Directeur de Recherche CNRS

CNRS Senior scientist

INSB/INEE

Section 28 CNRS - Brain, Behavior & Cognition

email: julien[dot]renoult[at$]cefe[dot]cnrs[dot]fr

Darters (NSF 2020-2025)- Preferences, information theory, and the evolution of signal design (PI: T Mendelson & J Renoult) 

BIRDHABITAT-PATTERN (2025-2026) - AI for studying the role of habitat in the diversification of bird plumage color patterns. With Chris Cooney (Univ Sheffield), Maximilien Servajean (UMR LIRMM) & Jérome Pasquet (UMR TETIS). CNRS programm AISSAI. 

Questions :

Tout individu est le produit d'un événement de reproduction. Ces événements s'organisent en réseaux reproductifsou pédigrées de structure souvent non aléatoire. Ainsi les pédigrées peuvent être en partie découpés en parties disjointes (isolement reproductif), le nombre de descendants peut varier beaucoup d'un individu à l'autre (variance du succès reproducteur), des croisements peuvent se produire entre apparentés (consanguinité). Je recherche en quoi la structure des pédigrées affecte la distribution de la valeur sélective dans une population, et interagit avec l'évolution des stratégies de reproduction. Ces dernières sont des traits qui donnent aux individus l'opportunité de modifier la forme du pédigrée de sorte à augmenter la valeur sélective de leurs descendants : évitement des croisements interspécifiques ou consanguins, choix du partenaire.

Modèles Biologiques :

J'ai étudié les conséquences de la consanguinitéet de la reproduction croisée sur la valeur sélective, depuis la dépression de consanguinité jusqu'à la dépression hybride, chez plusieurs organismes comme les mollusques bivalves(clams Spisula ovalis; moules Mytilus spp.) les crapauds(Pelodytes punctatus), et l'escargot d'eau doucePhysa acuta. J'ai étudié l'isolement reproductif chez Mytilus, la sélection sexuelle et le choix du partenaire chez les mouches pédonculées(Cyrtodiopsis dalmanni), et les stratégies d'auto ou d'allofécondation chez les escargots d'eau douce(Bulinus truncatus, Physa acuta...) Actuellement je travaille surtout sur l'évolution de l'allocation au sexe et du système de reproduction chez Physa acuta.

Quelques résultats remarquables :

- Une série de modèles montrant comment la consanguinité au sens large (autofécondation, réductions de taille ou subdivision des populations) crée des corrélations positives entre l'hétérozygotie moléculaire (microsatellites, allozymes) et la valeur sélective. Ils incluent des méthodes statistiques pour analyser ces corrélations, ainsi qu'une étude de cas sur le bivalve Spisula ovalis.

- Plusieurs études de génétique quantitative sur l'effet de la variation environnementale sur les systèmes de reproduction. Tout est une affaire de norme de réaction: l'interaction entre stress environnemental et qualité génétique, qui détermine le développement des ornements sexuels des mâles de mouches pédonculées; la perte, induite par la chaleur, de l'appareil copulateur mâle chez l'escargot Bulinus truncatus; le comportement d'attente de Physa acutaqui repousse sa première ponte (plutôt que de s'autoféconder) quand elle ne trouve pas de partenaire.

- Une méthode pour estimer les taux d'autofécondationavec des données de génotypes multilocus dans une population, sans utiliser Fis, et donc sans les biais dûs aux allèles nuls et autres genotypages erronés. Disponible en freeware.

- La découverte pour la première fois chez les animaux d'un ADN mitochondrial porteur de stérilité mâle, capable de transformer un hermaphrodite en femelle. Ces femelles coexistent avec des hermaphrodites normaux (gynodioécie) - un phénomène connu jusqu'ici seulement chez les plantes. Nous l'avons trouvé chez l'escargot Physa acuta. Les mitogénomes porteurs de stérilité mâle sont extrêmement divergents des mitogénomes normaux dans la même espèce, suggérant une évolution de type course-aux-armements. L'ADN mitochondrial, transmis uniquement par la mère, a évolutivement intérêt à privilégier la voie femelle au détriment de la voie mâle chez un hermaphrodite, aboutissant à un conflit avec les gènes nucléaires (transmis par les deux sexes).

