• Aurélie CELERIER

     

    Maître de Conférences à l'Université Montpellier

    Sans titre

    CEFE/CNRS

    Campus du CNRS

    1919, route de Mende
    34293 Montpellier cedex 5

    Tél : +33/0 4 67 61 33 17

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  • Aurélie COULON

    Aurelie.Coulon

    Associate Professor in spatial ecology at the Muséum national d'Histoire naturelle                                                                                                                                                        

    My research focuses on movement ecology: I study the factors influencing animal movements (especially dispersal) and gene flow, with a particular emphasis on landscape composition and structure. I also study how human-triggered landscape modifications like fragmentation affect animal movements; and the consequences on population functioning and structure. My research is hence tightly linked to the management/conservation of populations, and to landscape management (e.g. connectivity restoration, french Trame Verte et Bleue policy).

  • Aurélien BESNARD

    altSenior Lecturer / Directeur d'Etudes de l'EPHE

    HDR depuis le 04/09/2013mémoire à télécharger ici

    CEFE/CNRS
    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier 5
    France 


    Tél. :     +33 (0)4 67 61 32 94
    Fax      :+33 (0)4 67 41 21 38

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    Keywords:Biostatistics; Conservation biology; Amphibians; Birds, Reptiles, Quantitative ecology; Population Dynamics and Demography, Sampling designs.

     

  • Claudine MONTGELARD

    Maitre de Conférences (EPHE)

    CEFE/CNRS
    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier 5

     tél : 33 (0)4 67 61 33 04
     fax: 33 (0)4 67 41 21 38

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     THEMES DE RECHERCHE

    Mes thèmes de recherche concernent la phylogénie, la phylogéographie et l'évolution moléculaire à partir de l'analyse des séquences de gènes mitochondriaux et nucléaires. L’objectif est de répondre, à l’aide de l’outil moléculaire, à des questions de biodiversité et systématique évolutive à l’échelle des vertébrés (mammifères, amphibiens et reptiles). Je m’intéresse aussi à l’échelle temporelle (datations moléculaires) des différents niveaux de diversifications ce qui permet de confronter les inférences moléculaires avec les données morphologiques, paléontologiques et biogéographiques.

  • Dimitri MEDETIAN

    photo Dimitri Medetian

    Doctorant EPHE-PSL

    Etage 1, aile C, bureau 114

    ResearchGate

    Contact: Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

    Directeur de thèse : Claude Miaud (CEFE, EPHE - PSL)

     

    Projet de thèse: Etude de la mobilité de la mégafaune marine grâce au développement d’un capteur passif à ADN environnemental

    Mots clés : ADN environnemental, capteur passif, mégafaune marine, parc éolien en mer.

    Cette thèse vise à améliorer les connaissances sur la mobilité de la mégafaune marine rare et parfois discrète (mammifères marins, tortues marines, grands poissons…) grâce au développement d’un capteur passif à ADN environnemental (ADNe). L’ADNe correspond à l’ADN naturellement relâché dans l’environnement par les organismes vivants. L’objectif est de capter cet ADN dans le temps afin de détecter les passages de la mégafaune marine et de mieux comprendre ses déplacements.

    Cette nouvelle méthode peut permettre de répondre à certains obstacles méthodologiques des inventaires de biodiversité marine (difficultés et coûts d’accès, saisonnalité de la fréquentation, discrétion des taxons…). 

    Enfin, ces capteurs serviront également à l’étude des interactions de cette faune avec les activités anthropiques. La fréquentation des parcs éoliens en mer par la mégafaune marine sera ainsi évaluée.

    Les objectifs de cette thèse sont donc :

    • De développer et de tester en laboratoire et sur le terrain un capteur passif à ADNe répondant aux contraintes physico-chimiques du milieu marin (salinité, variations de température, courants…)
    • Mettre en place ces capteurs dans le milieu naturel pour obtenir une meilleure compréhension des déplacements de la mégafaune marine dans des contextes variés (aire marine protégée, parc éolien en mer…).

     

    ---- English ----

    Thesis project: Study of marine megafauna mobility thanks to the development of an environmental eDNA passive sampler.

    Key words: environmental DNA, passive sampler, marine megafauna, offshore wind farm.

    This thesis aims to improve knowledge on rare marine megafauna (marine mammals, sea turtles, large fishes…) thanks to the development of a passive environmental DNA (eDNA) sampler. eDNA is the DNA naturally released in the environment by living organisms. The objective is to capture the DNA over time to detect marine megafauna and to better understand its movements.

    This new method can address methodological obstacles of  marine biodiversity inventories (difficulties and costs of access, seasonality, taxa discretion…).

