Directeur de Recherche ( DR1)/Directeur du CEFE

Mes travaux portent sur la compréhension de la régulation du fonctionnement des écosystèmes terrestres en terme de flux de matière (eau, carbone, nutriments…). Initialement centrées sur les écosystèmes méditerranéens, mes activités ont été élargies à d’autres écosystèmes subissant de très fortes contraintes (les hauts plateaux andins). 

My research focuses on the understanding of terrestrial ecosystems functioning in terms of fluxes (water, carbon, nutrients...). Initially centered on Mediterranean ecosystems, my research activities have been extended to the Andean highlands).

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Mots-clés:Ecologie fonctionnelle-  Changements planetaires -   Méditerranée - Andes - Quercus -  Chenopodium quinoa - Spectroscopie proche infrarouge

Key-words:Functional Ecology - Global Change - Mediterranean Basin - Andes -Quercus - Chenopodium quinoa - NIRS

Chargée de recherche (CR1) 

Responsable de l’équipe BIOFLUX

Campus du CNRS

1919, route de Mende
34293 Montpellier 5
tel:+33 (0)4 67 61 32 43
fax:+33 (0)4 67 41 33 36

e-mail: Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

Mots clés : 

Macroinvertébrés du sol, Diversité, Rôle fonctionnel (Structuration des sols, Décomposition des litières), Perturbations anthropiques et changements globaux, Traits biologiques, écologiques et fonctionnels

John D. Thompson

Directeur de recherches, première classe

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Programme de recherche

Depuis le début ma carrière de scientifique à Montpellier en 1989 mes recherches se placent toujours dans le cadre historique, bio-géographique et paysager particulièrement fascinant de la région Méditerranéenne et se focalisent sur l’écologie, l’évolution et la conservation de la flore.

Dans cette région les changements historiques et contemporains pourraient avoir des conséquences profondes aussi bien pour la dynamique et la viabilité des populations et des communautés, que pour la capacité de réponse évolutive rapide des espèces, aspect scientifique trop souvent négligé. n élément clé dans mes recherches concerne mon investissement dans une recherche qui s'articule autour de collaborations interdisciplinaires très étroites (sciences humaines) et l'animation d'une interface fonctionnelle entre problématique scientifique et enjeux de conservation.

Ces recherches s’articulent autour des thèmes suivants :

• L’application de notre connaissance sur l’évolution de la flore à la conservation conservation du potentiel évolutif.
• L’ évaluation de l’état de conservation des populations d’espèces rares, endémique où en limite d’aire.
• La connaissance de la niche fine des espèces en tant que connaissance fondamentale pour la gestion de la flore.
• L’analyse des interfaces entre connaissances écologique, perceptions culturelles et savoirs-faire locaux (notamment pour la cueillette) dans la conservation de la flore.

Actuellement je mène des recherches dans le cadre du programme « Transitions écologiques et flore protégée : la gestion conservatoire à l’échelle de la niche (TRANECOL) financé par l’OFB et le CEMEB. Ce programme a pour but d’analyser la variabilité de la niche des espèces végétales protégées en situations de transitions écologiques où le fonctionnement des milieux est particulièrement contrasté en région méditerranéenne: en l’occurence la mosaïque de milieux côtiers où la micro-topographie et la salinité varie de manière très forte sur des espaces très restraints, les gradients d’altitude en arrière pays et sur les écotones entre grands types de substrat. L’objectif ici est d’informer les stratégies et actions des gestionnaires sur l’importance d’identifier la niche écologique des espèces à l’échelle très fine du fonctionnement des individus en milieu hétérogène.

Notre travail se fait en étroite collaboration avec les gestionnaires dans trois contextes :

• le territoire du Parc National du Mercantour,
• la Réserve Naturelle Régionale de Sainte Lucie et d’autres sites sur le territoire du Parc Naturel Régional de la Narbonnaise en Méditerranée,
• le site Natura 2000 de la Grande Maïre à Portiragnes dont la gestion est attribuée à la Communauté d’Agglomération Hérault Méditerranée et d’autres espaces de près salés sur le pourtour Méditerranéen.

Plant Evolution in the Mediterranean

My first book - Plant Evolution in the Mediterranean - was published in 2005. It provided the first synthetic account of the majors processes of evolution in the Mediterranean flora in relation to the history and ecology of the region. It analyzed patterns of species’ distributions and traits in the evolution of the remarkable diversity and degree of endemism that characterize the Mediterranean flora.

Ever since 2005 here has been an immense amount of new and fascinating work on the history, ecology, and evolution of the Mediterranean flora. During this time, human impacts have continued to increase dramatically, significantly influencing both the ecology and evolution of the region’s biota.