Projets en cours:

L'essentiel de mes projets en cours sont sur Physa acutaoù j'étudie l'allocation au sexe, le comportement reproducteuret la sélection sexuelle. J'ai notamment mis en place des protocoles d'évolution expérimentale de l'allocation au sexe (qu'est-ce que cela fait d'arrêter la sélection sur la fonction femelle, ou sur la fonction mâle), de la gynodioécie (évolution de la stérilité mâle). En collaboration avec J. Tonnabel (ISEM), je m'intéresse, après avoir exploré la sélection sexuelle chez les hermaphrodites animaux, à la sélection sexuelle chez les plantes. Enfin, je m'intéresse à la nature de la dépression de consanguinité et au rôle potentiel de l'épigénétique dans son maintien.

Spisula ovalis,espèce où j'ai detecté une corrélation entre hétérozygotie et valeur sélective due à la consanguinité; ceci contredit l'idée que les invertébrés marins à larves dispersant dans le plancton ont des populations parfaitement panmictiques

Bulinus truncatus,individu avec son phallus sorti. Dans cette espèce le développement du phallus est supprimé chez certains individus. La probabilité de perte du phallus augmente avec la température, suivant une norme de réaction propre à chaque génotype

Les pédoncules oculaires allongés de ce mâle de mouche pédonculée (Cyrtodiopsis dalmanni) sont un des traits que les femelles utilisent pour choisir les mâles qui donneront de bons gènes aux descendants. Dans les environnements très stressants, les contrastes entre mâles pour ce trait sont renforcés

RMES, pour Robust Multilocus Estimates of Selfing, logiciel libre sous Windows pour estimer sans biais des taux d'autofécondation avec des données de génétique des populations. Cliquer sur l'icône pour télécharger la dernière version et son fichier d'aide

Physa acuta, mon escargot favori et le premier cas de stérilité mâle cytoplasmique chez un animal (taille 1 cm). photo JP Pointier.

Questions :

Comprendrel'assemblage et la dynamique des communautés d'espèces est un objectif ancien en écologie. La plupart des modèles supposent que les espèces ont des traits fixes, donc que les événements écologiques sont instantanés à l'échelle du temps évolutif. Cependant deux processus évolutifs au moins contribuent à la construction des communautés : la spéciation et l'évolution des traits, qui modifie les interactions entre espèces. Lesinvasions biologiques sont un des processus d'assemblage des communautés. Je cherche à savoir (i)comment les traits évoluent pendant et après l'invasion d'une espèce (ii) si l'invasion est dépendante de certains traits. J'ai aussi travaillé sur les modèles destabilité  évolutive des communautés. Parmi des communautés écologiquement stables, seules quelques-unes sont évolutivement stables (i.e. les traits des espèces ne sont pas sélectionnés pour augmenter ou diminuer). Nous utilisons pour traiter cette question des modèles de trade-off entre traits (compétition et colonisation). Ebnfin je m'intéresse çà la question de l'inférence des mécanismes de coexistence ou d'interactions entre espèce (compétition, niche écologique) dans des métacommunautés : comment à partir de jeux de données observés comprendre les processus qui régissent les distributions (où une espèce est-elle trouvée), les corrélations (quelles espèces trouve-ton ensemble ou pas), les turnovers (comment changent les communautés dans le temps).

Modèles biologiques:

J'ai étudié deux modèles d'étude principaux : lesmouches des fruits (Tephritidae), une série de trois espèces invasives plus une endémique à l'île de La Réunion; et lesescargots d'eau douce aux antilles françaises, à travers l'invasion des rivières de Martinique par des escargots ThiaridésMelanoides tuberculata etTarebia granifera.etla dynamique desméta-communautés de mollusques d'eau douce, à la fois indigènes et introduits, dans un système de rivières et de mares en Guadeloupe.

Quelques résultats remarquables:

 - En combinant phylogéographie moléculaire, suivis de terrain, et génétique quantitative, nous avons analysé la diversité des traits d'histoire de vie dans les populations introduites deMelanoides tuberculata. Ce jeu de données constituela démonstration la plus spectaculaire que les populations invasives peuvent accumuler de la diversité génétique pour des traits écologiquement importants grâce à des introductions répétées. Cette diversité est encore augmentée par la production de nouveaux phénotypes par des croisements entre souches introduites.

