Guides et tutoriels

Virginie MOLINIER

CEFE/CNRS Campus du CNRS

Aile C, bureau 214

1919, route de Mende

34293 Montpellier 5

Tél : +33/0 4 67 61 32 31

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Mots clés (par ordre alphabétique) : Biologie des organismes, Biologie évolutive, Biologie moléculaire, Biologie végétale, Composés organiques volatils, Écologie, Génétique des populations, Génotypage, Microsatellites, Mycologie, Phylogénie, Phylogéographie.

 

Depuis septembre 2017, je suis Attachée Temporaire d’Enseignement et de Recherche (ATER) au sein du département Biologie Ecologie de l’Université de Montpellier et rattachée au CEFE au sein de l’équipe Interactions Biotiques.

Mes travaux de recherche s’inscrivent dans des thématiques de biologie évolutive ; science qui regroupe, entre autres, la phylogénie ou encore la génétique des populations ainsi que l’écologie évolutive. À travers l’utilisation d’outils et concepts de biologie moléculaire, de génétique des populations et d’écologie, mon but est à la fois d’identifier la structuration génétique et la diversité existante au sein des populations d’une espèce donnée mais aussi de comprendre les facteurs environnementaux, biotiques et abiotiques ; qui sous‐tendent cette structuration spatiale et temporelle.

Mon premier stage en laboratoire, effectué durant le Master 1 au sein du Laboratoire EDB de Toulouse, m’a permis de découvrir les approches de biologie évolutive en étudiant la diversité génétique des champignons mycorhiziens à arbuscules associés à Arum italicum. A l’issu de ce stage, j’ai complété mon expérience par le stage de Master 2 Recherche. Portant sur la phylogéographie de la coccinelle à sept points toujours au sein du laboratoire EDB. Cette étude m’a permis de découvrir de nouvelles techniques de biologie moléculaire mais aussi de mener de façon plus autonome un projet de recherche. Suite à cette expérience, j’ai obtenu une bourse de thèse (Jeunes chercheurs entrepreneurs) sur Dijon au sein de l’UMR Agroécologie. Enfin, début 2014, j’ai effectué un contrat post-doctoral de deux ans et demi en Suisse à l’Institut Fédéral WSL de Birmensdorf au sein de l’unité de recherche Dynamique Forestière.

En doctorat et en post-doctorat, j’ai principalement abordé les approches et réflexions de biologie évolutive à travers l’étude d’un champignon ectomycorhizien; Tuber aestivum (la truffe de Bourgogne). Cependant, durant mon contrat postdoctoral, j’ai pu participer à des projets annexes portant sur d’autres modèles biologiques et qui m’ont permis à la fois de poursuivre mes réflexions sur cette thématique principale, mais aussi de découvrir de nouvelles thématiques comme l’écologie fonctionnelle par exemple.

Projets :

Master 1 (2008) : Etude de diversité des champignons endomycorhiziens associés à Arum italicum. UMR EDB Université Paul Sabatier, Toulouse, France. Superviseurs: Patricia Jargeat & Marc Gibernau,.

Master 2 (2009) : Etude de phylogéograhie de la coccinelle à sept points (Coccinella septempuncta). UMR EDB Université Paul Sabatier, Toulouse, France. Superviseur : Brigitte Crouau-Roy.

Doctorat (2010-2013) : Etude de la diversité aromatique et génétique de Tuber aestivum (Vitt.). UMR Agroécologie INRA/CNRS/AgroSup/Université de Bourgogne, Dijon, France. Superviseur : Daniel Wipf.

Post-Doctorat (2014-2016) :  Treasures of the forest: Towards understanding life history of Burgundy truffles (COST ACTION FP1203). Institut Fédéral de Recherche WSL, Unité de Recherche Dynamique Forestière, Birmensdorf, Suisse. Superviseurs: Simon Egli, & Martina Peter.

Enseignement

  • 2017-2018 : ATER temps plein (192h), Université de Montpellier

Biologie Intégrative / Niveau L1 :

Cycles de Vie / Niveau L1 

Ecologie Fonctionnelle / Niveau L2 

Interactions Sol / Organismes / Niveau L3 :

Biologie des organismes unicellulaires et champignons / Niveau L3 :

Biologie, écologie, évolution des champignons / Niveau L3

Projets tuteurés / Niveau L3

Populations, Communautés, Interactions / Niveau Master

Ecologie des forêts tropicales / Niveau Master 2 

  • 2015 : Participation au module'Biology and Ecology of Forest Fungi'(551-0421-00) ETH-Zürich, Dept. Biology (Bachelor course / Partie TP)
  • 2012 : Vacataire au sein de l’UFR SVTE de l’Université de Bourgogne.