My second book, Plant Evolution in the Mediterranean - Insights for conservation, published in 2020 represents a comprehensive update on these issues.

This is not a traditional book on plant evolution, but rather a novel integration of a diverse and scattered literature to produce a synthetic account of Mediterranean plant evolutionary ecology that maintains the accessible style of the previous version but in a new structural framework. History, ecology, biogeography, and evolution are all set in the context of a dramatically increasing footprint. I argue how an understanding of the evolutionary ecology of the region’s flora can be used to provide insights into its conservation and management.

Conseils scientifiques

Sur le thème de la protection de la nature en région Méditerranéenne et ces montagnes, j’ai établi les liens très forts avec les gestionnaires de sites et d’aires protégées. Cet engagement se concrétise par mon rôle en tant que président de deux conseils scientifiques et membre de deux autres.

• Président

Conseil scientifique du Parc National du Mercantour

Conseil scientifique du Parc Naturel Régional de la Narbonnaise en Méditerranée

• Membre

Conseil scientifique du Conservatoire Botanique National Méditerranéen

Conseil scientifique du Parc National des Calanques

A lire

Raevel, V., Munoz, F., Pons, V., Renaux, A., Martin, A. & Thompson, J.D. 2013. Changing assembly processes during a primary succession of plant communities on Mediterranean roadcuts. Journal of Plant Ecology, 6, 19-28.

Thompson, J. D., Charpentier, A., Bouguet, G., Charmasson, F., Roset, S., Buatois, B., Vernet, P. & Gouyon, P.-H. 2013. Evolution of a genetic polymorphism with climate change in a Mediterranean landscape. Proceedings of the National Academy of Science (USA), 110, 2893-2897.

Gauthier, P., Foulon, Y., Jupille, O. & Thompson, J.D. 2013. Quantifying vulnerability to assess priorities for conservation management. Biological Conservation,158, 321-325.

Berjano R., Gauthier P., Fisogni A., Doblas, D., Pons V. & Thompson J.D. 2013. Mate limitation in populations of the endangered Convolvulus lineatus L.: a case for genetic rescue ? Journal for Nature Conservation, 21, 334-341.

Schatz, B. Gauthier, P. Debussche, M. & Thompson, J.D. 2014. A decision tool for listing species for protection on different geographic scales and administrative levels. Journal for Nature Conservation, 22, 75-83

Borie, M., Mathevet, R., Letourneau, A., Ring, I., Thompson^,J.D. & Marty, P. 2014. Exploring the contribution of fiscal transfers to protected area policy. Ecology and Society, 19(1): 9. http://dx.doi.org/10.5751/ES-05716-190109

Mathevet, R., Thompson, J.D., Folke, C. & Chapin III, F.S. 2016 Protected areas and their surrounding territory: socio-ecological systems in the context of ecological solidarity. Ecological Applications, 26, 5-16.

Pironon, S. Papuga, G., Villellas, J., Angert, A.L., García, M.B. & Thompson, J.D. 2017. Geographic variation in genetic and demographic performance: new insights from the analysis of an old biogeographical paradigm. Biological Reviews, 92, 1877-1909.

Bigard, C., Pioch, S. & Thompson, J.D. 2017. The inclusion of biodiversity in impact assessment for urban development projects: policy-related progress limited by gaps and blurred by semantic confusion. Journal of Environmental Management, 200, 35-45.

Vimal, R., Fonderflick, J., Thompson, J.D., Pluvinet, P., Debussche, M., Cheylan, M., Géniez, P., Mathevet, R., Acquarone, A., & Lepart, J. 2018. Integrating habitat diversity into species conservation in the Mediterranean mosaic landscape. Basic and Applied Ecology, 22, 36–43. 

Thompson, J.D., Gauthier, P., Papuga, G., Pons, V., Debussche, M. & Farris, E. 2018. The conservation significance of natural hybridisation in Mediterranean plants: from a case study on Cyclamen (Primulaceae) to a general perspective. Plant Biology, 20 (Suppl. 1), 128-138.

Papuga, G. Gauthier, P., Pons, V., Farris, E. & Thompson, J.D. 2018. Eological niche differentiation in peripheral populations: a comparative analysis of eleven Mediterranean plant species, Ecography, 41, 1-15.

Thompson, J.D., Amiot, J., Borron, C., Linhart, Y.B., Keefover-Ring, K. & Gauthier, P. 2019. Spatial heterogeneity of gall formation in relation to chemotype distribution in Thymus vulgaris.Plant

Gauthier, P., Bernard, C. & Thompson, J.D. 2019. Assessing landscape vulnerability for populations of listed Mediterranean plants. Journal for Nature Conservation,51, Article 125736.