- les modèles spatiaux d'invasion sont classiquement fondés sur des équations de diffusion en paysage continu. Mais beaucoup d'invasions ont lieu dans des habitats fragmentés (par ex. eaux douces).Nous avons mis au point un modèle d'invasion en métapopulation et estimé ainsi des paramètres de colonisation pour un invasion récente : celle de l'escargot Tarebia graniferaen Martinique. Grâce au modèle nous pouvons re-simuler l'invasion, en changeant certains paramètres (densité et taille des sites favorables, point d'introduction etc.) pour comprendre l'effet des caractéristiques du paysage et de la stochasticité sur la dynamique d'invasion. Cette démarche a au fil des années été développée pour estimer simultanément les paramètres de colonisation et d'extinction de toutes les espèces d'une guilde (celle des escargots d'eau douce des mares de Guadeloupe), en prenant en compte leurs différentes "niches" (le fait que les milieux favorables à l'une ne sont pas ceux qui sont favorables à l'autre). Nous arrivons ainsi, pour la première fois, à évaluer la diversité des niches dans une métacommunauté.

La mare de Saint-Félix en Guadeloupe est l'un des200 sites où nous suivons annuellement les communautés de mollusques d'eau douce

Melanoides tuberculata.Cette collection de coquilles montre l'étonnante diversité morphologique des souches invasives de cette espèce. Ces souches diffèrent aussi pour des traits d'histoire de vie comme la fécondité ou la taille des juvéniles. [couverture d'un numéro de Current Biol., 2008]

4 espèces de mouche des fruits (Tephritidae), une endémique (haut à gauche) et trois envahisseuses successivement introduites dans l'île de la Réunion (Océan Indien) . L'aptitude à la compétition augmente à chaque nouvel envahisseur.

On a longtemps cherché des traits typiques des espèces invasives. Nous avons émis et validé l'hypothèse quele succès invasif dépend des valeurs de trait relatives d'une espèce par rapport aux espèces locales apparentées avec lesquelles elle est en compétition. Avec des expériences en laboratoire nous montrons que dans une série d'espèces deTephritidae ayant envahi successivement l'île de La Réunion, les plus récentes sont compétitivement dominantes sur les anciennes Contrairement aux hypothèses classiques, les meilleurs envahisseurs ont des taux de croissance intrinsèque (r) relativement faibles.

Projets en cours:

 Je continue à travailler sur l'analyse statistique de données de terrain (Thiaridés de Martinique, mollusques d'eau douce de Guadeloupe) pour (i) reconstituer les interactions entre espèces (compétition notamment) à partir des dynamiques temporelles d'invasion ou de turnover dans des métacommunautés (ii) comprendre les mécanismes decoexistence des espèces dans les méta-communautés de mollusques de Guadeloupe, et en particulier l'effet de la diversité des traits d'histoire de vie et des systèmes de reproduction sur cette coexistence.

Collaborations:

L'essentiel de mes recherches est partagé avecPhilippe Jarne. Nous fonctionnons en symbiose et co-dirigeons les étudiants depuis plus de dix ans (et la symbiose n'a toujours pas tourné au parasitisme!). Nous collaborons régulièrement avecJean-Pierre Pointier, un génial expert en malacologie à l'EPHE de Perpignan.

Autres collaborateurs sur Montpellier : Jeanne Tonnabel (sélection sexuelle plantes);Pierre-André Crochet (biologie des métapopulations et communautés d'amphibiens et reptiles),  Sylvie Hurtrez-Boussès(Génétique des populations, phylogéographie, parasitisme escargots), Elodie Chapuis(évolution des traits d'histoire de vie), Jonathan ROMIGUIER (génomique des escargots et stérilité mâle)

En-dehors de Montpellier :  Emilien Luquet (UCBL, Lyon plasticité, évolution, épigénétique quantitative), Sandrine Plénet (idem), Tristan Lefébure (UCBL Lyon, évolution ADN mitochondrial), Christoph Grunau et Céline Cosseau (UPVD Perpignan, épigénétique escargots), Vincent Calcagno(INRA-Sophia Antipolis; écologie des communautés); François Massol(CNRS- Université USTL de Lille), Pilar Alda et Nicolas Bonel (CONICET Bahia Blanca, Argentine; écologie et évolution des escargots vecteurs de parasitoses, évolution des systèmes de reproduction)

Encadrements de Thèses:

J'encadre actuellement les thèses de

Romann CHARBONNIER (depuis oct. 2025) (thème : conflits cytoplasme-noyau et stérilité mâle chez la physe Physa acuta)
Matthias RAPP (depuis oct. 2025) (thème : éco-évolution communautés d'escargots eau douce; Co-encadrement avec P. Jarne)

