formulation et leur mise en œuvre, à la croisée d’enjeux multiples et d’intérêts différents. En mobilisant le concept de solidarité écologique et des apports issus de différentes disciplines, ce travail veut aussi contribuer à une approche scientifique intégrée des questions socio-environnementales.

Encadrement :

Raphaël MATHEVET (CNRS, UMR5175 CEFE)

John THOMPSON (CNRS, UMR5175 CEFE)

Etablissement d’inscription :

Université de Montpellier

Professeure Institut Agro Montpellier CEFE UMR5175 Campus du CNRS 1919, route de Mende F-34293 Montpellier cedex 5 France Tél : +33 4 67 61 33 34 Fax : +33 4 67 61 33 36 Courriel : This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. Site web perso : Elena.Kazakou.wordpress.com Orcid ID  2e Etage Aile C bureau 211

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Principaux thèmes de recherches

Mes recherches portent sur l'analyse des conséquences écologiques sur la variabilité du fonctionnement des espèces à travers l'utilisation des traits fonctionnels des plantes.

Plus précisément, les principaux objectifs de mes recherches sont les suivants :

- Caractériser les réponses des espèces (croissance, performance, reproduction) et leurs stratégies écologiques à travers différents gradients environnementaux (abandon culturel, intensification culturelle, pâturage, fertilisation, concentration en métaux lourds dans le sol)

- Décrire les liens entre les traits fonctionnels des espèces et le fonctionnement des écosystèmes (décomposition de la litière, digestibilité de la biomasse) dans un contexte de changement d'utilisation des terres. Je m'intéresse particulièrement à la détermination des liens entre les traits des espèces et leur appétence et leur digestibilité.

-Identifier les liens entre les parties aériennes et souterraines en réponse à l'herbivorie : tester l'hypothèse de la vie après la mort dans différents contextes et avec différents herbivores (mammifères, mollusques, insectes).

-Caractériser les réponses des communautés de mauvaises herbes à différents systèmes agricoles innovants, en particulier dans les vignobles, et leurs effets sur les services écosystémiques (pollinisation, régulations biologiques).

 

 

Research interests

My research is focused on the analysis of the ecological consequences on the variability of species functioning via the use of plant functional traits.

More precisely the main objectives of my research are:
-Characterize species responses (growth, performance, reproduction) and species ecological strategies across environmental gradients (cultural abandon cultural intensification, grazing, fertilization, concentration on heavy metals on soil)
-Description of the links between species functional traits and ecosystem functioning (litter decomposition, biomass digestibility) in a context of land use change. Especially, I am interested to determine the links between species traits and their palatability and digestibility.
-Identify the above-belowground linkages in response to herbivory: test the after-life hypothesis in different contexts and with different herbivores (mammals, mollusks, insects).
-Characterize weed communities responses to different innovate agricultural systems and especially in vineyards and the effects on the ecosystem services (pollination, biologial regulations).

 

