Thématiques de recherche

Mes travaux s’inscrivent dans la lignée d’approches pluridisciplinaires qui ont pour but d’expliquer des mécanismes éco-évolutifs en partant des gènes jusqu’aux fonctionnements des communautés via les interactions plante-plante. Au cours de ma thèse (réalisée aux laboratoires GEPV, à Lille et LIPM à Toulouse, encadrée par Fabrice Roux et Laurent Amsellem), j’ai mené des approches de génomique écologique visant à caractériser le potentiel adaptatif d’une population locale vis à vis de son environnement biotique. Notamment, en ciblant l’espèce modèle Arabidopsis thaliana, j’ai cherché à caractériser la génétique associée à la capacité compétitrice d’une population locale selon une complexité progressive d’interactions avec des espèces compétitrices.

Tout d’abord, en me focalisant sur la compétition monospécifique, j’ai montré que l’identité du compétiteur et le décalage de sa germination permettaient un maintien de diversité génétique et fonctionnelle par des phénomènes de spécialisation biotique au sein de la population-cible. Par une approche de Genome Wide Association (GWA) mapping, j’ai identifié différents QTLs de réponse à la compétition selon les conditions de compétition monospécifique. J’ai par la suite proposé plusieurs gènes candidats sous-jacents à ces QTLs. Par la suite, j’ai démontré que le contexte d’interactions plurispécifiques variant notamment selon l’assemblage et la richesse des communautés modifiait fortement la réponse à la compétition d’une population locale. De plus, j’ai pu montrer par une approche de résurrection que la réponse à la compétition d’une population locale pouvait évoluer en moins de huit générations, probablement en lien avec des changements de composition spécifique au sein de la communauté. Enfin, en me focalisant sur des suivis démographiques, phénologiques et génomiques de populations expérimentales soumises à des conditions de compétition naturelle, j’ai démontré que la dynamique adaptative d’A. thaliana pouvait être fortement influencée par l’intensité de la compétition.
J’effectue maintenant un post-doctorat visant à caractériser la variation naturelle et les déterminismes génétique de traits foliaires liés au Leaf Economic Spectrum chez A. thaliana dans un autre contexte d’interaction biotique : l’herbivorie.

Publications

The genetics of intra- and interspecific competitive response and effect in a local population of an annual plant species. Baron E., Richirt J., Villoutreix R., Amsellem L. & Roux F. Functional Ecology. 29 (10), 1361-1370.

The adaptive potential of a natural population of an annual plant species toward an invasive species depends on its surrounding community and warming. Baron E., Roux, F. & Amsellem L. In prep.

The genetic variability of response to a lag of germination time leads to different adaptive phenotypic and genomic strategies in a local population of an annual plant species. Baron E., Cailleret M., Roux F. & Amsellem L. In prep.

Impact of competition intensity on the adaptive dynamic of experimental populations of Arabidopsis thaliana in natura. Baron E., Amsellem L. & Roux F. In prep.
Rapid phenotypic evolution and fine-grained spatial heterogeneity in a natural population of Arabidopsis thaliana: a resurrection study. Villoutreix R., Le Corre V., Baron E., Amsellem L. & Roux F. In prep.