    Finally, these sensors will be used to study anthropogenic impacts on megafauna. The frequentation of offshore windfarms by marine megafauna will be evaluated. 

    The objectives are:

    • To develop and test in the laboratory and in the field an eDNA passive sampler according to the physio-chemical properties of marine environment (salinity, temperature, streams…).
    • Implement these samplers in the natural environment to better understand the marine megafauna movements in diverse contexts (marine protected area, offshore windfarm…). 
  • Doris Gomez

    CNRS Researcher

    dodoko petitetaille

    Address:

    CEFE/CNRS,Campus du CNRS
    1919, route de Mende,34293 Montpellier cedex 5

    Phone : +33/0 4 67 61 32 60

    E-mail: Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. ou Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

    I study visual communication at various scales: color perception, role of coloration in communication/camouflage, informative content of signals, evolution of signal design at large evolutionary scale. At the frontier between biology and physics, I study complex optical phenomena in birds and butterflies.

  • Etienne HENRY

    IMG 3576 min

    PhD candidate - Migratory landbirds conservation

    I am a PhD candidate using tracking data to inform conservation of African-Eurasion migratory landbirds, storks and  raptors.
    The persistent decline observed in migratory bird populations over recent decades highlights the urgent need to improve our scientific understanding of the drivers behind this trend. This comprehension is crucial to support international policies impacting the conservation of these birds across national, European, and inter-continental levels.
    The project results from collaboration between the CEFE, the CIBIO and BirdLife International.

    Project: Mobilising tracking data on African-Eurasian migratory birds to support conservation at the flyway scale.
    Supervisors: Ana Rodrigues (CEFE - CNRS, Montpellier) & Inês Catry (CIBIO - University of Porto).
    Project in collaboration with BirdLife International.

    Contact:
    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
    CEFE UMR5175 - Campus du CNRS - 1919, route de Mende - 34293 Montpellier 5 - France
    ORCID: 0009-0004-1802-0197
    Twitter

     

  • Interactions Humains Animaux

    Notre équipe travaille sur les interactions entre humains et animaux selon une approche interdisciplinaire qui tient explicitement compte de leurs caractéristiques biologiques, comportementales, sociales et culturelles. Nous nous intéressons en particuliers aux questions de gestion de la faune sauvage et des animaux domestiques en interaction avec les activités humaines. Nous évoluons le long d’un gradient qui va de la conception et de la mise en place de protocoles d’échantillonnage, l’étude de la dynamique et de la distribution des populations, l'étude des savoirs écologiques, des perceptions et des pratiques des acteurs impliqués dans la gestion, jusqu’aux recommandations de gestion et la contribution aux processus de prise de décision et d’élaboration ou d’évaluation de politiques publiques de gestion et de conservation de la nature.

    Afin d’étudier la dynamique des populations sauvages nous développons des méthodes et outils statistiques. La plupart de nos travaux s’inscrivent en biologie et géographie de la conservation. Ceux-ci cherchent à développer des interfaces entre spécialistes en statistiques et gestionnaires d’aires protégées ou conservationnistes pour mieux étudier l’évolution des paramètres démographiques et populationnels des espèces et ainsi définir des politiques de protection, de prélèvement et de gestion plus adaptées.

    Nos travaux mobilisent également des approches et méthodes sociologiques, ethnologiques et de géographie humaine afin de mieux comprendre les relations entre humains et animaux. Nous étudions les savoirs écologiques et éthologiques des populations locales et les rétroactions entre dynamiques de population, écologie spatiale et géographie animale selon les perceptions et pratiques des chasseurs, éleveurs, bergers, agriculteurs, gestionnaires d’aires protégées et environnementalistes.

    A partir de l’analyse des controverses sociopolitiques ou dans le cadre de projets de recherche-action relatifs à la gestion de populations gibiers, des dégâts liés au gibier ou aux grands prédateurs, de populations d’espèces menacées, nous explorons dans différents contextes socio-écologiques, comment l’écologie et les comportements des animaux domestiques et sauvages façonnent les relations des humains avec ces animaux et les réseaux de relations complexes et dynamiques entre acteurs humains ; et comment en retour ces relations façonnent l’écologie et les comportements animaux dans le temps et l’espace.

