• Amélie Fargevieille





    Ph.D student 2013-2016 (thesis defended on December, 13th 2016)

    Campus du CNRS

    1919, route de Mende
    34293 Montpellier cedex 5
    Tel: +33(0)4 67 61 33 27

    Email: afargevieille[at]gmail.com


    Research interests:

    Evolution of communication signals

    Evolution of life-history traits

    Comparative methods


    Ph.D project:

    Sexual selection and the evolution of female ornaments:A study of female plumage colouration using comparative analyses and long-term data sets from blue tit populationDSC 6152 069s

    Supervisors:  Claire Doutrelant and Arnaud Grégoire

    Topic: My thesis focused on understanding the contribution of sexual selection in the evolution and maintenance of conspicuous colourations in female birds. 

    A first part tested how paternal care and female reproductive costs drove the evolution of female plumage colouration in songbirds, by the mean of a comparative study using spectrometry, avian visual models and life-history traits (Fargevieille et al. In prep).


    In a second part, a long-term project data set onblue tits (Cyanistes caeruleus) was used to test hypotheses related to the evolution of female ornamentation. Ten years of plumage colouration, from four populations were used to assess the evopairbluetitslution of female ornaments. Genetic correlation (Charmantier et al. 2017), relationships between colouration and survival rate or reproductive success (unpublished) were tested by the means of quantitative genetics, CMR analyses and within-study meta-analyses. Quantification of the degree of assortative mating at the population level - considering spatio-temporal variation - was also tested (Fargevieilleet al. 2017). It led to a more thorough study at the individual level trying to understand factors underlying assortative mating in ourpopulations (Fargevieille et al. In prep.). 

    • Publications:
      • Fargevieille, A., A. Grégoire, A. Charmantier, Maria del Rey Granado, and C. Doutrelant. 2017. Assortative mating by colored ornaments in blue tits: space and time matter. Ecology and Evolution 7:2069-2078.(doi:10.1002/ece3.2822)
      • Charmantier, A., M. E. Wolak, A. Gregoire, A. Fargevieille, and C. Doutrelant. 2017. Colour ornamentation in the blue tit: quantitative genetic (co)variances across sexes. Heredity 118:125-134. (doi:10.1038/hdy.2016.70)
      • Charmantier, A., C. Doutrelant, G. Dubuc-Messier, A. Fargevieille, and M. Szulkin. 2016. Mediterranean blue tits as a case study of local adaptation. Evolutionary Applications 9:135-152. (doi:10.1111/eva.12282)
      • Lambrechts, M. M., J. Blondel, C. Bernard, S. P. Caro, A. Charmantier, V. Demeyrier, C. Doutrelant, G. Dubuc-Messier, A. Fargevieille, C. de Franceschi, P. Giovannini, A. Grégoire, S. Hurtrez-Boussès, A. Lucas, M. C. Mainwaring, P. Marrot, A. Mennerat, S. Perret, and P. Perret. 2016. Exploring Biotic and Abiotic Determinants of Nest Size in Mediterranean Great Tits (Parus major) and Blue Tits (Cyanistes caeruleus). Ethology 122:492:501. (doi:10.111/eth.12494)
      • Lambrechts, M. M., P. Marrot, A. Fargevieille, P. Giovannini, A. Lucas, V. Demeyrier, A. Midamegbe, P. Perret, A. Grégoire, A. Charmantier, and C. Doutrelant. 2016. Nest size is not closely related to breeding success in Blue Tits: A long-term nest-box study in a Mediterranean oak habitat. The Auk 133:198-204. (doi:10.1642/auk-15-214.1)
      • Lambrechts, M. M., V. Demeyrier, A. Fargevieille, P. Giovannini, A. Lucas, P. Marrot, A. Midamegbe, P. Perret, A. Charmantier, C. Doutrelant, and A. Grégoire. 2014. Great Tits build shallower nests than Blue Tits. Avian Biology Research 7:251-254 (doi:10.3184/175815514X14162394225987)
      • Fincke, O.M., A. Fargevieille, and T.D. Schultz. 2007. Lack of innate preference for morph and species identity in mate-searching Enallagma damselflies. Behavioral Ecology and Sociobiology 61:1121-1131.(doi:10.1007/s00265-006-0345-3)

    •  Oral communications in international congresses/conferences:
      • Paternal care and reproductive costs drive the evolution of female ornamentation: comparative analyses in songbirds. XVIth Congress of the European Society of Evolutionary Biology, Groningen (The Netherlands); August 20th-25th 2017
      • Evolution of female ornaments: a role of male mate choice?16th Congress of the International Society of Behavioral Ecology, Exeter (United Kingdom); July 28th- August 2nd 2016
      • Temporal and spatial variation in assortative mating: an example in Blue Tit Mediterranean populations.11th Conference of Ecology & Behaviour, Toulouse (France); May 18th-21st 2015.

