Vous êtes ici : Accueil PLATES-FORMES Terrain d'expériences French

French

Laurine Mathieu

Publication : 10 septembre 2024

en cours de construction

Vincent PORCHER

Publication : 12 août 2024


Porcher

Postdoctoral researcher

My work aims to explore biocultural interactions and cultural dynamics in tropical ecosystems while bridging gaps between local and academic knowledge systems. My research addresses the biocultural dynamics in small-scale societies' food systems articulated around three main themes: (1) The perception of climate change and the agrobiodiversity adaptation, (2) the ethnobotanical knowledge of wild food within Austronesian cultures and (3) the local ecological knowledge transfer process and biocultural heritage.

To address these thematic, I use interdisciplinary approaches borrowing methods from botany and ecology (voucher, GIS, transect) to ethnobotany, cognitive anthropology and linguistics (surveys, free listing, pile sorting, drawings interviews, participatory observation) using both qualitative and quantitative data.

courriel : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

Lire la suite : Vincent PORCHER

Jade ZANUTTO

Publication : 5 juillet 2024

 ZANUTTO Jade

Ingénieur d'étude au CNRS

J'ai intégré l’équipe IBT (Interactions Biotiques) du CEFE à Montpellier en tant qu’ingénieur d’études, sous la direction de Maryse Vanderplanck. Nos objectifs de recherche sont la caractérisation approfondie de l’exposome des abeilles et de leur réponse physiologique et comportementale, avec comme modèles d’étude principaux Bombus terrestris et Osmia comuta.

 

Courriel : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

Lire la suite : Jade ZANUTTO

Lucas DUBUS

Publication : 12 juin 2024

photo Lucas terrain

Doctorant EPHE - PSL / Beauval Nature

Étage 1 - Aile C - Bureau 114

Contact: Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

Supervisor : Stéphanie Manel (CEFE, EPHE - PSL)

L’objectif général de la thèse est d’améliorer l'état des connaissances sur le lamantin d’Afrique (Trichechus senegalensis) au sein du Parc National de Conkouati-Douli (PNCD) afin de guider les actions favorables à sa conservation (sensibilisation, méthodes de pêche, activités alternatives, …) tout en prenant en compte les impacts socio-économiques. L’aspect cryptique et méconnu de cette espèce menacée d’extinction nécessite un couplage de différentes méthodes de suivi non-destructifs ni invasifs (observation visuelle, acoustique, génomique), dont certaines sont nouvelles (ADN environnemental). Ce suivi aura pour but, d’une part, de mieux connaître les besoins écologiques de l’espèce, son habitat, et sa distribution au sein du parc ; d’autre part, il permettra d’estimer des indices de l’abondance de la (ou les) population(s) de lamantin présente(s) au sein du PNCD. Finalement les résultats de ce projet permettront de proposer des mesures d’évitement, de réduction ou de compensation des menaces qui pèsent sur l’espèce tout en limitant les effets négatifs pour la population humaine locale.
 
Objectif 1 : Caractériser la distribution de l’espèce en lien avec l’environnement (paramètre physico-chimiques, végétation, pressions anthropiques, …) et proposer un modèle d’occurrence au sein du parc et une cartographie.
Nous chercherons à identifier les besoins écologiques de l'espèce au sein du PNCD, sa répartition en vue d'établir une carte de probabilité d'occurrence.
 
Objectif 2 : Estimer la taille de la population de lamantins dans le parc grâce à la génomique.
Nous analyserons la structure et la diversité génétique du Lamantin au sein de PNCD. Nous estimerons également un indice de taille de l'échantillon que nous avons.
 
Objectif 3 : Apport de l’acoustique dans la caractérisation spatiale et saisonnière de l’habitat du Lamantin, la caractérisation des individus et l’apport pour un indice d’abondance en lamantins, et comparaison avec les résultats génétiques.
Nous testerons la capacité de l’approche acoustique à identifier individuellement les lamantins ainsi qu’à obtenir une estimation de la taille de population. Les résultats seront comparés à ceux obtenus par le suivi génétique (Objectif 2).
 
Objectif 4 : Proposer un programme de conservation et identifier les zones de protection prioritaire en interaction avec les populations pour en limiter les impacts socio-économiques.
Nous utiliserons alors les connaissances acquises sur la répartition spatiale et l’abondance du Lamantin d’Afrique dans le PNCD (Objectifs 1, 2 & 3) pour guider les actions de conservation de l’espèce dans le parc.
 