Publications

P57. Tabary L, Kazakou E, Garcia L, Navia D, Tixier M-S. The effect of plant diversification in agroecological vineyards and predatory mites diversity (in press Pest Management Science)
P56. Garnier E, Delalandre L, Segrestin J, Barkaoui K, Kazakou E, Navas M-L, Vile D, Violle C, Bernard-Verdier et al. FAIRTraits: An enriched, FAIR-compliant database of plant traits from Mediterranean populations of 240 species. Ecology, 106(9): e70219.
P55. Tabary L, Garcia L, Kazakou E, Navia D, Tixier M-S. Ambulatory dispersal of Phytoseiidae mites along vine stocks in an agroecological vineyard: unexpected patterns revealed. Experimental and Applied Acarology (in press).
P4. Tabary L, Kazakou E, Tixier M-S, Navia D, Garcia L. Multifunctionality of agroecological vineyards: complex interactions between functional and taxonomic diversity of service crops and ecosystem services. Agriculture, Ecosystems and Environment (in press).
P53. Tabary L, Kazakou E, Navia D, Garcia L, Tixier M-S. Linking Phytoseiidae mite communities to the traits of inter-row plant species in an agroecological vineyard. Journal of Applied Entomology (in press).
P52. Martin Lefevre L, Ollivier M, Kazakou E, Bopp M-C, Fried G. Impacts of Agricultural Intensification on Weed Floral and Competitive Traits: A Spatiotemporal Study in French Vineyards and Annual Crops, Agriculture, Ecosystems and Environment 394 (2025) 109877..
P51. Genty L, Metay A, Kazakou E, Baude M, Gardarin A, Michelot-Antalik A, Barkaoui K (2025). Agricultural practices in olive groves modify weeds floral traits and resources throughout the year. Agriculture, Ecosystems and Environment 377:109280, 9.
P50. Bopp M-C, Kazakou E, Metay A, Maillet J, Quidoz M-C, Genty L, Fried G. (2025). Climate and management changes in 40 years drove more stress-tolerant and less ruderal weeds communities in vineyards. Ecological monographs 95(1), e1631.
P49. Bopp M-C, De Deyn G, Zwetsloot M, Moinet G, Fried G, Metay A, Fromin N, Fort F, Buatois B, Bastiaans L, Kazakou E. (2025). Weed management modifies functional properties of both weeds and microbial nitrogen-cycling. Journal of Applied Ecology 62 (2): 388-400.
P48. Genty L, Kazakou E, Metay A, Baude M, Gardarin A, Michelot-Antalik A, Leroy A, Sotillo A, Crouzet J, Barkaoui K. (2024) Flowers of ruderal species are numerous but small, short and low-rewarding. Oikos, e10219.
P47. Segrestin J, Kazakou E, Coq S, Sartori K, Richarte J, Rowe N, Garnier E. (2023). Responses of leaf biomechanics and underlying traits to rangeland management. Journal of Vegetation Science 34: e13216.
P46. Xyrafis EG, Kazakou E, Biniair K. (2023). A case study on the use of inter-row cover crops on a new and old vineyard cv. 'Asyrtiko' in Santorini Island. Notulae botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca 51(1) 13252.
P45. Rakotomanga D, Kazakou E, Damour G. (2023). Plant height and biomass as presdictors of between-species interactions in mixed cover crops-spontaneous species communities along a croppping practices gradient. Agriculture, Ecosystems and Environment (SSRN 4132189).
P44. Genty L, Kazakou E, Metay A, Bastianelli D, Bopp M-C, Barkaoui K. (2023). Promising weeds forage potential in perennial Mediterranean agroecosystems. Agriculture, Ecosystems and Environment, 347:108388, 13.
P43. Chapuis M-P, Leménager N, Piou C, Roumet P, Marche H, Centanni J, Estienne C, Ecarnot M, Vasseur F, Violle C, Kazakou E. (2023) Domestication provides durum wheat with protection from locust herbivory. Ecology and Evolution 13, e9741.
P42. Reinelt L, Whitaker J, Kazakou E, Bonnal L, Bastianelli D, Bullock J, Ostle N. (2023) Drought effects on root and shoot traits and their decomposability. Functional Ecology 37, 1044–1054.
P41. Kazakou E, Bumb I, Garnier E (2023). Species dominance rather than complementarity drives communitiy digestibility and litter decomposition in species-rich Mediterranean rangelands. Applied Vegetation Science 25 (4), 10.1111/avsc.12685.
P40. Bopp M-C, Fried G, Metay A, Bastianelli D, Bonnal L, Kazakou E. (2022). Linkages between traits and decomposition of weed communities along a soil management and pedoclimate gradient in Mediterranean vineyards. Annals of Botany 130(4):547-560.
P39. Fried G, Blanchet C, Cazenave L, Bopp M-C, Kazakou E, Metay, A, Christen, M., Alard, D, Cordeau, S. (2022). Consistent response of weeds according to Grime’s CSR strategies along a gradient of disturbance and resources in Bordeaux vineyards. Weed Research 62, 347-359.
P38. Vasseur F, Cornet D, Beurier G, Messier J, Rouan L, Bresson J, Ecarnot M, Stahl M, Heumos S, Gérard M, Reijnen H, Tillard P, Lacombe B, Emanuel A, Floret J, Estarague A, Przybylska S, Sartori K, Gillespie L, Baron E, Kazakou E, Vile D, Violle C. (2022). A Perspective on Plant Phenomics: Coupling Deep Learning and Near-Infrared Spectroscopy. Frontiers in Plant Science, 13.