Timothée CHENIN (depuis oct. 2023) (thème : sélection sexuelle chez les plantes; (Co-encadrement avec A. Mignot, directrice de thèse et J. Tonnabel, co-encadrante et encadrante principale)

J'ai encadré les thèses de

Fanny LAUGIER (2021-2024) (thème : conflits cytoplasme-noyau et stérilité mâle chez la physe Physa acuta). Actuellement: postdoc université d'Edimbourg (Ecosse)

Thomas DE SOLAN (2017- 2020; co-encadrement avec P.A. Crochet) (thème : évolution phénotypique et phylogénie des reptiles méditerranéens; actuellement : cherche un emploi dans le domaine conservation / gestion)

Maxime DUBART(2016-2019) (thème: Coexistence dans des métacommunautés; actuellement : après un postdoc à Lille (2 ans), en contrat secteur privé en R&D /informatique)

Thomas LAMY(2008-2011) (thème: biologie des communautés et génétique des populations d'escargots d'eau douce. Actuellement : chercheur IRD Montpellier, après postdocs aux USA)

Benjamin PELISSIE (2007-2010) (thème: allocation sexuelle et sélection sexuelle chez les escargots actuellement : postdoc aux USA, récemment recruté CIRAD La Réunion)

Hélène JOURDAN (2007-2010)  (thème : biologie des métapopulations d'amphibiens; actuellement: chercheuse au CIRAD - ASTRE)

Juan ESCOBAR (2005-2008) (thème : architecture génétique, systèmes de reproduction et sénescence chez les escargots. Actuellement : chercheur à Medellin, Colombie)

Pierre-François DUYCK(2002-2005) (thème :Biologie de l'invasion et variation des traits d'histoire de vie chez les mouches; actuellement : chercheur CIRAD - La Réunion))

Benoît FACON (2000-2003) (thème: Biologie de l'invasion et variation des traits d'histoire de vie chez les escargots (actuellement : chercheur INRAE au CBGP, Baillarguet)

Marie-France OSTROWSKI (1999-2002) (thème : évolution des polymorphismes sexuels des escargots) 

Anne TSITRONE (1998-2001) (thème : conséquences de la consanguinité sur les relations hétérozygotie-valeur sélective et l'évolution de l'histoire de vie. Actuellement : chanteuse lyrique, après avoir été chercheuse INRAE au SGAP, Mauguio))

Nicolas BIERNE (1998-2001) (thème : isolement reproductif et spéciation chez les moules. Actuellement : chercheur CNRS à l'ISEM, Montpellier))

David, P.,Degletagne, C., Saclier, N., Jennan, A., Jarne, P., Plénet, S., Konecny, L., François, C., Guéguen, L., Garcia, N., Lefébure, T.*, Luquet, E.* 2022 Extreme mitochondrial DNA divergence undelies genetic conflict over sex determination. Current Biology, 32(10), 2325-2333.e6 doi : 10.1016/j.cub.2022.04.014

[It is intellectually frustrating when some theory seems to apply only to one group for no particular reason. This was the case of cytonuclear conflict theory: nuclear genes are inherited from both parents, while cytoplasmic genes (such as mitochondrial genes) are usually propagated only through eggs. The two types of genes are therefore exposed to conflicts over how much energy a hermaphrodite should spend producing female versus male gametes. We have lots of examples in plants, where mitochondria capable of suppressing pollen production evolve, triggering counter-adaptation of nuclear genes restoring pollen production. But surprisingly not a single convincing example in animals. Well, until we discovered the first one in my favourite snail, Physa acuta. The story started with an amazingly divergent mtDNA, so much so that it took us lots of double-checks to ascertain it was in the same species as the standard P. acuta mtDNA. Indeed it was, but the snails carrying it turned out to be incapable of inseminating standard P acuta, though they happily received their sperm. They had lost the male function, with practically zero sperm production and no male behavior. Among snails, P. acuta is now definitely my hero: It is the first example of cytoplasmic male sterility in animals, and it has the highest degree of molecular divergence ever observed between two mitogenomes within a eukaryotic species. This coincidence suggests that accelerated evolution has played a role in a potential evolutionary arms-race between mitochondrial and nuclear genes.]