Gauthier, P., Pons, V., Fisogni, A., Murru, V., Berjano, R., Dessena, S. Maccioni, A., Chelo, C., Doncieux., A., Papuga, G. & Thompson, J.D. 2019. Monitoring population dynamics in rare and endangered Mediterranean plants. Journal for Nature Conservation,52, Article 125758.

Bigard, C., Thiriet, P., Pioch, S. & Thompson, J.D. 2020. Strategic landscape-scale planning to improve mitigation hierarchy implementation: an empirical case study in Mediterranean France. Land-Use Policy, 90, Article 104286.

Thompson, J.D. & Mathevet, R. 2017. Solidarité écologique. Espaces Naturels, 58, 13.

A regarder

Fleurs sauvages de la Méditerranée, « Sous le soleil ». ARTE 2019 https://www.arte.tv/fr/videos/069769-001-A/les-secrets-des-fleurs-sauvages-sous-le-soleil/

GO DIRECTLY TO:  Who am I? / Main research projects / Publications

Research areas

- evolution and diversification of animal color patterns 

- evolutionary & computational aesthetics (aesthetic theory of efficient processing applied to artworks, plants and animals)

- processing bias (sparse coding, efficient categorization)

- models of animal vision (colour vision, pattern recognition)

- proximate mechanisms of mate choice

- Methods: Artificial intelligence for neuroscience and evolutionary ecology

Who am I?

I am an evolutionary biologist, cognitive scientist and naturalist. My main objective is to understand how do evolve complex and extravagant visual signals such as the eyespots of the peacock, the danse of the birds of paradise, and some artworks in humans. My research hypothesis is beauty. Using approaches of empirical psychology, computational neuroscience, artificial intelligence and philosophy of aesthetics, my goal is to identify the biological mechanisms underlying the beauty judgment in order to develop mechanistic models that predict this judgement. I then transfer these models to other animals to understand how beauty influences behaviors and, ultimately, the evolution of communication signals in nature.

I am also working on methods to characterize visual phenotypes, with applications in community ecology, evolutionary biology and systematics. I am particularly interested in how to use artificial intellgience to describe visual phenotypes and to model animal vision.

I am also conducting or participating to several research projects in ornithology (mostly on searbirds) and ichthyology (fish, and in particular gobies, of the Northeastern Atlantic and the Mediterranean region). 

Main research projects

WildCom-AI (ANR 2020-2024) - Artificial Intelligence for Studying Communication in Wild Animals (PI: J Renoult)

Darters (NSF 2020-2024)- Pattern preferences, information theory, and the evolution of signal design (PI: T Mendelson & J Renoult)

CBIRDS (2024-2027)-Monitoring climate change impacts on Antarctic biodiversity.  (PI: JY Barnagaud.)

POMAR (2023-) Phylogenetics and taxonomy of sand gobies Pomatoschistus spp.. (PI: E Delrieu-Trottin & J Renoult)

Current students and post-docs

Erwan Harscouet (PhD candidate)

Publications (* equal contribution)

Visual ecology & evolution

SILVA, N. J., FERREIRA, A. C., SILVA, L. R., PERRET, S., TIEO, S., RENOULT, J. P., COVAS, R., & DOUTRELANT, C. (2024). A deep learning approach to detect and visualize sexual dimorphism in monomorphic species. bioRxiv, 2024-10.

BRICHARD, Y. H., RAYMOND, M., CUTHILL, I. C., MENDELSON, T. C., & RENOULT, J. P. From natural to sexual selection: Revealing a hidden preference for camouflage patterns. bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2023.09.27.559753

HÉJJA-BRICHARD, Y., MILLION, K., RENOULT, J. P.*, & MENDELSON, T. C.* (2024). Using neural style transfer to study the evolution of animal signal design: A case study in an ornamented fish. Ecological Informatics,https://doi.org/10.1016/j.ecoinf.2024.102881

HEJJA-BRICHARD, Y., RENOULT, J., & MENDELSON, T. (2024). Comparative analysis reveals assortative mate preferences in darters independent of sympatry and sex. Ecology & Evolution. 14(10), e11498.

TIEO, S., DEZEURE, J., CRYER, A., LEPOU, P., CHARPENTIER, M. J., & RENOULT, J. P. (2023). Social and sexual consequences of facial femininity in a non-human primate. Iscience, 26(10).