P37. Sartori K, Violle C, Vile D, Vasseur F, de Villemereuil P, Bresson J, Gillespie L, Fletcher L, Sack L, Kazakou E. (2022). Does leaf nitrogen resorption dynamics reflect adaptation to slow-fast continuum? A test across ecotypes of Arabidopsis thaliana. Functional Ecology, 36(5): 1315-1328.
P36. Bopp M-C, Kazakou E, Metay A, Fried G. (2002). Relative importance of region, seasonality and weed management practice effects on the functional structure of weed communities in French vineyards. Agriculture Ecosystems and Environment 330: 107892.
P35. Kazakou E, Fried G, Cheptou PO, Gimenez G. (2021). Does seed mass drive interspecies variation in the effect of management practices on weed demography? Ecology and Evolution 11(19): 13166-137174.
P34. Crespo-Pérez V, Kazakou E, Roubik DW, Cárdenas RE. (2020). The importance of insects on land and in water: a tropical view. Current Opinion in Insect Science 20:31-38.
P33. Garcia L, Metay A, Kazakou E, Storkey J, Gary C, Damour G. (2020). Optimizing the choice of service crops in vineyards to achieve both runoff mitigation and water provisioning for grapevine: a trait-based approach. Plant and Soil 452(1-2): 87-104.
P32. Garcia L, Damour G, Kazakou E, Guillaume F, Metay A. (2020). Seasonal and interannual variations in functional traits of sown and spontaneous species in vineyard inter-rows Ecoscience 25: 311-324.
P31. Coq S, J Nahmani J, Kazakou E, Fromin N, David J-F. (2020). Do litter-feeding macroarthropods disrupt cascading effects of land use on microbial decomposer activity. Basic and Applied Ecology 46: 24-34.
P30. Ollivier M, Kazakou E, Corbin M, Sartori K, Lesieur V, Thomann T, Martin J-F, Tixier M-S. (2020). Traits comparison of the invasive weed Sonchus oleraceus L. (Asteraceae) between its native and introduced ranges. Neobiota 55: 85-115.
P29. Sartori K, Vasseur F, Violle C, Baron E, Gérard M, Rowe N, Ayala-Garay O, Garcia de Jalon L, Masclef D, Harscouet E, Del Rey Granado M, Chassagneux A, Christophe A, Kazakou E, Vile D. (2019). Leaf economics guides slow-fast adaptation across the geographic range of Arabidopsis thaliana. Scientific Reports 9:10758.
P28. Kazakou E, Vasseur F, Sartori K, Baron E, Rowe N, Vile D. (2019). Secondary metabolites have more influence than morpho‐physiological traits on litter decomposability across genotypes of Arabidopsis thaliana. New Phytologist 224(4):1532-1543.
P27. Fried G, Cordeau S, Métay A Kazakou E. (2019). Relative importance of environmental factors and farming practices in shaping weed communities’ structure and composition in French vineyards. Agriculture Ecosystems and Environment 275:1-13.
P26. Coq S, Nahmani J, Resmond R, Segrestin J, David JF, Schevin P, Kazakou E. (2018). Intraspecific variation in litter palatability to macroarthropods in response to grazing and soil fertility. Functional Ecology 32 (11): 2615-2624.
P25. Vasseur F, Sartori K, Baron E, Fort F, Kazakou E, & Segrestin j, Garnier E, Vile D, Violle C (2018). Climate as a driver of adaptive variations in ecological strategies in Arabidopsis thaliana. Annals of Botany 122(6): 935-941.
P24. Bumb I, Garnier E, Coq S, Nahmani J, Del Rey Granado M, Gimenez O, Kazakou E. (2018). Traits determining the digestibility– decomposability relationships in species from Mediterranean rangelands. Annals of Botany, 121 (3): 459–469.
P23. Kazakou E, Fried G, Richarte G, Gimenez O, Violle C, Metay A (2016). A plant-trait response and effect framework to assess inter-row vineyards soil management. Botany letters 163 (4): 373-388.
P22. Adamidis G, Kazakou E, Aloupi M, Dimitrakopoulos P. Is it worth to hyperaccumulate Ni on non-serpentine soils ? (2016) Decomposition dynamics of mixed-species litters containing hyperaccumulated Ni across serpentine and non-serpentine environments. Annals of Botany 117(7): 1241-1248.
P21. Bumb I, Garnier E, Bastianelli D, Richarte J, Bonnal L, Kazakou E. (2016). Influence of management regime and harvest date on the forage quality of rangelands plants: the importance of dry matter content AoB PLANTS 8:pwl045.
P20. Lü X-T, Freschet G, Kazakou E, Zhou L-S, Han XG (2015). Contrasting responses in leaf nutrient-use strategies of two dominant grass species along a 30-yr temperate steppe grazing exclusion chronosequence. Plant and Soil 387:69-79.
P19. Kazakou E, Violle C, Roumet C, Navas M-L, Vile D, Kattge J, Garnier E. (2014). Are trait-based species’ rankings consistent across datasets and spatial scales? Journal of Vegetation Science 25(1): 235-247.
P18. Gardarin A, Garnier E, Carrère P, Cruz P, Andueza D, Bonis A, ColaceM-P, DumontB, Duru M, Farruggia A, Gaucherand S, Grigulis K, Kernéïs E, Lavorel S, Louault F, Loucougaray G, Mesléard F, Yaverkovski N, Kazakou E. (2014) .Plant trait–digestibility relationships across management and climate gradients in permanent grasslands. Journal of Applied Ecology. 51 : 1207-1217