    • Poster communications in international congresses/conferences:
      • Spatio-temporal variation in assortative mating: an example in Blue Tit Mediterranean populations. XVth Congress of the European Society of Evolutionary Biology, Lausanne (Switzerland); August 10th-14th 2015.
      • Assessing the role of sexual selection in the evolution and maintenance of female ornamentation: comparative approaches in birds. 1st Congress on Modern Phylogenetic Comparative Methods in Evolution, Sevilla (Spain); November 12th-14th 2014.

      (Pictures courtesy of Marie Danielsen, David Grémillet and Stéphan Tillo)


    Ana 2021 small

    Senior Researcher (Directrice de recherche 1) CNRS

    I am interested in understanding how biodiversity is distributed in space and in time, on the effects of human activities on those spatial and temporal patterns, and on the implications for biodiversity conservation.

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  • Anne Charmantier

    2019 03 23.Arinelle 57 AnnebleueDirectrice de recherche (DR1)

    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier 5

    E-mail : anne.charmantier[at]cefe.cnrs.fr

    Thèmes de recherche: Evolution et génétique quantitative dans les populations naturelles; sénescence; sélection sexuelle.

  • Arnaud Grégoire

    Maître de Conférences à l'Université de MontpellierArnaud GREGOIRE
    Faculté des Sciences, département d'enseignement Biologie Ecologie


    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier cedex 5
    Tél : +33/0 4 67 61 32 58
    Fax : +33/0 4 67 61 33 36

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    Mots clés

    Discipline :Ecologie

    Thématiques : Ecologie évolutive et comportementale, Interactions durables
    Organismes biologiques : Oiseaux, Arthropodes
    Milieu : Terrestre, Marin
    Techniques : Analyse de données, Expérimentation et suivis sur le terrain, Analyses au laboratoire (immunologie), Capture-Marquage-Recapture, Spectrophotométrie
    Autres mots clés : Ecologie Urbaine, Sélection sexuelle, Interactions hôte-parasite, Effets maternels,


  • Aurélie CELERIER


    Maître de Conférences à l'Université Montpellier II

    rencontre nocturne


    Campus du CNRS

    1919, route de Mende
    34293 Montpellier cedex 5

    Tél : +33/0 4 67 61 33 17
    Fax : +33/0 4 67 61 33 36

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  • Aurélie COULON


    Associate Professor in spatial ecology at the Muséum national d'Histoire naturelle                                                                                                                                                        

    My research focuses on movement ecology: I study the factors influencing animal movements (especially dispersal) and gene flow, with a particular emphasis on landscape composition and structure. I also study how human-triggered landscape modifications like fragmentation affect animal movements; and the consequences on population functioning and structure. My research is hence tightly linked to the management/conservation of populations, and to landscape management (e.g. connectivity restoration, french Trame Verte et Bleue policy).

  • Aurélien BESNARD

    altSenior Lecturer / Directeur d'Etudes de l'EPHE

    HDR depuis le 04/09/2013mémoire à télécharger ici

    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier 5

    Tél. :     +33 (0)4 67 61 32 94
    Fax      :+33 (0)4 67 41 21 38

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    Keywords:Biostatistics; Conservation biology; Amphibians; Birds, Reptiles, Quantitative ecology; Population Dynamics and Demography, Sampling designs.


  • Céline TEPLITSKY

    Chargée de Recherche

    My research interests include mechanisms that promote phenotypic variation as well as potential for and constraints on adaptation, framing those questions at the edge between evolutionary and conservation biology. 


  • Charlène GEMARD

    CharleneGEMARD HAIR

    Postdoc – CEFE-CNRS

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    Twitter: @CharleneGemard


    My work focuses on various aspects of behavioural ecology in birds, using non-invasive methods (bioacoustics, videos). During my PhD, I studied the determinisms and implications of vocal signals in mate choice in seabirds. I pursued my research by joining the MAPE research program as a postdoc supervised by Aurélien Besnard and Olivier Duriez. I aim at highlighting factors that increase bird collision risk in windfarms to provide new insights about bird behaviour in wind facilities and to better prevent fatalities.

  • Claire Doutrelant


    Tenure CNRS research scientist (DR)

    CEFE CNRS 1919 Rte de Mende, 34293 Montpellier

    Tél : +33/0 4 67 61 32 60 / Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.