Noël, E., Jarne, P., Glémin, S., MacKenzie, A., Ségard , A., Sarda, V., David, P. 2017. Experimental evidence for the negative effects of self-fertilization on the adaptive potential of populations. Current Biology, 27 : 237-242

[Some ideas in biology have been repeated over and over with surprisingly little evidence. This is the case of the opinion that selfing species are evolutionary dead-ends as they cannot respond to new selection pressures. We test this idea directly by comparing the reponse to artificial selection for a morphological trait in snail populations under either outcrossing and selfing, and with or without previous experience of self-fertilization. Selfing initially speeds up the response to selection, but then slows it down after a few generations while outcrossing lines continue to respond. This effect, consistent with the dead-end hypothesis, not only reflects an exhaustion of genetic variation but also an increase in nonheritable phenotypic variance under selfing. ]

Lounnas, M., Correa, A. C., Vázquez, A. A., Dia, A., Escobar, J. S., Nicot, A., Arenas, J., Ayaqui, R., Dubois, M. P., Gimenez, T., Gutiérrez, A., González-Ramírez, C., Noya, O., Prepelitchi, L., Uribe, N., Wisnivesky-Colli, C., Yong, M., David, P., Loker, E. S., Jarne, P., Pointier, J. P., Hurtrez-Boussès, S. (2017), Self-fertilization, long-distance flash invasion and biogeography shape the population structure of Pseudosuccinea columella at the worldwide scale. Molecular Ecology, 26: 887–903

[I participated in this large and collaborative microsatellite study set up by Sylvie Hurtrez-bousses and her PhD student Manon Lounnas, showing how a self-fertilizing freshwater snail can lose most of their genetic variation during invasion. Presumably originating forom North America, where its diversity is maximal, this species has colonized many places in Africa, Europe, Indian Ocean, caribbean and Pacific islands, and in all these places a single homozygous genotype is found - in sharp contrast with the situation of  invasive outcrossing snails such as Physa acuta -P88]

Lamy, T., Laroche, F., David, P., Massol, F., Jarne, P. 2017 The contribution of species-genetic diversity correlations to the understanding of community assembly rules Oikos126(6) : 759–771.

[We review the literature on correlations between species diversity and genetic diversity (SGDC) and show how they can be used to unravel community properties. We highlight the importance of spatial and temporal variation in carrying capacity and connectivity among habitat patches, and of the similarity of reponse to environmental variation and of modes of dispersal among the studied taxa, to determine the sign and intensity of SGDC. We propose statistical methods to incorporate environmental information in the analysis of SGDC in order to disentangle the processes at play  ]

David, P., Thébault, E., Anneville, O., Duyck, P.-F., Chapuis, E., Loeuille, N. 2017 Impacts of invasive species on food webs : a review of empirical data. In : Bohan, D. A., Dumbrell, A. J., Massol, F., editors, Advances in Ecological Research, 56 : 1-60. Academic Press, Oxford, U.K.

[Invasive species affect food webs by becoming new predators (top-down effect) or new prey (bottom-up) to resident species, but also by sharing prey,  thus competing with them, or sharing predators, thus exerting indirect competition. We review lots of empirical examples of these effects and come up with the idea that, regardless of the type of interaction, extreme impacts arise because of lack of coevolution combined with an invasion filter : non-coevolved species, exotic vs resident, tend to have more extreme interactions on average, in favor of either one or the other, but only when they are favorable to exotics do the latter successfully invade. Consequently, eco-evolutionary immaturity of resident food webs, due to historical isolation, recent eutrophication, lack of top-predators or of important feeding types, or anything that has kept diversity relatively low, make them prone to experience large (and irreversible) impacts of potential invaders. We discuss the potential lessons for remediation / conervation policies]

Chapuis, E., Lamy, T., Pointier, J.-P., Juillet, N., Ségard, A., Jarne, P., David, P. (2017) Bioinvasion triggers rapid evolution of life histories in freshwater snails. American Naturalist 190:5, 694-706

Calcagno, V., Jarne, P., Loreau, M., Mouquet, N., & David, P. 2017. Diversity spurs diversification in ecological communities. Nature Communications 8 : 15810

[Evolution can contribute to the diversification of regional communities through a process of adaptive radiation. This process is often said to be triggered by the availability of niche space, and to gradually slow down as diversity builds up and niches become occupied. In this theoretical study, we question this view and show that, under three classical models of species coexistence, diversification is easier when some diversity is already present than when there is only one species. This may explain the slow start observed in adaptive radiations in some insular taxa (caribbean lizards) and experimental evolution settings ]