P17. Adamidis G, Kazakou E, Baker AJM, Reeves R, Dimitrakopoulos P. (2014). The effect of harsh abiotic conditions on the diversity of serpentine plant communities on Lesbos, an eastern Mediterranean island. Plant Ecology & Diversity7(3): 433-444.
P16. Adamidis G, Aloupi M, Kazakou E, Dimitrakopoulos P. (2014). Intra-specific variation in Ni tolerance, accumulation and translocation patterns in the Ni-hyperaccumulator Alyssum lesbiacum. Chemosphere 95: 496-502.
P15. Adamidis G, Kazakou E, Fyllas N, Dimitrakopoulos P. (2014). Species adaptive strategies and leaf economic relationships across serpentine and non-serpentine habitats on Lesbos, eastern Mediterranean. Plos One 9(5):e96034.
P14. Gaba S, Fried G, Kazakou E, Chauvel B, Navas M-L. (2013). Agroecological weed control using a functional approach: a review of cropping systems diversity. Agronomy for Sustainable Development34: 103-119.
P13. Fried G, Kazakou E, Gaba S. (2013). Trajectories of weed communities explained by traits associated with species’ response to management practices. Agriculture, Ecosystems and Environment 158: 147–155.
P12. Birouste M, Kazakou E, Blanchard A, Roumet C. (2011). Plant traits and decomposition: are the relationships for roots comparable to those for leaves? Annals of Botany109(2): 463-472.
P11. Kazakou E, Adamidis G, Baker AJM, Reeves RD, Godino M, Dimitrakopoulos P.(2010). Species adaptation in serpentine soils in Lesbos Island (Greece): metal hyperaccumulation and tolerance. Plant and Soil 332(17): 369-385.
P10. Kazakou E, Violle C, Roumet C, Pintor C, Gimenez O, Garnier E. (2009). Litter quality and decomposability of species from a Mediterranean succession depend on leaf traits but not on nitrogen supply. Annals of Botany 104: 1151–116.
P9. Fortunel C, Garnier E, Joffre R, Kazakou E, Quested H, Grigulis K, Lavorel S, and the VISTA consortium (2009). Leaf traits capture the effects of land use changes and climate on litter decomposability of herbaceous communities across Europe. Ecology 90(3): 598-611.
P8.Pakeman R, Leps J, Kleyer M, Lavorel S, Garnier E, Ansquer P, Castro H, Cruz P, Dolezal J, Eriksson O, Fortunel C, Freitas H, Golodets C, Grigulis K, Jouany C, Kazakou E, Kigel J, Kleyer M, Lehsten V, Lepš J, Meier T, Pakeman R, Papadimitriou M, Papanastasis V, Quested H, Quétier F, Robson M, Roumet C, Rusch G, Skarpe M, Sternberg M, Theau J-P, Thébault A, Vile D, Zarovali M (2009). Relative climatic, edaphic and management controls of plant functional trait signatures. Journal of Vegetation Science 20: 148–159.
P7. Kazakou E, Dimitrakopoulos PG, Baker AJM, Reeves RD, Troumbis A. (2008). Hypotheses, mechanisms and trade-offs of tolerance and adaptation to serpentine soils: from species to ecosystem level. Biological reviews 83: 495-508.
P6. Cornwell WK, Cornelissen JHC, Amatangelo K, Dorrepaal E, Eviner VT, Godoy O, Hobbie SE, Hoorens B, Kurokawa H, Perez Harguindeguy N, Quested HM, Santiago LS, Wardle DA, Wright IJ, Aerts R, Allison SD, van Bodegom, Brovkin V, Chatain A, Callaghan T, Díaz S, Garnier E, Gurvich DE, Kazakou E, Klein JA, Read J, Reich PB, Soudzilovskaia NA, Vaieretti MV, Westoby M. (2008). Plant species traits are the predominant control on litter decomposition rates within biomes worldwide. Ecology Letters 11: 1065-1071.
P5. Kazakou E, Gimenez O, Garnier E. (2007). Assessing the relative contribution of leaf lifespan and nutrient resorption to mean residence time: an elasticity analysis. Ecology 88 (7): 1857-1863.
P4. Kazakou E, Garnier E, Navas M-L, Roumet C, Collin C, Laurent G. (2007). Components of nutrient residence time and the leaf economics spectrum in species from Mediterranean old-fields differing in successional status.Functional Ecology21: 235-245.
P3. Violle C, Navas M-L, Vile D, Kazakou E, Fortunel C, Hummel I, Garnier E. (2007). Let the concept of trait be functional! Oikos 116: 882-892.
P2. Garnier E, Lavorel S, Ansquer P, Castro H, Cruz P, Dolezal J, Eriksson O, Fortunel C, Freitas H. Golodets C, Grigulis K, Jouany C, Kazakou E, Kigel J. Kleyer M, Lehsten V, Lepš J, Meier T, Pakeman R, Papadimitriou M, Papanastasis V, Quested H, Quétier F, Robson M, Roumet C, Rusch G, Skarpe M, Sternberg M, Theau J-P, Thébault A, Vile D, Zarovali M (2006). Assessing the effects of land use change on plant traits, communities and ecosystem functioning in grasslands: a standardized methodology and lessons from an application to 11 European sites. Annals of Botany 99: 967-985.
P1. Kazakou E, Vile D, Shipley B, Gallet C. Garnier E (2006). Co-variations in litter decomposition, leaf traits and plant growth in species from a Mediterranean old-field succession. Functional Ecology20: 21-30.

