Signature chimique et insectes sociaux - Aspects intégratifs / Bilan et projet d'intégration au sein du département InES au CEFE

Séminaire Exceptionnel

Signature chimique et insectes sociaux - Aspects intégratifs / Bilan et projet d'intégration au sein du département InES au CEFE

Anne-Geneviève Bagnères
Dir. de Recherche CNRS
Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte UMR CNRS 7261
Directrice GDR 3658 – MediatEC
Responsable IRBI / équipe Ecologie chimique et évolutive des insectes sociaux (ECEIS)


Ce séminaire va me permettre de faire connaitre mes activités au cours de ces 15 dernières années à l’IRBI (Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte), avec mon équipe intitulée « Ecologie chimique et évolutive des insectes sociaux ». L’étude des termites européens que j’ai développée tout au long de ma carrière montre que ces insectes sociaux possèdent, entre autre, des stratégies de reproduction originales, et une histoire évolutive qui explique pourquoi s’est posée depuis bien longtemps la question des invasions biologiques. D’autre part j’ai été un de ceux à l’origine du concept de signature chimique chez les insectes dès les années 80s. A travers différents travaux je montrerai la complexité de son rôle et les régulations extraordinaires qui peuvent se trouver dans la nature. Enfin, je décrirai quelques projets que je pourrai développer au CEFE dans le département « Interactions, Ecologie et Sociétés » et l’équipe « Interactions Biotiques ».


Perdereau, E., Dedeine, F., Christidès, J.-P., Dupont, S., & Bagnères, A.-G., 2011. Competition between invasive and indigenous species: an insular case study of subterranean termites. Biological invasions, 13, 1457-1470.
Kutnik M., Uva P., Brinkworth L. & Bagnères A.-G., 2004. Phylogeography of two European Reticulitermes (Isoptera) species: the Iberian refugium. Molecular Ecology, 13, 3099-3113.
Bagnères A.-G. & Lorenzi C., 2010. Chapter 14. Chemical deception/mimicry using cuticular hydrocarbons, pp. 282-324. In: Insect Hydrocarbons: Biology, Biochemistry and Chemical Ecology. Eds Blomquist GJ & Bagnères A-G. Cambridge University Press.
Bonelli M., Lorenzi M.C., Christidès J.-P., Dupont S. & Bagnères A.-G., 2015. Population diversity in cuticular hydrocarbons and mtDNA in a mountain social wasp. Journal of Chemical Ecology, 41, 22-31.
Perdereau E., Bagnères A.-G., Vargo E.L., Baudouin G., Xu Y., Labadie P., Dupont S. & Dedeine F., 2015. Relationship between invasion success and colony breeding structure in a subterranean termite. Molecular ecology, 24, 2125-2142.
LeConte Y., Huang Z.Y., Roux M., Zeng Z. J., Christidès J.-P., Bagnères A.-G., 2015. Varroa destructor changes cuticular hydrocarbons to mimic its new host, even when the new host is of a different species. Biology Letters 11(6): 20150233.


Vendredi 24 mars 2017
Grande salle de réunion du CEFE - 14h | 1e étage, aile C | 1919 route de Mende
Contact au CEFE: Finn KJELLBERG

How Cetaceans Sing

 

Joy

Joy Reidenberg

Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, USA

Le vendredi 24 mars 2017 - 11h30 Grande Salle CEFE (1919 Rte de Mende, 1e étage, aille C)

Cetaceans (baleen and toothed whales, including dolphins and porpoises) produce sound underwater for communication, prey capture, and navigation. Despite their close phylogenetic relationship, these two cetacean groups have evolved in opposite directions regarding their sound producing mechanisms. Baleen whales use the larynx to vocalize in the low frequency (infrasonic) range, while toothed whales use the nasal region to generate high frequency (ultrasonic) clicks for echolocation and navigation. This talk will explain the anatomical mechanisms of cetacean sound generation and transmission to water, and the divergent evolutionary trajectories these two groups have followed. Comparisons will be made to the whale’s closest relative (the hippopotamus), as well as to a range of other aquatic and terrestrial mammals including humans.