Viard, F., David, P., Darling, J. 2016. Marine invasions enter the genomic era : three lessons from the past, and the way forward. Current Zoology, 62(6) : 629-642

[Invasion genetics comes of age, but is now renewed thanks to NGS technology. We review what these new markers have recently brought to our knowledge of marine invasions. The large numbers of loci allow to study genetic structure with high sensitivity, revealing unsuspected dicontinuities and cryptic species complexes in marine populations; and making it possible to capture the faint genetic signals of the usually very moderate founder effects in recent invaders. However their value to understand adaptive processes during invasion will depend on our ability to maintain efforts on exhaustive geographic sampling and common-garden experiments ]

Stoffel, M. A., Esser, M., Kardos, M., Humble, E., Nichols, H., David, P., Hoffmann, J. I. 2016 inbreedR : an R package for the analysis of inbreeding based on genetic markers. Methods in Ecology and Evolution 7(11), 1331-1339

[The computation of two-locus heterozygosity disequilibrium (or g2), initially described in David et al. 2007 and performed by the software RMES, is usually too long for NGS-based data. The low-computation-time approximation I initially derived for Hoffmann et al. 2014 is here made available as an R-package together with some resampling and graphic methods -thanks to the programming effort of M. Stoffel and colleagues  ]

Noël, E., Chemtob, Y., Janicke, T., Sarda, V., Pélissié, B., Jarne, P., David, P. 2016. Reduced mate availability leads to evolution of self-fertilization and purging of inbreeding depression in a hermaphrodite. Evolution, 70: 625–640

[Weexplore evolutionary scenarios of transitions from outcrossing to selfing using experimental evolution in the hermaphroditic snail Physa acuta, a preferential outcrosser. We created lines that were frequently forced to reproduce by selfing. In ca. 20 generations this regime purged an important fraction of the inbreeding depression and snails became less reluctant to self-fertilize (reduced waiting time). Thus, facultative selfing not only provides reproductive assurance, it may also create conditions that favour more selfing, potentially initiating an evolutionary transition ]

Ehlers, B. K., David, P., Damgaard, C. F. and Lenormand, T. 2016. Competitor relatedness, indirect soil effects, and plant co-existence. Journal of Ecology 104 :1126-1135

[An experiment showing that the effects of competition between an within species of two annuals (Medicago) are modified by a perennial shrub, the thyme, through chemicals released in the soil. Competition favours one or the other species depending on whether the soil has been exposed to thyme or not. In addition we observed a tendency for intraspecific competition to have less negative effects when it occurs between closely related individuals rather than unrelated ones, a characteristic that may promote local dominance of a few genotypes of each species  ]

Mousset, M., David, P., Petit, C., Pouzadoux, J., Hatt, C., Flaven, E., Ronce, O., Mignot,A. 2016Lower selfing rates in metallicolous populations of the pseudometallophyte Noccaea caerulescens in southern France than in nonmetallicolous populations. Annals of Botany,117 : 507-519

[We develop a new method to test whether two groups of populations differ in their average selfing rate and use it to show that populations of an annual plant tolerant to heavy metals have lower selfing rates in soil polluted by heavy metals near ancient mines than in the surrounding nonpolluted landscape. ]

Marie-Orleach, L., Janicke, T., Vizoso, D. B., David, P., Schärer, L. 2016, Quantifying episodes of sexual selection: Insights from a transparent worm with fluorescent sperm. Evolution, 70: 314–328.

[Macrostomum is a fantastic hermaphroditic worm, it is transparent and can be made fluorescent through GFP technology. Lucas Marie-Orleach and the team of Lukas Schärer in Basel were thus able to track the fate of individual sperm after copulation, to get a really precise decomposition of various phases of sexual selection, before and after copulation. I helped with the analyses, similar to Pélissié et al 2014; Macrostomum turns out to be another hermaphrodite where lots of the variance in male reproductive success depends on variability in the fate of sperm after copulation]

Laroche, F., Jarne, P., Lamy, T., David, P., Massol, F. 2015. A neutral theory for interpreting correlations between species and genetic diversity in communities. The American Naturalist185: 59-69

[SGDC (species-genetic diversity correlations, correlations between molecular diversity within a species and species diversity in the surrounding community) have been described in many organisms but their interpretation is usually vague. A neutral reference is lacking, to predict what would happen when competition occurs among individuals in a fragmented habitat, but without any biological difference due to species or genotype. We model this situation and show how the joint distribution of site connectivity and site carrying capacity, and the mutation rate, determine the sign and intensity of SGDC.]