BYBEE, S.M., FUTAHASHI, R., RENOULT, J.P., SHARKEY, C., SIMON, S., SUVOROV, A., WELLENREUTHER, M. (2023). Transcriptomic insights into Odonata ecology and evolution. In Dragonflies and Damselflies, 2nd Ed. (CORDOBA-AGUILA, A., BEALTY, C.D., BRIED, J.T.). Oxford University Press. [Book chapter] [PDF]

CHARPENTIER, M.J.E, POIROTTE, C., ROURA-TORRES, B., AMBLARD-RAMBERT, P., WILLAUME, E., KAPPELER, P.M., ROUSSET, F., RENOULT, J.P. (2022) Mandrill mothers associate with infants who look like their own offspring using phenotype matching. Elife. 11, e79417

LANGLOIS, J., GUILHAUMON, F., BALETAUD, F., CASAJUS, N., […], RENOULT, J.P., […], MOUQUET, N. (2022). Global mismatch between the aesthetic value of reef fishes and their conservation priorities. Plos Biology. 20(6):e3001640.

HULSE S.V., RENOULT, J.P., MENDELSON T.M. (2022). Using deep neural networks to model similarity between visual patterns: application to fish sexual signals. Ecological Informatics. 67:101486 [PDF]

CHARPENTIER M.J., HARTE M., POIROTTE C., DE BELLEFON J.M., LAUBI B., KAPPELER P.M., RENOULT J.P. (2020). Same father, same face: deep-learning reveals paternally-derived signalling of kinship in a wild primate. Science Advances. 6, eaba3274. [PDF]

DUFOUR P., GUERRA CARANDE J., RENAUD J., RENOULT J.P., LAVERGNE S., CROCHET P.-A. (2020). Plumage colouration in gulls responds to their non-breeding climatic niche. Global Ecology and Biogeography. 29: 1704-1715. [PDF]

JOFFARD N., LE RONCE I., LANGLOIS A., RENOULT J.P., BUATOIS B., DORMONT L., & SCHATZ B. (2020). Floral trait differentiation in Anacamptis coriophora: phenotypic selection on scents, but not on colour. Journal of Evolutionary Biology. 33: 1028-1038.

BLIARD L., PAQUET M., ROBERT A., DUFOUR P.,
 RENOULT J.P.,
 GREGOIRE A., CROCHET P.-A., COVAS R., DOUTRELANT C. (2020). Examining the link between relaxed predation and bird colouration on islands. Biology Letters. 16: 20200002.

FERREIRA A.C., SILVA L.R., RENNA F., BRANDL H.B., RENOULT J.P., FARINE D.R., COVAS R., DOUTRELANT C. (2020). Deep learning-based methods for individual recognition in small birds. Methods in Ecology & Evolution. 11: 1072-1085.

DE SOLAN T., RENOULT J.P., GENIEZ P., DAVID P., & Crochet P.A. (2020). Looking for mimicry in a snake assemblage using deep learning. The American Naturalist. 196: 74-86. [PDF]

HULSE S.V., MENDELSON T.C.*, RENOULT J.P.*. (2020). Sexual signals of fish species mimic the spatial statistics of their habitat: evidence for processing bias in animal signal evolution. Nature Communications. 11: 1-8. [

RENOULT J.P., KELBER A., SCHAEFER H.M. (2017). Colour spaces in ecology and evolutionary biology. Biological Reviews. doi: 10.1111/brv.12230 [PDF]

BINKENSTEIN J., STANG M., RENOULT J.P., SCHAEFER H.M. (2017). Weak correlation of flower color and nectar-tube depth in temperate grassland. Journal of Plant Ecology. 10 : 397-405

DOUTRELANT C., PAQUET M., RENOULT J.P., GREGOIRE A., CROCHET P.-A., COVAS R. (2016). Worldwide patterns of bird colouration on islands. Ecology Letters. 19: 537-545.

RENOULT J.P., VALEUR B. (2015). Les couleurs de la vie – Mécanismes de production, fonctions et diversité. L’Actualité Chimique. 397-398 : 12-18.

RENOULT J.P., BLÜTHGEN N., BINKENSTEIN J., WEINER C.N., WERNER M., SCHAEFER H.M. 2015. Linking community to sensory ecology: the relative importance of color signaling for plant generalization in pollination networks. Oikos. 124: 347-354. [PDF]

RENOULT J.P., VALIDO P., JORDANO P., SCHAEFER M. (2014). Adaptation of flower and fruit colours to diversified mutualists. New Phytologist. 201: 678-686. [PDF]

RENOULT J.P., THOMANN M., SCHAEFER H.M., CHEPTOU P.-O. (2013). Selection on quantitative colour variation in Centaurea cyanus: the role of the pollinator’s visual system. Journal of Evolutionary Biology. 26: 2415-2427.

RENOULT J.P., COURTIOL A., SCHAEFER H.M. (2013). A novel framework to study colour signaling to multiple species. Functional Ecology. 27: 718-729. [PDF]

BINKENSTEIN J., RENOULT J.P., SCHAEFER H.M. (2013). Increasing land-use intensity decreases floral colour diversity and changes composition of plant communities in temperate grasslands. Oecologia, 173: 461-471.