    Notre équipe a ainsi une activité fortement interdisciplinaire, croisant l’écologie, la géographie, l’ethnologie, la statistique et la modélisation mathématique et multi-agents spatialisée ou non. Nous réalisons une approche critique de nos approches interdisciplinaires et conduisons une réflexion spécifique de longue haleine sur l’interface science/gestion et l’efficacité des politiques publiques. Nous nous impliquons dans de nombreuses missions de conseil scientifiques auprès des services de l’Etat, des gestionnaires d’aires protégées, des organismes locaux, régionaux et internationaux en liens avec la gestion, l’exploitation et la conservation de la faune sauvage. Nous enseignons dans des masters et spécialisations de plusieurs Grandes Ecoles et Universités, en France principalement. Enfin, nous organisons régulièrement des formations spécifiques pour le milieu socio-professionnel des gestionnaires de la nature, les étudiants et les chercheurs.

    Nous entretenons de solides partenariats de long terme avec des acteurs publics (OFB, ex. AFB et ONCFS, Parcs Nationaux), para-publics (CBN, ONF, Réserves naturelles de France, Fédération des Parcs naturels régionaux) et privés (bureaux d’étude, zoos, associations). Partant du constat que nos doctorant.e.s et post-doctorant.e.s ne trouveront pas tou.te.s un poste académique, nous entretenons des liens étroits avec le milieu non-académique dans le souci de leur intégration professionnelle.

    Les trois axes qui structurent l’équipe sont :

    Axe 1 : gestion des populations animales exploitées

    Modèles d’étude : ongulés (sangliers) et oiseaux.

    Partenariat fort avec OFB (ex. ONCFS/AFB) et Fédérations départementales de chasseurs   

     

    Axe 2 : gestion des populations de grands mammifères

    Grands carnivores (ours, loup, lynx) et cétacés (grands dauphins)

    Partenariat avec fort ONCFS, FDC, associations

     

    Axe 3 : formation

    Outre l’enseignement académique classique dans lequel nous sommes investis, notre équipe a une activité conséquente dans la formation sous forme d’ateliers pour l’OFB, les bureaux d’étude, la formation continue et les collègues universitaires. Ces formations ont clairement une forte composante de transfert soit des méthodes de modélisation mathématique et d’analyses statistiques de données de sciences écologiques ou humaines, soit des méthodes d’intégration des sciences humaines et sociales avec l’écologie dans des dispositifs interdisciplinaires de recherche ou de recherche-action dans le contexte des interactions humains/animaux ou aires protégées/non protégées.

  • Jean-Louis MARTIN

     

    Directeur de Recherche Emerite au CNRS / Emeritus Senior Scientist at CNRS

     

    J’étudie les réponses des communautés animales et végétales aux changements d’origine humaine (espèces introduites, usage des sols), en milieu tempéré et méditerranéen.

     

    I study plant and animal community response to human induced change (introduced  species, land use) in temperate and méditerranean systems.

     

    Courriel: jean-louis.martin [at] cefe.cnrs.fr

     JLete2014 petit


     

     

  • Jean-Yves BARNAGAUD

    CEFE- RDC, Aile B, bureau 3

    33(0)467633265

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    RESEARCH

    My research is framed around a comparative exploration of the role of multiple environmental drivers in shaping species distributions and diversity at multiple spatial and temporal scales. Most of my research is structured on the combined use of ecoinformatics methods (statistical analysis of large data sets) and naturalist expertise to understand empirical patterns of community composition in space and time. My main active axes of research include :  

    - functional biogeography of seabirds in the Southern ocean. I try to explain and predict the composition of seabird assemblages with spatial models calibrated with environmental factors, trophic interactions and species traits. The project relies on a large-scale bird counts protocol from ships and statistical model of multiple data types. See the C-BIRDS project and thesis.

    -  understanding spatial patterns of vertebrates distributions and assemblage compositions. Relying on various opportunistic or protocoled data sources at multiple spatial scales, I investigate the determinants of spatial patterns in vertebrate distributions and assemblage composition through spatial models based on proxies of historical and contemporary processes. See for instance he MALPOLONdatabase.

    - Ecoacoustics and community ecology. Several active projects focus on the relationship between bird community composition and the characteristics of soundscapes at multiple spatial and temporal scales, in order to explore the acoustic environment in which species interact and its changes with current land-use and climatic dynamics. See the ACOUCENEproject (2022 - 2025, FRB/CESAB)

    COLLABORATIVE WORK 

    Most of my interactions with biodiversity stakeholders are focused on data analysis to answer questions relative to the monitoring of human impacts on biodiversity at a regional or landscape scale.

    - Ecological data analysis. I am involved in initiatives to foster interactions between scientific and non scientific stakeholders with respect to data-based ecological monitoring and expertise. See the website of the CISSTATnetwork. 

    - Analysis of land use influences on common bird assemblages in southern France. I investigate the impact of land use and habitats on the temporal dynamics of local bird assemblages with opportunistic and protocoled data (collaborations with the Ligue pour la Protection des Oiseaux - PACA). 