Janicke, T., David, P., Chapuis, E.,2015 Environment-Dependent Sexual Selection: Bateman’s Parameters under Varying Levels of Food Availability. The American Naturalist 185 : 756-768

[Sexual selection depends on the environment, and  the availability of resources determines how reproductive and mating success can vary in a population. We show that food restriction decreases the opportunity for sexual selection and makes reproductive success less dependent on mating success in the hermaphroditic snail Physa acuta - thus decreasing the asymmetry between male and female functions with respect to sexual selection. Food restriction seems to dampen phenotypic variation rather than to enhance it, unlike other forms of stress]

Graham, S., Chapuis, E., Meconcelli, S., Bonel, N., Sartori, K., Christophe, A., Alda, P., David, P., Janicke, T., 2015 Size-assortative mating in simultaneous hermaphrodites: an experimental test and a metaanalysis. Behavioral Ecology and Sociobiology69(11), 1867-1878.

[Size-assortative mating occurs when individuals prefer to mate with similar-sized partners- but similarity within mating pairs can result from various reasons that have nothing to do with sexual preference (eg spatial autocorrelation in body size or age). We illustrated this in Physa acuta by finding no preference for similar-sized mates in controlled settings while there was a correlation in size within mating pairs collected in the field. In addition we did a metanalysis showing that evidence for size-assortative mating tends to exist only in reciprocally-copulating hermaphrodites in which mates play symmetrical roles, and therefore may both be choosy]

Burgarella, C., Gayral, P., Ballenghien, M., Bernard, A., David, P., Jarne, P., Correa, A., Hurtrez-Boussès, S., Escobar, J., Galtier, N., Glémin, S. 2015 Molecular evolution of freshwater snails with contrasting mating systems. Molecular Biology and Evolution32(9) : 2403-2416.

[Self-fertilization is thought to impair the response to selection on the long term by decreasing effective recombination. Here we studied molecular polymorphism and divergence in transcriptomes of selfing and outcrossing lineages of hermaphroditic snails. We showed that selfing snails have accumulated more nonsynonymous changes than outcrossing ones, suggesting that they have a hard time getting rid of slightly deleterious mutations,. Compared to plant studies, our snail study has the advantage that selfing is relatively ancient in the studied clade, leaving more time to accumulate changes]

Weeks, S.C., Benvenuto, C., Reed, S.K., Duff, R.J., Duan, Z.-H., David, P. 2014 A field test of a model for the stability of androdioecy in the freshwater shrimp, Eulimnadia texana. Journal of Evolutionary Biology, 27: 2080-2095

[Steve Weeks has been studying for a long time these wonderful little creatures that have evolved from dioecy to androdioecy (coexistence of males and hermaphrodites) and maintained this system for millions of years. This is a field study to test models of maintenance of androdioecy, in which the selfing rate is a crucial parameter. In order to infer selfing rates from allozyme data, I designed a modified version of the RMES program to take into account the specificity of this system, as well as the presence of a mix of sex-linked and non sex-linked loci ]

Pélissié, B., Jarne, P., Sarda, V., David, P 2014 Disentangling precopulatory and postcopulatory sexual selection in polyandrous species Evolution 68(5) : 1320-1331

[Sexual selection is a complicated matter : male reproductive success depends on how many copulations and mates they get, and when they inseminate them compared to other male competitors (precopulatory processes) and how efficient each copulation is at getting many eggs fertilized in spite of sperm competition (postcopulatory processes).  Understanding at which stage variance in male fitness is generated requires detailed observation of sexual activity, together with paternity analysis in offspring. Here we develop experimental and statistical methodology to perform this task and apply it to our favorite organism, the snail Physa acuta - showing that, although the number and timing of copulations increases male fitness, approximately 40% of the variance is generated at the postcopulatory stage  ]

Lohr, J. N., David, P., Haag, C. R. 2014 Reduced lifespan and increased ageing driven by genetic drift in small populations. Evolution 68: 2494-2508

