Evolutionary history of coelacanths

Lionel Cavin

Muséum d'histoire naturelle de la Ville de Genève, Suisse

(Talk in English)

Le vendredi 27 mai 2016 - Bât 22, Salle Louis Thaler de l'ISEM - 11h30

The fishing of living coelacanths (Latimeria) in the Indian Ocean was regarded as one of the major zoological discoveries of the XXth century. It was hoped that the morphological and ethological study of this sluggish fish would shed light on the fish – tetrapod transition. This talk will focus on another, less well-known aspect of the evolutionary history of the actinistians (the clade of coelacanths) with special emphasis on the Mesozoic fossil record of the group. We will address various issues such as the supposedly slow rate of morphological evolution of these fishes, the palaeobiogeographical signal of the clade and the validity of the more general concept of ‘living fossils’.

Lionel Cavin is the curator of the geology and paleontology department of the Natural History Museum of Geneva, Switzerland. His research deals mostly with the anatomy, phylogeny, biogeography and other aspects of the evolutionary history of Mesozoic bony fishes (Actinopterygii, Dipnoi and Actinistia). The fossil material under study concerns mostly material from Europe, North Africa and SE Asia.

Recent publications:

Cavin L., et al. (2015). Taxonomic Composition and Trophic Structure of the Continental Bony Fish Assemblage from the Early Late Cretaceous of Southeastern Morocco. PLoS ONE 10(5): e0125786.

Cavin, L. & Guinot, G. (2014). Coelacanths as “almost living fossils”. Frontiers in Ecology and Evolution 2:49. doi:10.3389/fevo.2014.00049.

Guinot, G. & Cavin, L. (2015) ‘Fish’ (Actinopterygii and Elasmobranchii) diversification patterns through deep time. Biological Review. doi: 10.1111/brv.12203

 

Contact Melanie Debiais-Thibaud; Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

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Mieux gérer et protéger les océans grâce aux oiseaux

11 mai 2016

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Observer les océans à travers les yeux des oiseaux marins pour mieux gérer et protéger ces écosystèmes à la fois menacés et méconnus : c’est cette approche novatrice, soutenue par la Fondation de France, que propose une équipe internationale composée d’un gestionnaire d’espace naturel et de scientifiques français et japonais dont des chercheurs du Centre d’écologie fonctionnelle et évolutive et de l'Observatoire PELAGIS (CNRS/Univ. de La Rochelle).

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In search of the causes of evolution: Darwin's finches on Galapagos

 Conférence L Thaler : Rosemary Grant & Peter Grant Bahn

Le vendredi 13 mai 2016 - Amphithéatre de la Délégation CNRS - 11h30

Ecological research often produces messy data that necessitates flexible and complex models. However, complex models can overfit data, leading to a decoupling between goodness-of-fit and predictive power of the model, making goodness-of-fit an unsuitable evaluation measure. The alternative is to hold out test data for evaluation. However, when autocorrelation is present in model residuals, training and test can lack independence and model evaluation will be overly optimistic. I discuss strategies for decoupling training and test data in the context of species distribution models. While these strategies can reduce the underestimation of model error, they can introduce over-estimation of error by introducing extrapolation in variable space. This problem can be addressed by explicitly testing for analog conditions between training and test data, leading to realistic error estimates.

La conférence Louis Thaler est organisée dans le cadre des Séminaires d’Ecologie et d’Evolution de Montpellier, avec le soutien du LabEx CeMEB.

Contact Ana Rivero (Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.)

 

Expositions au CEFE

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© Aurélien Brusini 

« La biodiversité cachée des sols des forêts tropicales humides » par Thibaud Decaëns.

Cette exposition présente une sélection de photos illustrant la diversité des écosystèmes guyanais et des organismes qui peuplent leurs sols. L’accent est mis sur des groupes de macro-invertébrés qui, malgré les fonctions écologiques essentielles qu’ils remplissent, restent encore trop largement méconnus tant d’un point de vue taxonomique qu’écologique.

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Why do we age? Human disease genes and natural selection

Arcadi Navarro

ICREA and Universitat Pompeu Fabra, Barcelona

(Talk in English)

Le vendredi 20 mai 2016 - Bât 22, Salle Louis Thaler de l'ISEM - 11h30

Senescence, the process of organismic decay with ageing, is a public health challenge and a fascinating evolutionary problem. There is neither a universally accepted theory for its ultimate causes, nor a consensus about what may be its impact on human health. We tested the two most well-known evolutionary explanations of senescence, mutation accumulation and antagonistic pleiotropy, which postulate that genetic variants with harmful effects in old ages can be tolerated by natural selection, or even favored by it at early ages. We studied the effects of genetic variants associated with diseases appearing at different periods in life, when they are expected to have different impacts on fitness and observed that data fit theoretical expectations. Namely, we observe higher risk allele frequencies combined with large effect sizes for late-onset diseases; we also detect a significant excess of early-late antagonistically pleiotropic variants which, strikingly, tend to be harbored by ageing-related genes. Beyond providing the first systematic, genome-wide evidence for evolutionary theories of senescence in our species and shedding new light on the long-standing question of whether senescence is the result of adaptation; our approach has the potential of revealing a plethora of unexpected relationships between previously unrelated pathologies.

Recent publications:

Lappalainen et al. 2015. The European Genome-phenome Archive of human data consented for biomedical research. Nature Genetics 47: 692–695.

Santpere et al 2015. Analysis of five gene sets in chimpanzees suggests decoupling between the action of selection on protein-coding and on non-coding elements. Genome Biology and Evolution 7: 1490-1505.

Olald et al 2014. Derived Immune and Ancestral Pigmentation Alleles in a 7,000-Year-old Mesolithic European. Nature 507, 225-228.

Contact Ana Rivero; Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

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Tchernobyl, 30 ans après

Réalisation d’une expérience en milieu forestier sur les effets de la radioactivité sur la décomposition des litières dans la zone d’exclusion de Tchernobyl. 

Tchernobyl JM Bonzom

©Jean-Marc Bonzom/IRSN

Le 26 avril 1986 le réacteur n°4 de la centrale nucléaire de Tchernobyl explosait. En dix jours, ce sont près de 12 milliards de milliards de becquerels qui seront partis dans l’environnement. Les effets à long terme de cette pollution radioactive sur les organismes et les systèmes écologiques restent encore mal connus. Dans une étude récente, des chercheurs de l'IRSN (Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire à Cadarache) en collaboration avec des chercheurs CNRS du CEFE (Montpellier) et d’EcoLab (Toulouse) viennent de montrer que le recyclage de la matière organique, à travers la décomposition d’une litière de feuilles, tend à être accéléré avec l'augmentation des rayonnements ionisants absorbés par les organismes décomposeurs. Les mécanismes sous-jacents de ce phénomène surprenant restent à être éclaircir. Un changement du taux de ce processus écologique majeur pourrait affecter le fonctionnement des écosystèmes sur le long terme. lire la suite

Planète Collemboles, la vie secrète des sols

Planète collemboles, la vie secrète des sols

 

 

Jérôme Cortet & Philippe Lebeaux

Biotope eds (Mèze), 2015

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