TP Biologie Végétale / Niveau L1: Anatomie des structures primaires et secondaires des végétaux et leurs mises en place

TP Ecologie Biogéographie / Niveau L2

TD Ecologie Biogéographie / Niveau L2

Publications

Publications dans des revues à comité de lecture                                                          

  • 2017

Ulf Büntgen, István Bagi, Oszkár Fekete, Virginie Molinier, Martina Peter, Richard Splivallo, Maryam Vahdatzadeh, Franck Richard, Claude Murat, Willy Tegel, Ulrich Stobbe, Fernando Martínez-Peña, Ludger Sproll, Lisa Hülsmann, Daniel Nievergelt, Barbara Meier, Simon Egli New Insights into the Complex Relationship between Weight and Maturity of Burgundy Truffles (Tuber aestivum) (2017) PloS one doi.org/10.1371/journal.pone.0170375

Barbara Moser, Ulf Büntgen, Virginie Molinier, Martina Peter, Ludger Sproll, Ulrich Stobbe, Willy Tegel, Simon Egli “Ecological indicators of Tuber aestivum habitats” (2017) Fungal Ecology

  • 2016

Frank Hagedorn, Jobin Joseph, Martina Peter, Jörg Luster, Karin Pritsch, Uwe Geppert, Rene Kerner, Virginie Molinier, Simon Egli, Marcus Schaub, Jian-Feng Liu, Maihe Li, Krunoslav Sever, Markus Weiler, Rolf TW Siegwolf, Arthur Gessler, Matthias Arend (2016) Recovery of trees from drought depends on belowground sink control. Nature Plants doi:10.1038/nplants.2016.111

Martina Peter, Annegret Kohler, Robin A Ohm, Alan Kuo, Jennifer Krützmann, Emmanuelle Morin, Matthias Arend, Kerrie W Barry, Manfred Binder, Cindy Choi, Alicia Clum, Alex Copeland, Nadine Grisel, Sajeet Haridas, Tabea Kipfer, Kurt LaButti, Erika Lindquist, Anna Lipzen, Renaud Maire, Barbara Meier, Sirma Mihaltcheva, Virginie Molinier, Claude Murat, Stefanie Pöggeler, C Alisha Quandt, Christoph Sperisen, Andrew Tritt, Emilie Tisserant, Pedro W Crous, Bernard Henrissat, Uwe Nehls, Simon Egli, Joseph W Spatafora, Igor V Grigoriev, Francis M Martin (2016) Ectomycorrhizal ecology is imprinted in the genome of the dominant symbiotic fungus Cenococcum geophilum. Nature Communications doi:10.1038/ncomms12662.

Virginie Molinier, Claude Murat, Andri Baltensweiler, Ulf Büntgen, Francis Martin, Barbara Meier, Barbara Moser, Ludger Sproll, Ulrich Stobbe, Willy Tegel, Simon Egli, Martina Peter Fine-scale genetic structure of natural Tuber aestivum sites in southern Germany. Mycorrhiza 10.1007/s00572-016-0719-y.

  • 2015

Virginie Molinier, Claude Murat, Martina Peter, Armelle Gollotte, Herminia De la Varga, Barbara Meier, Simon Egli, Beatrice Belfiori, Francesco Paolocci, Daniel Wipf (2015) SSR-based identification of genetic groups within European populations of Tuber aestivum Vittad. Mycorrhiza doi: 10.1007/s00572-015-0649-0.

Virginie Molinier, Claude Murat, Henri Frochot, Daniel Wipf, Richard Splivallo. (2015) Fine‐scale spatial genetic structure analysis of the black truffle Tuber aestivum and its link to aroma variability Environmental Microbiology doi: 10.1111/1462-2920.12910.

  • 2013

Virginie Molinier, Claude Murat, Emmanuelle Morin, Armelle Gollotte, Daniel Wipf, Francis Martin (2013). First identification of polymorphic microsatellite markers in the Burgundy truffle, Tuber aestivum Vittad., using direct shotgun pyrosequencing. Applications in Plant Sciences. http://dx.doi.org/10.3732/apps.120022.

Virginie Molinier, Diederik van Tuinen, Gérard Chevalier, Armelle Gollotte, Daniel Wipf, Dirk Redecker (2013) A multigene phylogeny demonstrates that Tuber aestivum and Tuber uncinatum are conspecific. Organisms Diversity and Evolution (DOI) 10.1007/s13127-013-0146-2.

Virginie Molinier, Marie-Lara Bouffaud, Thierry Castel, Arnaud Mounier, Annie Colombet, Ghislaine Recorbet, Henri Frochot, Daniel Wipf (2013) Monitoring the fate of a 30-year-old truffle orchard in Burgundy: from Tuber melanosporum to Tuber aestivum. Agroforestry Systems 87 (6), 1439-1449.

  • 2012

Richard Splivallo, Rittersma R, Valdez N, Chevalier G, Virginie Molinier, Wipf D, Karlovsky P (2012). “Is climate change or diverging cultural perception altering the geographical distribution of truffles?” Frontiers in Ecology and the Environment, 10: 461–462. http://dx.doi.org/10.1890/12.WB.020.

Chapitre de livre

Virginie Molinier, Martina Peter, Ulrich Stobbe and Simon Egli The Burgundy truffle (Tuber aestivum syn. uncinatum) – a truffle species with a wide habitat range over Europe, in True Truffles (Tuber spp.) of the World, Alessandra Zambonelli, Mirco Iotti, Claude Murat (Eds), Soil Biology Vol. 47, Springer, In press

Publication dans des périodiques sans comité de lecture

Virginie Molinier, Christine Strullu-Derrien et Claude Murat “Retour d’Alba : des journées riches en sciences mais aussi en découvertes oenogastronomiques” Le Trufficulteur, n°95, 4ème Trimestre 2015