• Ana RODRIGUES

    Ana2015

    Senior Researcher (Directrice de recherche 2) CNRS

    My research lies at the interface between ecology and biological conservation, with the study of spatial biodiversity patterns as the unifying theme. Main current interests: large-scale conservation priorities; evolutionary community models; historical human footprint on biodiversity, with a focus on marine mammals.

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
    orcid.org/0000-0003-4775-0127 

     

  • Anne CHARPENTIER

    AnneCharpentierMaître de conférences (Lecturer), Université de Montpellier

    HDR (Habilitée à diriger des recherches)

    I work at the interface between population dynamics and conservation biology.  My research encompasses the effects of anthropic factors on population dynamics and their implications for the conservation of biodiversity.  I have mainly worked in the Mediterranean region, focusing on environmental drivers such as climatic change, environmental variability and species introductions to explain ecological and evolutionary dynamics of plant populations.  Recently, I have developed a particular interest in historical ecology by studying ancient human impacts on whale populations. 

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
    https://www.researchgate.net/profile/Anne_Charpentier

  • Aurélie CELERIER

     

    Maître de Conférences à l'Université Montpellier II

    rencontre nocturne


    CEFE/CNRS

    Campus du CNRS

    1919, route de Mende
    34293 Montpellier cedex 5


    Tél : +33/0 4 67 61 33 17
    Fax : +33/0 4 67 61 33 36

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

     

     

  • Emilie BOULANGER

    DoctoranteBoulangerE
    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

    Tel. +33 (0)4 67 61 32 63

    CEFE/CNRS UMR5175
    Etage 1, aile C, bureau 114

    Supervisor : Stéphanie Manel (CEFE)
    Co-supervisor : David Mouillot (MARBEC)

  • Laëtitita MATHON

    DoctoranteMathon Laetitia
    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
    Tel. +33 (0)4 67 61 32 63

    CEFE/CNRS UMR5175

    Etage 1, aile C, bureau 114
    Supervisor : Stéphanie Manel (CEFE)

    Google Scholar / Researchgate

     

    Projet de these : L’ADN environnemental pour étudier les patterns de distributions des poissons et les communautés à large echelle

    3 objectifs de recherche :

    - Comparaison de programmes bioinformatiques existants pour le traitement des données d'ADN environnemental, afin d'identifier les programmes les plus performants pour retrouver les composition specifiques des échantillons.

    - Analyse à l’échelle globale de données d’ADNe collectées sur des récifs coralliens dans plusieurs régions du monde afin d’étudier la capacité de l’ADNe à détecter les patterns de diversité à différentes échelles et déterminer les mécanismes de diversité. Puis analyse de données d'ADNe collectées dans plusieurs régions marines, de pôle à pôle.

    - Cas d'étude particulier : Modélisation 3D de la diversité des poissons autour des monts sous-marins de Nouvelle-Calédonie à partir de données d’ADN environnemental, afin d'étudier les communautés de poissons sur ces monts en fonction des paramètres environnementaux et biologiques.

     ****

    PhD project : Environmental DNA to study fish distribution patterns and communities across large spatial scales 

    3 research objectives:

    - Comparison of existing bioinformatics programs for processing environmental DNA data, in order to identify the most efficient programs for finding the species composition of samples.

    - Global analysis of DNA data collected from coral reefs in several regions of the world to study the ability of DNA to detect diversity patterns at different scales and determine the mechanisms of diversity. Then analysis of eDNA data collected in several marine regions, from pole to pole.

    - Special case study: 3D modeling of fish diversity around seamounts of New Caledonia from environmental DNA data, in order to study the fish communities on these seamounts according to environmental parameters and organic.

    ****

    Publications :

    Mathon, L., Valentini, A., Guérin, P. E., Normandeau, E., Noel, C., Lionnet, C.,... & Manel, S. (2021). Benchmarking bioinformatic tools for fast and accurate eDNA metabarcoding species identification. Molecular Ecology Resources.

    Flück, B., Mathon, L., Manel, S., Valentini, A., Dejean, T., Albouy, C.,... & Pellissier, L. (2021). Fast processing of environmental DNA metabarcoding sequence data using convolutional neural networks. bioRxiv.

     

    Conferences :

    Circumglobal distribution of fish environmental DNA in coral reefs. DNAqua-net conference, 2021

     

    Main disciplines / approaches / study systems:

  • Manon CLAIRBAUX

    Doctorante 2017-2020

    Thèse soutenue le 04/12/2020. Post-doc à MAD jusqu'à fin mars 2021

    Paysage énergétique des oiseaux marins hivernant en Atlantique Nord en contexte de changement climatique

     

    CEFE, CNRS

    1919 Route de Mende,

    34090 Montpellier

    2 ème étage, aile B, bureau 201

    +33(0)4.67.61.33.09

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

    Superviseur: David Grémillet

  • Marie-Morgane ROUYER

    MSCA Early-Stage Research FellowMarieMorganeROUYER

    I am a Marie Skłodowska-Curie Actions research fellow, part of the Inspire4nature Innovative Training Network, researching at the interface between science and policy in the field of biodiversity conservation. I am looking at the effectiveness of protected areas at conserving biodiversity, in partnership with BirdLife International and the UNEP-WCMC.

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

    https://www.researchgate.net/profile/Marie_Morgane_Rouyer

     

  • Nicolas Courbin

    NCourbinChercheur postdoctoral / Postdoctoral researcher

    J'étudie les mécanismes de la répartition spatiale des grands herbivores, des grands carnivores et des oiseaux marins dans le but d'approfondir nos connaissances sur les interactions prédateur-proies (jeu spatial prédateur-proie, stratégie d'alimentation, stratégie de recherche des prédateurs, stratégie anti-prédatrice des proies) et d'améliorer les mesures de gestion et de conservation de la faune.

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. or Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

  • Stéphanie MANEL

    Stephanie MANEL

    Directrice d’Etudes EPHE

    My main field of research is landscape genetics.

    CEFE/CNRS
    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier cedex 5

    Tel. : +33(0)4 67 61 32 35

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
     

    Keywords : Landscape genetics - Landscape connectivity - Adaptive genetic diversity - Local adaptation - Gene flow 

    Website: https://sites.google.com/site/stephaniemanel/home

  • Sylvia CAMPAGNA

    Sylvia CAMPAGNA3

    Maître de Conférences (CNU 64-65), Université de Nîmes
    CEFE, 2ème étage, Aile B, Bureau 209


    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier cedex 5

    Tél : +33/0 4 67 61 33 17

    sylvia.campagna(at)cefe.cnrs.fr

     

    Keywords : Marine Mammals - Chemical Ecology  - Sensory Perception - Electrophysiology