Programmes

-Projet Fellow ‘Weeds as crop fellows? Spatio-temporal functional changes of weed communities due to the impacts of a gradient of human pressures and their potential on biodiversity-mediated ecosystem services’. https://www.fondationbiodiversite.fr/la-frb-en-action/programmes-et-projets/le-cesab/fellow/ (2024-2027).

-Projet TRIBE ‘Développement d’indicateurs basés sur les Traits des adventices pour évaluer les pratiques agricoles gérant le RIsque malherbologique et produisant des BEnéfices écosystémiques,’ PI = E Kazakou et G Fried (2023-2026).

-Projet FLAVI ‘Comprendre les dynamiques spatio-temporelles de la diversité fonctionnelle florale des adventices afin de préserver les pollinisateurs le long d’un gradient de pratiques culturales dans des vignobles de la région d’Occitanie’, défi-clé OCTAAVE https://octaave.univ-toulouse.fr/projet-de-recherche-flavi/ (2023-2026).

-Programme Saving: Dynamique spatio-temporelle des communautés d’espèces adventices en réponse aux pratiques de gestion des sols dans les vignobles : une approche fonctionnelle Ecophyto et Région Occitanie (oct 2019-oct 2022).

-Programme DINER - exploring Domestication Impacts on plaNt-insEct-bacteRia interactions (26 months). Funding by the Centre Méditerranéen encironnement et biodiversité. CEMEB (Centre Méditerranéen encironnement et biodiversité).

- Programme "Cascade: Interactions trophiques et fonctionnement des écosystèmes terrestres: une approche fonctionnelle et chimique" INSU CNRS 2012-2014. 

- Programme DivHerbe (Programme National ECCO/ECOGER) : 2006-2008.

- Programme  GESSOL 3-Fonction environnementales et gestion du patrimoine sol : Préservation des sols viticoles méditerranéens et amélioration

 

Enseignement

Enseignement de l'écologie fonctionnelle, biologie, écologie et gestion des adventices

 

Responsabilités d'enseignement

-Responsable de l'option M2 "Protection des Plantes et Environnement" de l'Institut Agro Montpellier

-Responsable national du Master Erasmus Mundus Plant Health http://planthealth.upv.es/?lang=fr

-Responsable nationale du Master 3A parcours Santé des Plantes

-Co-responsable de la Dominante 3 "Gestion durable des ressources naturelles"

-Co-ordination des 6 unités d'enseignements à l'Institut Agro Montpellier

Doctorante
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Tel. +33 (0)4 67 61 32 63

CEFE/CNRS UMR5175
Etage 1, aile C, bureau 114

Supervisor : Stéphanie Manel (CEFE)
Co-supervisor : David Mouillot (MARBEC)

Chargé de Recherche CNRS

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https://www.researchgate.net/profile/Felix-De-Tombeur-2

  

 

 

Research interests

Soil scientist fascinated by plant ecophysiology, my research focusses on soil-plant interactions in both natural and controlled conditions. I am particularly interested in silicon (Si), a major component of the Earth’s crust and soils, that is increasingly considered as a key element in plant ecology and agriculture through the fantastic process of biosilicification (mineral deposits in plant organs as seen on the left).