    - Wildlife road casualties. I work with the Ligue pour la Protection des Oiseaux and the CEREMA to explain and predict spatial patterns in road casualites. We exploit jointly multiple sources of protocoled, non-protocoled and citizen science data to identify mortality hotspots and explanatory factors, with the final aim to inform public policies on the mitigation of traffic impact on vertebrates. See the final report of the COCPITT project (2020-2023).

     - Interacting imprints of climate change and land use on biodiversity. Using multiple taxa and scales, I investigate how species' responses to historical and present land use change interact with their responses to climate change. See the LANDBIO project (2022 - 2023, OFB - french ministry of ecology)

     

    TEACHING

    Most of my teaching activity is embedded within the program of the Ecole Pratique des Hautes Etudes.

    - Data analysis for ecologist : a three-weeks course dedicated to biodiversity stakeholders, framed on the practical use of statistical methods and the R software in ecological monitoring. 

    - Environmental law and policy : I drive a one-week course to introduce environmental public policies to scientific ecologists, involving speakers from various authorities and decision levels and practical training to improve students' written and verbal interactions with non-scientific stakeholders.

    - Methods for ecological monitoring : a two-weeks course with Aurélien Besnard, mainly dedicated to master students and biodiversity stakeholders, to improve their skills and critical thinking in advanced numerical methods for ecology, including species distribution modeling, population dynamics, sampling design and analysis of diversity indices.

    - Environmental changes and ecological science :I contribute to several courses on global changes and environmental monitoring. My teaching is focused on the interactions between science and society through several lenses including epistemology and governance / spatial planning.

      


  • Jules CHIFFARD

    Phd student - DoctorantChiffard Carricaburu 2014

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    Research : Climatic and biotic drivers of species distributions in alpine landscapes -- Distribution des oiseaux dans les socio-écosystèmes montagnards

    Project : A long-term bird survey for mountain landscape birds -- Un suivi participatif national à long terme des oiseaux de montagne (!)

     

  • Killian GREGORY

    PhD student – University of Montpellier

    KillianGregory

     

    I’m a PhD student interested in animal behaviour and cognition, and how they translate into the spatial and demographic dynamics of populations. During my PhD, I focus on the interplay between individual movements and the dynamics of population networks through two case studies: 1) migratory connectivity and its relationship with the demography of migratory populations; 2) informed dispersal and its implications for the structuring and the stability of larid colonies. Linking individual and population-level processes leads me to draw on methods from both behavioural ecology and population biology.

     

    Supervisors: Pierre-André CROCHET (DR, CNRS), Aurélien BESNARD (DE, EPHE).

     

    Contact information

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    Orcid: https://orcid.org/0000-0002-0316-5041
    CEFE, 2ème étage aile C, bureau 202A

  • Laurent DORMONT

    LD

     

    Maître de conférences, Université Paul-Valéry Montpellier III

     

    Mon objectif est de comprendre le rôle et l’importance des odeurs et des médiateurs chimiques dans le fonctionnement et l’évolution des relations plantes-insectes. Je m’intéresse particulièrement aux aspects suivants : quelles sont les caractéristiques des odeurs et des signaux chimiques disponibles pour les insectes ? Quelle est l’activité biologique de ces molécules (réponse comportementale des insectes) ? Dans quelle mesure et à quel(s) niveau(x) ces interactions chimiques jouent un rôle dans le fonctionnement et l’évolution des systèmes plantes-insectes ?

    Courriel : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

     

  • Laurine Mathieu

    Laurine Mathieu - PhD student 2023/2026photo pro

    Supervised by Anne Charmantier (CEFE-CNRS) and Samuel Caro (CEFE-CNRS)

     

    Contact 

    CNRS - CEFE UMR5175

    1919 Route de Mende, 34283 Montpellier

    Aile B Etage 2 Office 206

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    Project

    The objective of this PhD project is to better understand how wild populations of great tits and blue tits are affected by urbanization and what mechanisms are involved in the observed phenotypic differences between urban and forest populations. This study will rely on the long-term population monitoring in urban and forest habitats established in Montpellier (CEFE TIT PROJECT) , as well as on comparative analyses with the city of Paris. The thesis will particularly explore physiological aspects that have not been studied thus far. Given the characteristics of the urban environment, which is more stressful and has higher temperatures, physiological adaptations to urban life are expected to be observed. Variations in the endocrine system between urban and forest environments will be studied, focusing on stress and reproductive hormones. Additionally, aspects of respirometry will be investigated, with the primary question being: do urban birds have a metabolism pre-adapted to high temperatures due to living in an urban heat island effect environment? In a second part, the project aims to dissect how urban phenotypic shifts are driven by genetic change or plasticity. To study this aspect, common garden experiments have been set up. Data from individuals raised under similar environmental conditions can be compared to wild individuals, thus observing whether phenotypic differences between urban and forest habitats are maintained or not.