 

Recent publications:

Cazau, D, Adam, O, Aubin, T, Laitman, JT, Reidenberg, JS (2016) A study of vocal nonlinearities in humpback whale songs: from production mechanisms to acoustic analysis. Nature: Sci. Rep. 6:31660

Adam, O, Cazau, D, Gandilhon, N, Fabre, B, Laitman, JT, Reidenberg, JS (2013) New acoustic model for Humpback whale sound production. J. Applied Acoustics 74(10):1182-1190.

Cazau, D, Adam, O, Laitman, JT, Reidenberg, JS (2013) Understanding the intentional acoustic behavior of humpback whales: A production-based approach. J. Acoust. Soc. Am., 134 (3):2268-2273.

Reidenberg, JS, Laitman, JT (2007) Discovery of a Low Frequency Sound Source in Mysticeti (Baleen Whales): Anatomical Establishment of a Vocal Fold Homolog. Anat. Rec. 290:745-760.

 

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Formation avancée à la RAP (recherche action participative)

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 Cette formation avancée est organisée pour les personnes ayant déjà suivi une formation introductive à la RAP. Elle est destinée aux chercheurs, doctorants et acteurs des sciences participatives :
- qui sont déjà engagés dans un programme de recherche participative et pour lequel ils auront développé des interrogations sur des aspects précis de la RAP;
- qui souhaitent développer un projet de recherche s’appuyant sur les outils de la participation.
 
Formation avancée: Recherche Action Participative
 

Le GDR PARCS organise les 12, 13 et 14 avril une formation RAP avancée qui sera animée par Jacques Chevalier (www.sas2.net).

Lire la suite : Formation avancée à la RAP (recherche action participative)

Co-Construire le Tourisme Autochtone par la Recherche-Action Participative et les Technologies de la Communication

 

Une nouvelle approche de la gestion des ressources et des territoires  

Les Peuples Autochtones sont confrontés à de nombreux défis cumulatifs : changements climatiques, extraction minière, dépendance économisylvieque, érosion des savoir-faire, perte de la langue et des cultures. Pour y répondre, des opérateurs autochtones ont développé des activités touristiques, dans le but de faire entendre leur voix, d'appuyer leurs revendications territoriales, de générer des revenus financiers et de maintenir les liens avec leur territoire. En vue de revisiter la recherche-action participative et de l'adapter au contexte autochtone, des collaborations de recherche ont ainsi été développées avec treize communautés du Nord Canada (Cri et Inuit) et du Nord Scandinavie. Ce sont ces expériences qui sont ici présentées. En savoir plus

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Éléments transposables et diversité des génomes

 

Cristina

Cristina Vieira-Heddi  

UMR 5558 Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, CNRS & Université de Lyon 1

Le vendredi 17 mars 2017 - 11h30 Grande Salle CEFE (1919 Rte de Mende, 1e étage, aille C)

Au cours des dernières décennies, des efforts considérables ont été faits pour comprendre les interactions entre les génomes hôtes et les éléments transposables (ET). L'impact des ET sur la régulation des génomes hôtes est bien connu, les ET pouvant agir comme plate‐formes de séquences régulatrices ou encore comme des
médiateurs de modifications épigénétiques. Beaucoup d’hypothèses présentent les ET comme des intermédiaires importants dans la réponse aux changements de l’environnement, mais peu de travaux empiriques traitent la question au niveau populationnel. Lors de ce séminaire je dresserai un panorama des études de
génétique de populations d’ET, y compris les aspects moléculaires. Je présenterai ensuite des résultats récents qui mettent en évidence la diversité de réponses des génomes hôtes en fonction de leur profil en ET, et de l’environnement abiotique et génomique.


Recent publications:
Lopez et al (2017) Transposable elements and genes are under control in hybrids between Drosophila‐related species. Scientific reports:doi:10.1038/srep40618.
Lerat E, Fablet M, Modolo L, Lopez H, Vieira ( 2016) C TETOOLS: a dedicated method to the analysis of TE expression reveals a negative link between TEs and piRNA genes activities.
Goubert et al (2015) De novo assembly and annotation of the Asian tiger mosquito (Aedes albopictus) repeatome with dnaPipeTE from raw genomic reads and comparative analysis with the yellow fever mosquito (Aedes aegypti) GBE 7: 1192‐1205.