[Under the mutation accumulation theory, genetic variance in senescence in natural populations reflects the disproportionate accumulation of deleterious mutations affecting late-expressed traits. We build a theoretical model showing that in a metapopulation this will result in faster senescence in demes with low genetic diversity (i.e. low effective size), and confirm this prediction with a large-scale molecular and common-garden study of Daphnia populations]

Janicke, T., Vellnow, N., Lamy, T., Chapuis, E., David, P. 2014 Inbreeding depression of mating behavior and its reproductive consequences in a freshwater snail Behavioral Ecology 25(2): 288-299

[Following Janicke et al. 2013, we measure how inbreeding affects both male and female mating behaviour in the hermaphrodite Physa acuta. We observe significant, but moderate inbreeding depression on the number of encounters and copulations in both roles; however it seems insufficient to explain the large impacts of inbreeding on male paternity observed in J & al 2013 - suggesting an important role for postcopulatory processes linked to ejaculate size or sperm competition.]

Hoffman, J.I., Simpson, F., David, P., Rijks, J. M., Kuiken, T., Thorne, M. A. S., Lacy, R., Dasmahapatra, K. K. 2014 High-throughput sequencing reveals inbreeding depression in a natural population. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 111: 3775-3780

[ RAD-seq technology now generates thousands of loci, that provide unprecented precision in measures of variance in inbreeding, a key parameter to understand heterozygosity-fitness correlations (HFC). I here adapted the g2 method (defined in David et al. 2007 and implemented in RMES) to highly multilocus datasets, using approximations that considerably reduce computation time. We validated this method with a dataset of captive rodents with known pedigrees, and then used it to analyse HFC in wild populations of seals. Now available as R-package, see Stoffel et al. 2016]

Bousset, L., Pointier, J.-P., David, P., Jarne, P. 2014 Neither variation loss, nor change in selfing rate is associated with the worldwide invasion of Physa acuta from its native North America Biological Invasions16:1769-1783

[A population genetic study of microsatellite diversity in Physa acuta, our pet snail, across the world. Physa acuta is an example of an outcrossing species that has invaded the world (from its probable native area in North America) without apparent loss in genetic diversity - contrasting with the case of selfing snail species such as Lymnaea columella]

Pointier, J.-P., David, P., Jarne, P. 2011 The Biological Control of the Snail Hosts of Schistosomes: The Role of Competitor Snails and Biological Invasions, Chapter 9, pp 215-238 in Biomphalaria snails and larval trematodes, ed. by Toledo, R. & Fried, B., Springer Verlag, New York

[An account of how competition by (intentionnally or fortuitously) introduced species can affect populations of Biomphalaria glabrata and other vectors of schistosomes. This contains a detailed historical account of all freshwater snail invasions that occurred in Guadeloupe and Martinique, and their impacts ]

Massol, F., Duputié, A., David, P., Jarne P. 2011. Asymmetric patch size distribution leads to disruptive selection on dispersal. Evolution 65(2): 490-500

[Most models of dispersal evolution predict a single optimum, at odds with the diversity observed in nature, even among species or genotypes inhabiting the same landscape. We show that diversification of dispersal strategies naturally occurs provided patches of favorable habitats have unequal sizes, many of them small and a few large. This condition is fulfilled by many natural landscapes]

Luquet, E., Lena, J.-P., David, P., Joly, P., Lengagne, T., Perrin, N., Plenet S. 2011 Consequences of genetic erosion on fitness and phenotypic plasticity in European tree frog populations (Hyla arborea), Journal of Evolutionary Biology, 24(1): 99-110

[We investigate the consequences of the loss of genetic diversity in small fragmented populations on the expression of an essential trait in juvenile tree frogs (tadpoles) : predator-induced plasticity. Plasticity is fully maintained, but at a higher cost, in genetically depauperate populations compared to large, more diverse ones]

Luquet, E., David, P., Léna, J.-P., Joly, P., Konecny, L., Dufresnes, C., Perrin, N., Plénet, S. 2011 Heterozygosity-fitness correlations among wild populations of European tree frog (Hyla arborea) detect fixation load. Molecular Ecology, 20: 1877-1887

[In this study of heterozygosity-fitness correlations (HFC) in frogs, HFC arises from the mixing of populations with different average heterozygosity and larval growth, rather than from differences among individuals within populations. Therefore, covariation in larval traits and heterozygosity is due to fixation load rather than to within-population polymorphism]