 

 

Research thematic

I combine expertise in soil science and plant ecophysiology to work on three different research axes:

• The influence of soil properties, and in particular their evolution over time through the use of long-term chronosequences, on silicon cycling (e.g., soil Si pools and fluxes, Si availability for plants, Si uptake by plants and silicification, biological versus lithological control on Si cycling)
• The control of overlooked biotic factors on soil-plant Si mobility (e.g., soil microorganisms, large herbivores, root exudates), and how they could be leveraged to increase crop Si status through specific agricultural practices.
• Developing functional trait-based approaches to better understand the role and functions of Si and silicification in plant ecophysiology, and how it aligns with major ecological theories (plant growth/defense tradeoff, plant economics spectrum, resource availability hypothesis, etc.).

Publications: https://scholar.google.com/citations?user=QZdjQjwAAAAJ&hl=fr

Professeur des Universités, Université de Montpellier

 

Courriel : This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

 

Professeur des universités, Université de Montpellier

Mes travaux de recherche concernent la biodiversité végétale et fongique source de substances naturelles (composés phénoliques, saponines, composés organiques volatils, peptides, exsudats racinaires) permettant les interactions de la plante ou du champignon avec son environnement (micro-organismes, microfaune, homme) et dont certaines présentent des activités biologiques valorisables par l’homme (dépollution, agro-alimentaire, pharmaceutique, industriel…) ou un impact négatif sur la santé humaine (toxines fongiques) .

 My research focuses on vegetal and fungal biodiversity source of natural substances (phenolic compounds, saponins, volatile organic compounds, peptides, root exudates) allowing interactions of the plant or the mushroom with its environment (microorganisms, microfauna, human) with biological activities valorizable by human (mycoremediation, agro-alimentary, pharmaceutical, industrial) or with a negative impact on human health (fungal toxin).

Courriel : This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Professeur émérite

 

UMR5175, Université Paul-Valéry Montpellier, Route de mende, 34199 Montpellier Cedex 5

Tél : +33 (0)6 38 95 24 35

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https://www.researchgate.net/profile/Gerard_Duvallet

 

Résumé :

Étude de l’impact du changement des pratiques pastorales sur les populations de vecteurs et conséquences possibles : 1) évaluer en quoi l’activité d’élevage a un effet sur la biodiversité (entomofaune), 2) analyser et prévoir les conséquences pour les arthropodes hématophages (nuisances et transmission de pathogènes), 3) envisager toutes les possibilités de lutte non polluante (pièges chimiques attractifs, substances naturelles répulsives, lutte biologique).

Travaux menés en France, en Thaïlande et en Afrique de l’Ouest principalement sur stomoxes et tabanides.

 

Mots-clés :

Arthropodes hématophages, Transmission vectorielle, Pratiques pastorales, Méthodes de lutte

 

 

 

 

 

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 Directeur de Recherche Emerite au CNRS / Emeritus Senior Scientist at CNRS

J’étudie les réponses des communautés animales et végétales aux changements d’origine humaine (espèces introduites, usage des sols), en milieu tempéré et méditerranéen.

I study plant and animal community response to human induced change (introduced  species, land use) in temperate and méditerranean systems.

Courriel: jean-louis.martin [at] cefe.cnrs.fr

 

Chargé de recherche à l’INSERM Ma principale activité de recherche porte sur l’évolution et la diversité taxinomique des macromycètes, que j’aborde via l’analyse phylogénétique d’échantillons issus d’un large réseau de mycologues européens partenaires. Je constitue aussi une extractothèque fongique destinée à mettre en évidence et valoriser le potentiel bioactif de ces organismes dans le domaine de la santé humaine. My research is mainly focused on the evolution and the taxonomic diversity of higher fungi. I am adressing this issue through the phylogenetic analysis of samples originating from a broad network of European partner mycologists. I am also assembling a fungal extract library, aiming at revealing and promoting the bioactivities of these organisms in the field of human health.   Courriel : This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Professeur(Université Paul-Valéry Montpellier III)

Tél : +33 (0) 4 67 14 23 15

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Directeur de Recherche ( DR1)/Directeur du CEFE

Mes travaux portent sur la compréhension de la régulation du fonctionnement des écosystèmes terrestres en terme de flux de matière (eau, carbone, nutriments…). Initialement centrées sur les écosystèmes méditerranéens, mes activités ont été élargies à d’autres écosystèmes subissant de très fortes contraintes (les hauts plateaux andins). 

My research focuses on the understanding of terrestrial ecosystems functioning in terms of fluxes (water, carbon, nutrients...). Initially centered on Mediterranean ecosystems, my research activities have been extended to the Andean highlands).