RENOULT J.P., SCHAEFER H.M., SALLE B., CHARPENTIER M.J.E. (2011). The evolution of the multicoloured face of mandrills: insights from the perceptual space of colour vision. PlosOne, 6:e29117.

SCHATZ, B., DELLE-VEDOVE, R., RENOULT, J., et al. (2011). Couleur de fleur d’orchidées et insectes. Le Courrier de la Nature. 260 : 24-36.

RENOULT J.P, COURTIOL A., KJELLBERG F. (2010). When assumptions on visual system evolution matter: nestling colouration and parental visual performance in birds. Journal of Evolutionary Biology. 23:220-226

Cognitive science/Computational neuroscience/Empirical Aesthetics

TIEO, S., BARDIN, M., BERTIN-JOHANNET, R., DIBOT, N., MENDELSON, T. C., PUECH, W., & RENOULT, J. P. (2024). Comparing activation typicality and sparsity in a deep CNN to predict facial beauty. Preprint: : https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-4435236/v1 

DIBOT, N. M., TIEO, S., MENDELSON, T. C., PUECH, W., & RENOULT, J. P. (2023). Sparsity in an artificial neural network predicts beauty: Towards a model of processing-based aesthetics. PLOS Computational Biology, 19(12), e1011703 [PDF]

TIEO, S., RESTREPO-ORTIZ, C. X., ROURA-TORRES, B., SAUVADET, L., HARTÉ, M., CHARPENTIER, M. J., & RENOULT, J. P. (2023). The Mandrillus Face Database: A portrait image database for individual and sex recognition, and age prediction in a non-human primate. Data in Brief, 47, 108939.

BELTZUNG, B., PELE, M., RENOULT, J.P., SUEUR, C. (2023). Deep learning for studying drawing behavior: A review. Frontiers in Psychology. 14: 992541.

BELTZUNG, B., PELE, M., RENOULT, J.P., SUEUR, C. (2022). Using artificial intelligence to analyze non-human drawings: A first step with Orangutan productions. Animals. 12(20): 2761. [PDF]

RENOULT, J.P. (2022). La Fluence, in Abécédaire de la beauté (éditeurs: ZERNIK, C. & JARICOT, J.). Editions B42. [Book chapter]

CHARPENTIER, M. J., PELÉ, M., RENOULT, J.P., SUEUR, C. (2021). Social data collection and analyses, in Demographic Methods Across the Tree of Life (ed. Salguero-Gomez, R., Gamelon, M.), pp.53-76 [Book chapter].

RENOULT J.P. (2019). Book review of "The Aesthetic Animal." Evolutionary Studies in Imaginative Culture. 3: 105-108. [PDF]

RENOULT J.P., GUYL B., MENDELSON T.C., PERCHER A., DORIGNAC J., GENIET F., MOLINO F. (2019). Modelling the Perception of Colour Patterns in Vertebrates with HMAX. bioRxiv, 552307.

HOLZLEITNER I.J., LEE A.J., HAHN A.C., KANDRIK M., BOVET J., RENOULT J.P.,... & JONES B.C. (2019). Comparing theory-driven and data-driven attractiveness models using images of real women’s faces. Journal of Experimental Psychology: Human Perception and Performance. 45: 1589.

RENOULT J.P., MENDELSON T.C. (2019). Processing bias: extending sensory drive to include efficacy and efficiency in information processing. Proceedings of the Royal Society B, 286: 20190165.

KAPOULA Z., VOLLE E., RENOULT J.P., ANDREATTA M. (ed.). (2018). Exploring Transdisciplinarity in Art and Sciences. Springer [Edited book]. 

RENOULT J.P. (2016). The evolution of aesthetics: a review of models. In Aesthetics and Neuroscience: Scientific and Artistic Perspectives, (KAPOULA Z. & VERNET M, ed.). pp. 271-300. Springer International Publishing. [Book chapter].

RENOULT J.P., BOVET J., RAYMOND M. (2016). Beauty is in the efficient coding of the beholder. Royal Society Open Science. DOI: 10.1098/rsos.160027. [PDF]

CHARPENTIER M.J.E., HUCHARD E., GIMENEZ, O., SALLE, B., KAPPELER P., RENOULT J.P. (2012). Distribution of affiliative behavior across kin classes and their fitness consequences in mandrills. Ethology, 118: 1198-1207.

Marine biology

MUCCIOLO, S., DESIDERATO, A., CHRISTIDIS, G., AMMAR, I. A., & ANTIT, M.,..., RENOULT, J.P., …, GEROVASILEIOU, V. (2024). New records of introduced species in the Mediterranean (August 2024). Mediterranean Marine Science, 25(2).