    What news? : post doc position cefe open


  • Claudine MONTGELARD

    Maitre de Conférences (EPHE)

    Campus du CNRS
    1919, route de Mende
    34293 Montpellier 5

     tél : 33 (0)4 67 61 33 04
     fax: 33 (0)4 67 41 21 38

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    Mes thèmes de recherche concernent la phylogénie, la phylogéographie et l'évolution moléculaire à partir de l'analyse des séquences de gènes mitochondriaux et nucléaires. L’objectif est de répondre, à l’aide de l’outil moléculaire, à des questions de biodiversité et systématique évolutive à l’échelle des vertébrés (mammifères, amphibiens et reptiles). Je m’intéresse aussi à l’échelle temporelle (datations moléculaires) des différents niveaux de diversifications ce qui permet de confronter les inférences moléculaires avec les données morphologiques, paléontologiques et biogéographiques.

  • Cyrielle BALLESTER


    Ingénieure d’études – Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE)


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    LinkedIn : https://www.linkedin.com/in/cyrielle-ballester/

    ResearchGate : https://www.researchgate.net/profile/Cyrielle-Ballester


    J’ai rejoint l’équipe HAIR en intégrant le projet MAPE (réduction de la Mortalité Aviaire sur les Parcs Eoliens) en mars 2022. Je travaille sur l’évaluation des SDA (Systèmes de Détection Automatisé) qui sont mis en place sur les parcs éoliens terrestre dans le but de réduire la mortalité aviaire par collision. J’ai notamment coordonné une phase de test de protocoles d’évaluation des performances de ces SDA (volet WP4P2 : https://mape.cnrs.fr/le-projet/contenu-du-projet/).

  • Etienne HENRY

    IMG 3576 min

    PhD candidate - Migratory landbirds conservation

    I am a PhD candidate using tracking data to inform conservation of African-Eurasion migratory landbirds, storks and  raptors.
    The persistent decline observed in migratory bird populations over recent decades highlights the urgent need to improve our scientific understanding of the drivers behind this trend. This comprehension is crucial to support international policies impacting the conservation of these birds across national, European, and inter-continental levels.
    The project results from collaboration between the CEFE, the CIBIO and BirdLife International.

    Project: Mobilising tracking data on African-Eurasian migratory birds to support conservation at the flyway scale.
    Supervisors: Ana Rodrigues (CEFE - CNRS, Montpellier) & Inês Catry (CIBIO - University of Porto).
    Project in collaboration with BirdLife International.

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    CEFE UMR5175 - Campus du CNRS - 1919, route de Mende - 34293 Montpellier 5 - France
    ORCID: 0009-0004-1802-0197


  • Hugo Gruson

    PhD in evolutionary biology on "Origin and functions of iridescent colours in hummingbirds"

  • Interactions Humains Animaux

    Notre équipe travaille sur les interactions entre humains et animaux selon une approche interdisciplinaire qui tient explicitement compte de leurs caractéristiques biologiques, comportementales, sociales et culturelles. Nous nous intéressons en particuliers aux questions de gestion de la faune sauvage et des animaux domestiques en interaction avec les activités humaines. Nous évoluons le long d’un gradient qui va de la conception et de la mise en place de protocoles d’échantillonnage, l’étude de la dynamique et de la distribution des populations, l'étude des savoirs écologiques, des perceptions et des pratiques des acteurs impliqués dans la gestion, jusqu’aux recommandations de gestion et la contribution aux processus de prise de décision et d’élaboration ou d’évaluation de politiques publiques de gestion et de conservation de la nature.

    Afin d’étudier la dynamique des populations sauvages nous développons des méthodes et outils statistiques. La plupart de nos travaux s’inscrivent en biologie et géographie de la conservation. Ceux-ci cherchent à développer des interfaces entre spécialistes en statistiques et gestionnaires d’aires protégées ou conservationnistes pour mieux étudier l’évolution des paramètres démographiques et populationnels des espèces et ainsi définir des politiques de protection, de prélèvement et de gestion plus adaptées.

    Nos travaux mobilisent également des approches et méthodes sociologiques, ethnologiques et de géographie humaine afin de mieux comprendre les relations entre humains et animaux. Nous étudions les savoirs écologiques et éthologiques des populations locales et les rétroactions entre dynamiques de population, écologie spatiale et géographie animale selon les perceptions et pratiques des chasseurs, éleveurs, bergers, agriculteurs, gestionnaires d’aires protégées et environnementalistes.