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Mots-clés:Ecologie fonctionnelle-  Changements planetaires -   Méditerranée - Andes - Quercus -  Chenopodium quinoa - Spectroscopie proche infrarouge

Key-words:Functional Ecology - Global Change - Mediterranean Basin - Andes -Quercus - Chenopodium quinoa - NIRS

 

John D. Thompson

Directeur de recherches, première classe

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Programme de recherche

Depuis le début ma carrière de scientifique à Montpellier en 1989 mes recherches se placent toujours dans le cadre historique, bio-géographique et paysager particulièrement fascinant de la région Méditerranéenne et se focalisent sur l’écologie, l’évolution et la conservation de la flore.

Dans cette région les changements historiques et contemporains pourraient avoir des conséquences profondes aussi bien pour la dynamique et la viabilité des populations et des communautés, que pour la capacité de réponse évolutive rapide des espèces, aspect scientifique trop souvent négligé. n élément clé dans mes recherches concerne mon investissement dans une recherche qui s'articule autour de collaborations interdisciplinaires très étroites (sciences humaines) et l'animation d'une interface fonctionnelle entre problématique scientifique et enjeux de conservation.

Ces recherches s’articulent autour des thèmes suivants :

• L’application de notre connaissance sur l’évolution de la flore à la conservation conservation du potentiel évolutif.
• L’ évaluation de l’état de conservation des populations d’espèces rares, endémique où en limite d’aire.
• La connaissance de la niche fine des espèces en tant que connaissance fondamentale pour la gestion de la flore.
• L’analyse des interfaces entre connaissances écologique, perceptions culturelles et savoirs-faire locaux (notamment pour la cueillette) dans la conservation de la flore.

Actuellement je mène des recherches dans le cadre du programme « Transitions écologiques et flore protégée : la gestion conservatoire à l’échelle de la niche (TRANECOL) financé par l’OFB et le CEMEB. Ce programme a pour but d’analyser la variabilité de la niche des espèces végétales protégées en situations de transitions écologiques où le fonctionnement des milieux est particulièrement contrasté en région méditerranéenne: en l’occurence la mosaïque de milieux côtiers où la micro-topographie et la salinité varie de manière très forte sur des espaces très restraints, les gradients d’altitude en arrière pays et sur les écotones entre grands types de substrat. L’objectif ici est d’informer les stratégies et actions des gestionnaires sur l’importance d’identifier la niche écologique des espèces à l’échelle très fine du fonctionnement des individus en milieu hétérogène.

Notre travail se fait en étroite collaboration avec les gestionnaires dans trois contextes :

• le territoire du Parc National du Mercantour,
• la Réserve Naturelle Régionale de Sainte Lucie et d’autres sites sur le territoire du Parc Naturel Régional de la Narbonnaise en Méditerranée,
• le site Natura 2000 de la Grande Maïre à Portiragnes dont la gestion est attribuée à la Communauté d’Agglomération Hérault Méditerranée et d’autres espaces de près salés sur le pourtour Méditerranéen.

Plant Evolution in the Mediterranean

My first book - Plant Evolution in the Mediterranean - was published in 2005. It provided the first synthetic account of the majors processes of evolution in the Mediterranean flora in relation to the history and ecology of the region. It analyzed patterns of species’ distributions and traits in the evolution of the remarkable diversity and degree of endemism that characterize the Mediterranean flora.

Ever since 2005 here has been an immense amount of new and fascinating work on the history, ecology, and evolution of the Mediterranean flora. During this time, human impacts have continued to increase dramatically, significantly influencing both the ecology and evolution of the region’s biota.

My second book, Plant Evolution in the Mediterranean - Insights for conservation, published in 2020 represents a comprehensive update on these issues.

This is not a traditional book on plant evolution, but rather a novel integration of a diverse and scattered literature to produce a synthetic account of Mediterranean plant evolutionary ecology that maintains the accessible style of the previous version but in a new structural framework. History, ecology, biogeography, and evolution are all set in the context of a dramatically increasing footprint. I argue how an understanding of the evolutionary ecology of the region’s flora can be used to provide insights into its conservation and management.

 

Conseils scientifiques

Sur le thème de la protection de la nature en région Méditerranéenne et ces montagnes, j’ai établi les liens très forts avec les gestionnaires de sites et d’aires protégées. Cet engagement se concrétise par mon rôle en tant que président de deux conseils scientifiques et membre de deux autres.