DIGENIS, M., AKYOL, O., BENOIT, L., BIEL-CABANELAS, M., ÇAMLIK, Ö. Y., CHARALAMPOUS, K.,... RENOULT, J.P., & GEROVASILEIOU, V. (2024). New records of rarely reported species in the Mediterranean Sea (March 2024). Mediterranean Marine Science, 25(1), 84-115. [PDF]

KOVACIC, M., ŠANDA, R., VUKIC, J., RENOULT, J. P., & FALZON, M.-A. (2023). New records of the recently described Pomatoschistus nanus Engin & Seyhan, 2017 (Teleostei: Gobiidae) (early view). Cybium. [PDF]

RENOULT, J., MENUT, T., RUFRAY, X., LE BRIS, S., IGLESIAS, S. P., LOUISY, P.,... & PRAT, M. (2023). Les poissons cryptobenthiques de la baie d’Agay (Var). Cahiers de la Fondation Biotope, 39, 58 pages.

KOVAČIĆ, M., RENOULT, J. P., PILLON, R., BILECENOGLU, M., TIRALONGO, F., BOGORODSKY, S. V.,... & YOKES, M. B. (2023). The delimitation of geographic distributions of Gobius bucchichi and Gobius incognitus (teleostei: Gobiidae). Journal of Marine Science and Engineering, 11(3), 516. [PDF]

KOVAČIĆ, M., PILLON, R., RENOULT, J.P. (2022). Identification of enigmatic Mediterranean fish Gobius ater Bellotti, 1988 (Teleostei: Gobiidae) based on morphology from underwater photographs. Journal of Fish Biology, 101: 1381-1384 [PDF]

RENOULT, J.P., PILLON, R., KOVAČIĆ, M.,  LOUISY, P. (2022). Frontiers in Fishwatching Series: Gobies of the Northestern Atlantic and the Mediterranean – Gobius and Thorogobius. Les cahiers de la fondation Biotope. 237 pages.

KOVAČIĆ, M., RENOULT, J.P., PILLON, R., SVENSEN, R., BOGORODSKY, S., ENGEN, S., LOUISY, P. (2022). Identification of Mediterranean marine gobies (Actinopterygii: Gobiidae) of continental shelf from photographs of in situ individuals. Zootaxa. 5144: 1-103.

IGLESIAS, S. P., BARICHE, M.., …, RENOULT, J.P., …, TOURNIER-BROER, R. (2021). French ichthyological records for 2019. Cybium. 45: 169-188.

SANTIN A., AGUILAR R., …, RENOULT J.P., …, TIRALONGO, F. (2021) New records of rare species in the Mediterranean Sea (March 2021). Mediterranean Marine Science, 22: 199-217.

IGLESIAS S. P., BERGOT P., …, RENOULT J.P., …, THOMAS W. (2020). French ichthyological records for 2018. Cybium. 44: 285-307.

Other (mostly phylogenetics, population genetics and natural history)

ROCHAS, P., MINOT, M., MEZIERE, N., RENOULT J.P., JUILLERAT, N., URIOT, Q., URIOT, S., FOXONET, H., CERDAN, A. (2022). Check-list of Odonata from French Guiana with notes on their distribution, ecology, and new state records. Odonatologica, 51(3/4) : 175-224.

RENOULT J.P., DELAHAIE B., DELATTRE J-C., DE FRANCESCHI C. , VEYRUNES F., LE BOT T. (2018). Chumming on multi-day sailing trip in Bay of Biscay. Dutch Birding40:96-98

CROCHET P.-A., LEBLOIS R., RENOULT J.P. (2015). New reptile records from Morocco and Western Sahara. Herpetology Notes. 8 : 583-588.

RENOULT, J.P. Arrivée de la Libellule purpurine Trithemis annulata (De Palisot de Beauvois, 1805) dans la vallée du Rhône. (2013). Sympetrum. 17: 81-82. 

DURANT, E., RENOULT, J.P.(2012). Addition à l’odonatofaune de l’Adrar mauritanien. Poiretia, 2012, 4 : 7-16.

CHARPENTIER M.J.E., FONTAINE M.C., CHEREL E., RENOULT J.P., JENKINS T., BENOIT L., BARTHES N., ALBERTS SC, TUNG J. (2012). Genetic structure in a dynamic baboon hybrid zone corroborates behavioral observations in a hybrid population. Molecular Ecology, 21:715-731.

RENOULT J.P., GENIEZ P., BEDDEK M., CROCHET P.-A. (2010). An isolated population of Podarcis vaucheri (Sauria: Lacertidae) in south-eastern Spain: genetic data suggest human-mediated range expansion. Amphibia-Reptilia, 31:287-296.

