Wakinyan Benhamou

Wakinyan Benhamou

Doctorant - Université de Montpellier
CEFE (UMR 5175) - Campus du CNRS, 1919 route de Mende

Équipe Écologie & Épidémiologie Évolutive
Aile B, Étage 2, Bureau 204

À propos

J'ai intégré l'équipe EEE (Écologie & Épidémiologie Évolutive) en septembre 2021 en tant que doctorant – Université de Montpellier, École Doctorale I2S (Information, Structures et Systèmes) spécialité Biostatistique - sous la supervision de Rémi Choquet et Sylvain Gandon, au CEFE. Mon travail s'inscrit dans le champ de l'épidémiologie évolutive, à l'interface entre modèles théoriques et inférence statistique. Je m'intéresse plus particulièrement à l'étude et l'estimation des traits phénotypiques de variants pathogènes, notamment en analysant les séries temporelles des fréquences des souches en circulation au cours d'une épidémie. Dans ce cadre, plusieurs systèmes hôtes-pathogènes sont étudiés : en Santé Publique, par exemple avec le cas du SARS-CoV-2 (COVID-19), mais aussi des systèmes de microbiologie expérimentale où des cultures bactériennes sont infectées par différentes souches de bactériophage (virus de bactérie).

---- English version ----

I joined the team EEE (Evolutionary Ecology & Epidemiology) in September 2021 as a PhD student – University of Montpellier, Doctoral School I2S (Information, Structures and Systems) speciality Biostatistics - under the supervision of Rémi Choquet and Sylvain Gandon, at the CEFE. My work is in the field of evolutionary epidemiology, at the interface between theoretical models and statistical inference. I am interested more specifically in the study and the estimation of phenotypic traits of pathogenic variants, in particular through the analyses of time series of strain frequencies in the course of an epidemic. In this context, several host-pathogen systems are studied: in Public Health, for instance with the case of SARS-CoV-2 (COVID-19), but also in experimental microbiology systems where bacterial cultures are infected by different strains of bacteriophage (viruses that infect bacteria).

Intitulé du sujet de thèse

Modélisation et inférence statistique à partir de données démographiques et génétiques pour comprendre et prédire l'épidémiologie évolutive des maladies infectieuses

(Modeling and statistical inference from demographic and genetic data to understand and predict the evolutionary epidemiology of infectious diseases)