• Président

Conseil scientifique du Parc National du Mercantour

Conseil scientifique du Parc Naturel Régional de la Narbonnaise en Méditerranée

• Membre

Conseil scientifique du Conservatoire Botanique National Méditerranéen

Conseil scientifique du Parc National des Calanques

 

 

A lire

Raevel, V., Munoz, F., Pons, V., Renaux, A., Martin, A. & Thompson, J.D. 2013. Changing assembly processes during a primary succession of plant communities on Mediterranean roadcuts. Journal of Plant Ecology, 6, 19-28.

Thompson, J. D., Charpentier, A., Bouguet, G., Charmasson, F., Roset, S., Buatois, B., Vernet, P. & Gouyon, P.-H. 2013. Evolution of a genetic polymorphism with climate change in a Mediterranean landscape. Proceedings of the National Academy of Science (USA), 110, 2893-2897.

Gauthier, P., Foulon, Y., Jupille, O. & Thompson, J.D. 2013. Quantifying vulnerability to assess priorities for conservation management. Biological Conservation,158, 321-325.

Berjano R., Gauthier P., Fisogni A., Doblas, D., Pons V. & Thompson J.D. 2013. Mate limitation in populations of the endangered Convolvulus lineatus L.: a case for genetic rescue ? Journal for Nature Conservation, 21, 334-341.

Schatz, B. Gauthier, P. Debussche, M. & Thompson, J.D. 2014. A decision tool for listing species for protection on different geographic scales and administrative levels. Journal for Nature Conservation, 22, 75-83

Borie, M., Mathevet, R., Letourneau, A., Ring, I., Thompson^,J.D. & Marty, P. 2014. Exploring the contribution of fiscal transfers to protected area policy. Ecology and Society, 19(1): 9. http://dx.doi.org/10.5751/ES-05716-190109

Mathevet, R., Thompson, J.D., Folke, C. & Chapin III, F.S. 2016 Protected areas and their surrounding territory: socio-ecological systems in the context of ecological solidarity. Ecological Applications, 26, 5-16.

Pironon, S. Papuga, G., Villellas, J., Angert, A.L., García, M.B. & Thompson, J.D. 2017. Geographic variation in genetic and demographic performance: new insights from the analysis of an old biogeographical paradigm. Biological Reviews, 92, 1877-1909.

Bigard, C., Pioch, S. & Thompson, J.D. 2017. The inclusion of biodiversity in impact assessment for urban development projects: policy-related progress limited by gaps and blurred by semantic confusion. Journal of Environmental Management, 200, 35-45.

Vimal, R., Fonderflick, J., Thompson, J.D., Pluvinet, P., Debussche, M., Cheylan, M., Géniez, P., Mathevet, R., Acquarone, A., & Lepart, J. 2018. Integrating habitat diversity into species conservation in the Mediterranean mosaic landscape. Basic and Applied Ecology, 22, 36–43. 

Thompson, J.D., Gauthier, P., Papuga, G., Pons, V., Debussche, M. & Farris, E. 2018. The conservation significance of natural hybridisation in Mediterranean plants: from a case study on Cyclamen (Primulaceae) to a general perspective. Plant Biology, 20 (Suppl. 1), 128-138.

Papuga, G. Gauthier, P., Pons, V., Farris, E. & Thompson, J.D. 2018. Eological niche differentiation in peripheral populations: a comparative analysis of eleven Mediterranean plant species, Ecography, 41, 1-15.

Thompson, J.D., Amiot, J., Borron, C., Linhart, Y.B., Keefover-Ring, K. & Gauthier, P. 2019. Spatial heterogeneity of gall formation in relation to chemotype distribution in Thymus vulgaris.Plant

Gauthier, P., Bernard, C. & Thompson, J.D. 2019. Assessing landscape vulnerability for populations of listed Mediterranean plants. Journal for Nature Conservation,51, Article 125736.

Gauthier, P., Pons, V., Fisogni, A., Murru, V., Berjano, R., Dessena, S. Maccioni, A., Chelo, C., Doncieux., A., Papuga, G. & Thompson, J.D. 2019. Monitoring population dynamics in rare and endangered Mediterranean plants. Journal for Nature Conservation,52, Article 125758.

Bigard, C., Thiriet, P., Pioch, S. & Thompson, J.D. 2020. Strategic landscape-scale planning to improve mitigation hierarchy implementation: an empirical case study in Mediterranean France. Land-Use Policy, 90, Article 104286.

Thompson, J.D. & Mathevet, R. 2017. Solidarité écologique. Espaces Naturels, 58, 13.

A regarder

Fleurs sauvages de la Méditerranée, « Sous le soleil ». ARTE 2019 https://www.arte.tv/fr/videos/069769-001-A/les-secrets-des-fleurs-sauvages-sous-le-soleil/