KJELLEBERG F., BAKOLIMALALA R., EDMOND R., RAFIDISON V., RABEVOHITRA R., RENOULT J., et. al. (2010). Corridors de végétation et conservation d'un groupe clé de voûte de la biodiversité au centre d'un réseau d'interactions: le cas des Ficus et des communautés associées. in Connaissance et Gestion des Milieux Tropicaux. p80-91. CNRS Edition. [Chapitre de livre].

RENOULT J.P., GENIEZ P, BACQUET P., GUILLAUME C. P., CROCHET P.-A. (2010). Systematics of the Podarcis hispanicus-complex (Sauria, Lacertidae) II: the valid name of the north-eastern Spanish form. Zootaxa, 2500:58-68

RENOULT J. (2009). The Sooty Gull, Larus hemprichii (Aves; Laridae), on Nosy Ve: first records for Madagascar. Malagasy Nature, 2:174-176.

RENOULT J.P., GENIEZ P, BACQUET P., BENOIT L., CROCHET P.-A. (2009). Morphology and nuclear markers reveal extensive mitochondrial introgressions in the Iberian Wall Lizard species complex. Molecular Ecology. 18:4298-4315.

RENOULT J.P., KJELLBERG F., SANTONI S., KHADARI B. (2009). Cyto-nuclear discordance in the phylogeny of Ficus section Galoglychia and host shifts in plant-pollinator associations. BMC Evolutionary Biology. 9:248.

RENOULT J.P. & RASELIMANANA A.P. (2009). A new species of Malagasy blind snake of the genus Typhlops Oppel (Serpentes: Typhlopidae). Zootaxa,2290:65-68

CROCHET P.-A., RENOULT J. (2008). Tarentola annularis annularis (Geoffroy de Saint-Hilaire, 1827) preying on a mammal. Herpetology Notes, 1:58-59.

PhD student – University of Montpellier

I’m a PhD student interested in animal behaviour and cognition, and how they translate into the spatial and demographic dynamics of populations. During my PhD, I focus on the interplay between individual movements and the dynamics of population networks through two case studies: 1) migratory connectivity and its relationship with the demography of migratory populations; 2) informed dispersal and its implications for the structuring and the stability of larid colonies. Linking individual and population-level processes leads me to draw on methods from both behavioural ecology and population biology.

Supervisors: Pierre-André CROCHET (DR, CNRS), Aurélien BESNARD (DE, EPHE).

Contact information

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Orcid: https://orcid.org/0000-0002-0316-5041
CEFE, 2ème étage aile C, bureau 202A

PhD student

I am a PhD student in evolutionary ecology using great and blue
tits to compare coloured signals of forest, urban and corsican
birds to assess the impacts of urbanisation and climate
change on these traits and selection associated.

Contact:
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ORCID - Twitter

Supervisors: Claire Doutrelant (CEFE - CNRS, Montpellier) & Arnaud Grégoire (CEFE - University of Montpellier).
Project in collaboration with David López Idiáquez.

Thesis project: Climatic, anthropic and intrinsic determinants of ornaments expression and their association to fitness.

Urbanisation and climate change are two major factors driving ongoign environmental changes in wirld populations worldwide. Research has revealed plastic and genetic responses to these anthropogenic changes. A shift in environmental conditions are expected to impose novel slective forces that can shape phenotypic variation of populations living in urban environments. Ornaments such as conspicuous colourations play a crucial role shaping interactions between individuals in inter and intra-sexual contexts. Ornamentals surch as feathers, with carotenoid-based (yellow to red), structural (blue) and melanic colours, are expected to be associated with variation in environmental conditions. Phenotypic divergences are known in urban environments, however understanding the underlying mechanisms driving colour variation are not investigated.

This projects uses a long time dataset from the following of four blue tits populations, three in Corsica and one near Montpellier, and two great tits populations from the city of Montpellier and a nearby forest. Overall it covers 10 to nearly 20 years of colouration data. This dataset results from the work of numerous researchers and students from the CEFE TIT PROJECT.

This thesis aims to:

• Unravel the effects of urbanisation and climate change on carotenoid colouration in the great tits, and investigate whether phenotypic divergence has a temporal pattern.
• Understand which urban characteristic is causing changes in bird colouration using
  1/ common garden experiments to see whether there is plastic or genetic changes.
  2/ metabarcoding data to see what urban and forest birds are eating while they renew their feathers.
• Investigate selection by survival on coloured ornaments for both blue and great tits and compare it between environments.

Bio:

• 2022: Master's degree in evolutionnary ecology, Sorbonne Université, France.
        - 2nd year Master thesis: Sublethal effects of pesticides on passerine's health and behaviour. Under the supervision of Jerome Moreau (CEBC - La Rochelle Université, France).
        - 1st year Master thesis: Adaptive effects of rock pigeon (Columbia livia)beak's morphology on the regulation of feather's ectoparasites. Under the supervision of Julien Gasparini (Sorbonne Université, France).
• 2019: Bachelor degree in Life Sciences, Sorbonne Université, France.