---English---
 
Thesis projet : Characterize the distribution and population size of the African manatee, a threatened species, in Conkouati-Douli National Park, Republic of the Congo
 
The general objective of the thesis is to improve the knowledge about the African manatee (Trichechus senegalensis) within Conkouati-Douli National Park (CDNP) in order to guide conservation actions (awareness, fishing methods, alternative activities, etc.) while considering socio-economic impacts. The cryptic and poorly understood nature of this threatened species necessitates a combination of different non-destructive and non-invasive monitoring methods (visual observation, acoustic, genomic), some of which are new (environmental DNA). This monitoring aims to better understand the ecological needs of the species, its habitat, and its distribution within the park, as well as to estimate indices of manatee population abundance within the CDNP. Ultimately, the results of this project will enable the proposal of avoidance, reduction, or compensation measures for threats to the species while minimizing negative effects on the local human population.
 
Objective 1: Characterize the species distribution in relation to the environment (physico-chemical parameters, vegetation, anthropogenic pressures, etc.) and propose an occurrence model within the park along with mapping.
We will seek to identify the ecological needs of the species within the CDNP, its distribution to establish a probability map of occurrence.
 
Objective 2: Estimate the size of the manatee population in the park using genomics.
We will analyze the genetic structure and diversity of the manatee within the CDNP. We will also estimate a sample size index that we have.
 
Objective 3: Contribution of acoustics to the spatial and seasonal characterization of manatee habitat, individual characterization, and contribution to a manatee abundance index, and comparison with genetic results.
We will test the ability of the acoustic approach to individually identify manatees and to obtain an estimation of the population size. Results will be compared with those obtained through genetic monitoring (Objective 2).
 
Objective 4: Propose a conservation program and identify priority protection areas in interaction with populations to mitigate socio-economic impacts.
We will use the knowledge gained about the spatial distribution and abundance of the African manatee in the CDNP (Objectives 1, 2 & 3) to guide species conservation actions in the park.

 

Nadia FAURE

Publication : 12 juin 2024

Photo Nadia small

Doctorant EPHE - PSL / Beauval Nature

Étage 1 - Aile C - Bureau 114

Contact: Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

Google Scholar – ResearchGate – ORCID

Supervisor : Stéphanie Manel (CEFE, EPHE - PSL)

Thesis project: Genetic diversity and conservation of threatened marine species: exploring innovative solutions

 The main objectives of this thesis are: (1) to develop genomic tools adapted to the monitoring of threatened populations and (2) to improve existing genetic diversity indicators in order to provide relevant and accessible information to conservation stakeholders. This second point will seek to valorise the intra-specific genetic component, which is still neglected when assessing the status of IUCN species and guiding conservation decisions. These approaches will be applied specifically to two marine species on the IUCN Red List in the Mediterranean: the angelshark (Squatina squatina) and the bottlenose dolphin (Tursiops truncatus). Genomic analysis of angelshark populations will be based on tissue samples from individuals caught accidentally by fishers, given the difficulty of sampling genetic material from this rare shark. For bottlenose dolphin populations, we will develop an eDNA capture-hybridization method to generate Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) genomic data from eDNA sampled behind dolphin pods by seawater filtration. This latest approach, still at the proof-of-concept stage, will allow us to examine the performance of this non-invasive technique for obtaining intra-specific genetic information. It could replace traditional sampling methods that require tissue collection from living organisms, which runs counter to efforts to conserve imperiled species.

Publications

Faure, N., Manel, S., Macé, B., Arnal, V., Guellati, N., Holon, F., Barroil, A., Pichot, F., Riutort, J-J., Insacco, G., Zava, B., Mouillot, D., Deter, J. (2023). An environmental DNA assay for the detection of Critically Endangered angel sharks (Squatina spp.). Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 33(10), 1088-1097. https://doi.org/10.1002/aqc.3954

Mathon, L., Marques, V., Manel, S., Albouy, C., Andrello, M., Boulanger, E., ... Faure, N., … & Mouillot, D. (2023). The distribution of coastal fish eDNA sequences in the Anthropocene. Global Ecology and Biogeography, 32(8), 1336-1352. https://doi.org/10.1111/geb.13698

CEFE
Recherche
te1.jpg

Equipe TE

Responsable scientifique
François VASSEUR

Responsable technique
Thierry MATHIEU

Equipe technique :
Pierrick AURY
David DEGUELDRE
Pauline DURBIN
Lola GEORGE
Fabien LOPEZ

Pour contacter la plateforme
Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
tél : 04 67 61 32 21
port : 06 12 74 20 61