    A partir de l’analyse des controverses sociopolitiques ou dans le cadre de projets de recherche-action relatifs à la gestion de populations gibiers, des dégâts liés au gibier ou aux grands prédateurs, de populations d’espèces menacées, nous explorons dans différents contextes socio-écologiques, comment l’écologie et les comportements des animaux domestiques et sauvages façonnent les relations des humains avec ces animaux et les réseaux de relations complexes et dynamiques entre acteurs humains ; et comment en retour ces relations façonnent l’écologie et les comportements animaux dans le temps et l’espace.

    Notre équipe a ainsi une activité fortement interdisciplinaire, croisant l’écologie, la géographie, l’ethnologie, la statistique et la modélisation mathématique et multi-agents spatialisée ou non. Nous réalisons une approche critique de nos approches interdisciplinaires et conduisons une réflexion spécifique de longue haleine sur l’interface science/gestion et l’efficacité des politiques publiques. Nous nous impliquons dans de nombreuses missions de conseil scientifiques auprès des services de l’Etat, des gestionnaires d’aires protégées, des organismes locaux, régionaux et internationaux en liens avec la gestion, l’exploitation et la conservation de la faune sauvage. Nous enseignons dans des masters et spécialisations de plusieurs Grandes Ecoles et Universités, en France principalement. Enfin, nous organisons régulièrement des formations spécifiques pour le milieu socio-professionnel des gestionnaires de la nature, les étudiants et les chercheurs.

    Nous entretenons de solides partenariats de long terme avec des acteurs publics (OFB, ex. AFB et ONCFS, Parcs Nationaux), para-publics (CBN, ONF, Réserves naturelles de France, Fédération des Parcs naturels régionaux) et privés (bureaux d’étude, zoos, associations). Partant du constat que nos doctorant.e.s et post-doctorant.e.s ne trouveront pas tou.te.s un poste académique, nous entretenons des liens étroits avec le milieu non-académique dans le souci de leur intégration professionnelle.

    Les trois axes qui structurent l’équipe sont :

    Axe 1 : gestion des populations animales exploitées

    Modèles d’étude : ongulés (sangliers) et oiseaux.

    Partenariat fort avec OFB (ex. ONCFS/AFB) et Fédérations départementales de chasseurs   


    Axe 2 : gestion des populations de grands mammifères

    Grands carnivores (ours, loup, lynx) et cétacés (grands dauphins)

    Partenariat avec fort ONCFS, FDC, associations


    Axe 3 : formation

    Outre l’enseignement académique classique dans lequel nous sommes investis, notre équipe a une activité conséquente dans la formation sous forme d’ateliers pour l’OFB, les bureaux d’étude, la formation continue et les collègues universitaires. Ces formations ont clairement une forte composante de transfert soit des méthodes de modélisation mathématique et d’analyses statistiques de données de sciences écologiques ou humaines, soit des méthodes d’intégration des sciences humaines et sociales avec l’écologie dans des dispositifs interdisciplinaires de recherche ou de recherche-action dans le contexte des interactions humains/animaux ou aires protégées/non protégées.

  • Jean-Louis MARTIN


    Directeur de Recherche Emerite au CNRS / Emeritus Senior Scientist at CNRS


    J’étudie les réponses des communautés animales et végétales aux changements d’origine humaine (espèces introduites, usage des sols), en milieu tempéré et méditerranéen.


    I study plant and animal community response to human induced change (introduced  species, land use) in temperate and méditerranean systems.


    Courriel: jean-louis.martin [at] cefe.cnrs.fr

     JLete2014 petit



  • Jean-Yves BARNAGAUD

    CEFE- RDC, Aile B, bureau 3


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    My research is framed around a comparative exploration of the role of multiple environmental drivers in shaping species distributions and diversity at multiple spatial and temporal scales. Most of my research is structured on the combined use of ecoinformatics methods (statistical analysis of large data sets) and naturalist expertise to understand empirical patterns of community composition in space and time. My main active axes of research include :  

    - functional biogeography of seabirds in the Southern ocean. I try to explain and predict the composition of seabird assemblages with spatial models calibrated with environmental factors, trophic interactions and species traits. The project relies on a large-scale bird counts protocol from ships and statistical model of multiple data types. See the C-BIRDS project and thesis(offer valid until 07/2024).

    -  understanding spatial patterns of vertebrates distributions and assemblage compositions. Relying on various opportunistic or protocoled data sources at multiple spatial scales, I investigate the determinants of spatial patterns in vertebrate distributions and assemblage composition through spatial models based on proxies of historical and contemporary processes. See for instance he MALPOLONdatabase.