Publications: More to come soon

• Jeantet A.,Sandmeyer L., Campech C., Audebert F., Agostini S., Pellerin A., Gasparini J. 2023. The “parasite detoxification hypothesis” : lead exposure potentially changes the ecological interaction from parasitism to mutualism. Ecotoxicology 32(5):666-673.

Grants:

• 2000€ ESEB Hewitt Mobility Award 2024 to visit another laboratory - NTNU, Norway
• 2000€ SQUID Student Fellowship in 2023 to visit another laboratoty - NTNU, Norway
• 300£ BOU Member conference attendance grant in 2023

Maitre de conférence (EPHE)

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier 5

tél : +33 4 67 61 32 61
fax: +33 4 67 41 21 38

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Mots clés : Conservation, Biogéographie, région méditerranéenne, Reptiles, Ecologie des populations, Phylogéographie.

Directeur de recherche au CNRS

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5

Tél : +33/0 4 67 61 33 10
Fax : +33/0 4 67 61 33 36
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Mots clés

Discipline : Ecologie évolutive, Ecologie comportementale, Ecophysiologie
Thématiques : Biologie des populations, Traits d’histoire de vie, Changements environnementaux, Hétérogénéité de l’habitat
Organismes biologiques : Aves, Parus (Mésanges)
Milieux : Région méditerranéenne, Milieux forestiers
Techniques :  Suivi d’individus marqués dans le cadre d’un programme à long terme
Autres mots clés : Interactions entre espèces, Ressources, Climat

Researcher CNRS

" Movement, Abundance, Distribution" (MAD) Team Leader

CEFE

1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5
Tél : +33/0 4 67 61 33 02

Office 311, 3rd floor

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Directeur de Recherche / Senior scientist

I study the evolution of adaptive diversity, using colour patterns in butterflies as a model. In my group, we integrate many different approaches, including ecology, genetics, and modelling, to try and untangle how multiple factors influence the evolution and maintenance of diversity and polymorphisms.

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Directeur de Recherche (DR2)

CNRS Researcher 

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier cedex 5

Tél : +33 (0)4 67 61 32 89
Fax : +33 (0)4 67 61 33 36

xavier dot morin @ cefe dot cnrs dot fr

HDR : Impact des changements globaux sur la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes forestiers - soutenue le 11/2/2021
Lien : HDR Xavier Morin

Thèmes de recherche

(English follows)

Mes travaux cherchent à parvenir à une meilleure compréhension du déterminisme de la diversité végétale aux différentes échelles spatiales et temporelles, sa réponse aux changements futurs, et son rôle dans le fonctionnement des écosystèmes forestiers. En particulier, je cherche donc à comprendre et prédire comment la biodiversité des écosystèmes forestiers s’organise selon différentes échelles spatiales, comment elle sera modifiée par les changements globaux, et quelles en seront les conséquences sur le fonctionnement de ces écosystèmes. Pour ce faire j’essaie de développer une approche intégratrice basée sur les processus. Mes travaux se focalisent principalement sur les espèces d'arbres et arbustes. Pour mener à bien ces objectifs, j’utilise aussi bien des résultats issus d’expérimentation, d’observations le long de gradients écologiques in situ, et de modélisation.

Chargé de recherche (CRCN IRD)

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier 5

tél :  +33 (0)4 67 61 33 53
fax : 33 (0)4 67 61 33 36

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Thèmes de recherche

Mes travaux portent principalement sur la modélisation de la dynamique et du fonctionnement des écosystèmes végétaux naturels terrestres à différentes échelles.

Maitre de conférences à Université de Montpellier

J’étudie les mécanismes comportementaux liés au mouvement, gouvernant l'utilisation de l’habitat et leurs conséquences sur la dynamique des populations chez les oiseaux. J’utilise une approche intégrative de la biologie de la conservation, à l’interface avec l’écologie comportementale, physiologie et écologie des populations.

I study behavioural mechanisms related to movement, driving habitat use and their consequences on population dynamics in birds. I am using an integrative approach of conservation biology, at the interface with behavioural ecology, physiology and population ecology

tél : 33 (0)4 67 61 33 02
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Ingénieur de Recherche (IR1)

CEFE/CNRS
Campus du CNRS
1919, route de Mende
34293 Montpellier 5

tél : +33 (0)4 67 61 32 93
fax: +33 (0)4 67 61 33 36

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Visitez le site expérimental de Puechabon: http://puechabon.cefe.cnrs.fr/