    More information: ACACIA Project

     

    Bio

    • 2021-2023 Master in Biodiversity, Ecology and Evolution, Ecology, Evolution and Genomics (Lyon 1)
      • 2nd year Master thesis: Genetic architecture and gene expression underlying sexual antagonistics traits in Gerromorpha - IGFL (Lyon) - supervised by Abderrahman Khila
      • 1st year Master thesis: Cognitive abilities in relation to the reproductive success of great tits and ringed flycatchers - LBBE (Lyon)/ Gotland (Sweden) - supervised by Blandine Doligez & Laure Cauchard
    • 2020-2021 Licence in Biodiversity (Lyon 1)
    • 2018-2020 CPGE BCPST (Lyon)

     

    438115803 1459253968286537 9150852942984776686 n458708480 1181496353128850 1686181633067030743 n457148928 1229882748207558 3270500950074306441 n458720763 445886391830387 4860437783887452466 n

     

     

     

  • Marc CHEYLAN

    altMaitre de conférence (EPHE)

    CEFE/CNRS
    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier 5

    tél : +33 4 67 61 32 61
    fax: +33 4 67 41 21 38

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    Mots clés : Conservation, Biogéographie, région méditerranéenne, Reptiles, Ecologie des populations, Phylogéographie.

  • Marcel Lambrechts

    Directeur de recherche au CNRS

    CEFE/CNRS
    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier cedex 5

    Tél : +33/0 4 67 61 33 10
    Fax : +33/0 4 67 61 33 36
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    Mots clés

    Discipline : Ecologie évolutive, Ecologie comportementale, Ecophysiologie
    Thématiques : Biologie des populations, Traits d’histoire de vie, Changements environnementaux, Hétérogénéité de l’habitat
    Organismes biologiques : Aves, Parus (Mésanges)
    Milieux : Région méditerranéenne, Milieux forestiers
    Techniques :  Suivi d’individus marqués dans le cadre d’un programme à long terme
    Autres mots clés : Interactions entre espèces, Ressources, Climat

  • Maria MOIRON

    Post-doctoral researcher

    Pic for CEFE M Moiron

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    I am an evolutionary and behavioural ecologist broadly interested in understanding the causes and consequences of phenotypic variation in behaviour, life-history and physiology across different hierarchical levels of organization. In my current postdoc with Anne Charmantier and Sandra Bouwhuis I focus on the evolutionary genetics of phenotypic plasticityusing a long-term data set of common terns (Sterna hirundo) from the North Coast of Germany.

  • Marie-Jeanne Holveck

    marieID 

    E-mail: Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

     

    Personnal website:

    http://lebonjourvousva.fr/cv/HOLVECK_Marie/index.php?l=gb#

     

    I study how variation in signal production and perception influences (i) the evolution of signals in multiple sensory modalities (acoustic, visual and chemical domains) and (ii) the adaptation (through phenotypic plasticity and/or genetic variability) to different environments, a topic for which there is nowadays a growing interest in the new field of sensory ecology, notably to understand how species cope with their rapidly changing environment due to anthropogenic activities.

     

  • Marie-Morgane ROUYER

    PhD Candidate – Marine ecology and conservation MarieMorganeROUYER

    I am a PhD candidate, working at the interface between movement ecology and marine conservation. My PhD project aims to deliver science-based, conservation-oriented evidence to inform the conservation of highly mobile seabirds in the Atlantic. It is a partnership between the CEFE, the University of Lisbon, BirdLife International and the UN Evironment Programme World Conservation Monitoring Centre (UNEP-WCMC).

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
    https://orcid.org/0000-0003-4915-7191

     

  • Marwan NACIRI

    PhD candidate – Université de Montpellier

    Marwan svalbard

     

    I’m a PhD student interested in evolutionary demography and population dynamics of wild populations. I’m currently working on the demography of Svalbard polar bears. I’m relying on 30+ years of data including mark-recapture data, tracking data, and more. I’m mainly using linear models, mark-recapture models and path analysis models in a Bayesian framework to study the determinants of reproductive output, trade-offs between traits, and such.


    Supervisors:
    Sarah Cubaynes (EPHE, CEFE-CNRS), Jon Aars (Norwegian Polar Institute)

     

    Contact information

    Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
    Orcid: 0000-0003-1489-9363
    GitHub: MarwanNaciri