    - Ecoacoustics and community ecology. Several active projects focus on the relationship between bird community composition and the characteristics of soundscapes at multiple spatial and temporal scales, in order to explore the acoustic environment in which species interact and its changes with current land-use and climatic dynamics. See the ACOUCENEproject (2022 - 2025, FRB/CESAB)


    Most of my interactions with biodiversity stakeholders are focused on data analysis to answer questions relative to the monitoring of human impacts on biodiversity at a regional or landscape scale.

    - Ecological data analysis. I am involved in initiatives to foster interactions between scientific and non scientific stakeholders with respect to data-based ecological monitoring and expertise. See the website of the CISSTATnetwork. 

    - Analysis of land use influences on common bird assemblages in southern France. I investigate the impact of land use and habitats on the temporal dynamics of local bird assemblages with opportunistic and protocoled data (collaborations with the Ligue pour la Protection des Oiseaux - PACA). 

    - Faunistic road casualties. I work with the Ligue pour la Protection des Oiseaux and the CEREMA to explain and predict spatial patterns in road casualites. We exploit jointly multiple sources of protocoled, non-protocoled and citizen science data to identify mortality hotspots and explanatory factors, with the final aim to inform public policies on the mitigation of traffic impact on vertebrates. See the final report of the COCPITT project (2020-2023).

     - Interacting imprints of climate change and land use on biodiversity. Using multiple taxa and scales, I investigate how species' responses to historical and present land use change interact with their responses to climate change. See the LANDBIO project (2022 - 2023, OFB - french ministry of ecology)



    Most of my teaching activity is embedded within the program of the Ecole Pratique des Hautes Etudes.

    - Data analysis for ecologist : a three-weeks course dedicated to biodiversity stakeholders, framed on the practical use of statistical methods and the R software in ecological monitoring. 

    - Environmental law and policy : I drive a one-week course to introduce environmental public policies to scientific ecologists, involving speakers from various authorities and decision levels and practical training to improve students' written and verbal interactions with non-scientific stakeholders.

    - Methods for ecological monitoring : a two-weeks course with Aurélien Besnard, mainly dedicated to master students and biodiversity stakeholders, to improve their skills and critical thinking in advanced numerical methods for ecology, including species distribution modeling, population dynamics, sampling design and analysis of diversity indices.

    - Environmental changes and ecological science :I contribute to several courses on global changes and environmental monitoring. My teaching is focused on the interactions between science and society through several lenses including epistemology and governance / spatial planning.


  • Jules CHIFFARD

    Phd student - DoctorantChiffard Carricaburu 2014

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    Research : Climatic and biotic drivers of species distributions in alpine landscapes -- Distribution des oiseaux dans les socio-écosystèmes montagnards

    Project : A long-term bird survey for mountain landscape birds -- Un suivi participatif national à long terme des oiseaux de montagne (!)


  • Killian GREGORY

    PhD student – University of Montpellier



    I’m a PhD student interested in animal behaviour and cognition, and how they translate into the spatial and demographic dynamics of populations. During my PhD, I focus on the interplay between individual movements and the dynamics of population networks through two case studies: 1) migratory connectivity and its relationship with the demography of migratory populations; 2) informed dispersal and its implications for the structuring and the stability of larid colonies. Linking individual and population-level processes leads me to draw on methods from both behavioural ecology and population biology.


    Supervisors: Pierre-André CROCHET (DR, CNRS), Aurélien BESNARD (DE, EPHE).


    Contact information

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    Orcid: https://orcid.org/0000-0002-0316-5041
    CEFE, 2ème étage aile C, bureau 202A

  • Lise ROY

    Roy Lise small

    Maître de Conférences, Université Paul Valéry Montpellier III


    Intéressée par les dynamiques de populations d’arthropodes en agroécosystèmes, j’étudie (1) les effets de l’interférence entre activités agricoles et deux grandes forces évolutives sur les arthropodes - la migration et la sélection naturelle –, (2) les interactions biotiques impliquant des arthropodes bioagresseurs et auxiliaires potentiels. Je dirige ces travaux suivant une approche transdisciplinaire à l'interface entre recherche fondamentale et recherche opérationnelle.


    I am interested in the dynamics of arthropod populations in agroecosystems and am studying (1) the effects of interference between farming activities and two major evolutionary forces on arthropods - migration and natural selection - and (2) biotic interactions involving arthropod pests and potential beneficials. I lead this work following a transdisciplinary approach at the interface between fundamental and operational research.


    Courriel : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.