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New phylogenetic comparative methods and their ap-plication to our understanding of phenotypic evolu-tion and diversification

Hélène Morlon  

CNRS - Ecole Normale Supérieure, Paris

Le vendredi 10 mars 2017 - 11h30 Grande Salle CEFE (1919 Rte de Mende, 1e étage, aille C)

Comparative phylogenetic methods, often based on stochastic evolutionary models, are fundamental to our understanding of phenotypic evolution and diversification. Abiotic changes and biotic interactions are thought to play a major role in these evolutionary processes, yet they haven’t explicitly been accounted for in compara-tive phylogenetic models. I will present recent developments aimed at bridging this gap. In particular, I will present models that allow testing the role of abiotic variables on rates of speciation, extinction and phenotypic evolution, as well as models that allow testing the role of species interactions -- such as competitive, mutualis-tic, and antagonistic interactions – on phenotypic evolution. I will then present applications of these new phy-logenetic comparative methods to empirical datasets. Our results suggest that climate played a major role in driving evolutionary rates, with faster phenotypic evolution in cool climates, and faster diversification in warm climates. They also point to the crucial role of competitive character displacement and biogeographic history in explaining the patterns of variation in phenotypic diversity that we observe today. I will end by discussing fu-ture directions in the development of phylogenetic comparative methods.
Recent publications:
Lewitus, E., Morlon, H. (2016) Natural constraints to species diversification PLoS Biology 14(8): e1002532
Drury, J., Clavel, J., Manceau, M., Morlon, H. (2016) Estimating the effect of competition on trait evolution us-ing maximum likelihood inference Systematic Biology 65: 700-710.
Lewitus, E., Morlon, H. (2016) Characterizing and comparing phylogenies from their Laplacian spectrum Sys-tematic Biology 65: 495-507.
Morlon, H. (2014) Phylogenetic approaches for studying diversification Ecology Letters 17: 508-525.

ContactFabien Condamine

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Séminaire et Atelier : Data Sharing, Archiving and Discovery: Tips and Tools

Séminaire et Atelier

Mercredi 8 mars 2017

9h-12h

Amphithéatre de la Délégation Régionale 13 du CNRS
1919 route de Mende | Montpellier

Sans titre

Data Sharing, Archiving and Discovery: Tips and Tools

William Michener

Professor and Director of e-Science Initiatives

College of University Libraries & Learning Sciences

University of New Mexico, Albuquerque, NM 87131-0001 USA

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9h-10h - Seminar: Biodiversity and environmental scientists are increasingly generating, preserving and sharing large volumes of data—thereby supporting broader scale research, meta-analysis, model parameterization, reproducibility and transparency. The increased availability of data has been driven by sociocultural changes including new attitudes and perceptions of funding agencies, publishers and scientific communities of practices. Technology has also played a key role via the introduction and adoption of community-based data repositories, software tools, data and metadata standards, and persistent identifiers. In this talk, Bill will identify a suite of best practices and software tools that enable data sharing and archiving, promote data discovery and use, and contribute to scientific reproducibility.

10h-10h30 – Pause rafraîchissements (offerts par la FRB)

10h30-12h - Post-seminar workshop: Tips and tools for managing data throughout the data life cycle will be examined—ranging from data entry and organization, quality assurance/quality control, metadata management, data preservation, data discovery and communication of findings.

Brief Bio: William Michener is Professor and Director of e-Science Initiatives at the

University of New Mexico’s College of University Libraries & Learning Sciences.  He serves as Project Director for New Mexico’s US National Science Foundation (NSF) and US Department of Energy EPSCoR (Experimental Program to Stimulate Competitive Research) Programs, and Data Observation Network for Earth (DataONE)—a large DataNet project supported by NSF. He is involved in research related to creating information technologies supporting data-intensive science, devel-opment of federated data systems, and community engagement and education. He has a PhD in Biological Oceanography from the University of South Carolina and has published extensively in marine science, as well as the ecological and infor-mation sciences. He serves on several Boards of non-profit organizations and has expertise in project management and meeting facilitation. He is Editor of Ecological Archives, Associate Editor for Ecological Informatics, and a member of the Editorial Board for Ecology.

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