Soutenance de Thèse : Aloïs Robert

 
Soutiendra publiquement ses travaux de thèse intitulés :
Evolution des signaux de communication au sein des communautés

Le vendredi 28 juin 2019 à 13h30
Amphithéâtre de la délégation régionale – CNRS 

            La communication est essentielle à de nombreuses fonctions vitales en permettant le transfert d’information entre les individus via des signaux. Alors que les fonctions de ces signaux ainsi que les contraintes à leur propagation ont été intensivement étudiées, leur évolution a majoritairement été envisagée à travers le prisme de la dyade constituée par l’émetteur du signal et le récepteur du signal. Pourtant les signaux sont toujours émis au sein de communautés sensorielles et de nombreuses interactions interspécifiques conditionnent les pressions de sélections qui les affectent. Dans cette thèse je me suis intéressé aux liens entre différentes composantes de la composition des communautés et l'évolution du chant et de la couleur chez les oiseaux. Tirant partie des conditions particulières retrouvées dans les îles océaniques, j'ai étudié comment les changements de richesse spécifique, densité de conspécifique et présence de prédateur étaient susceptibles de modifier les comportements de communication et les caractéristiques des signaux émis. Cette approche écologique de l'évolution des signaux est nécessaire pour comprendre leur évolution au sein de communautés sensorielles. Elle m’a permis de mettre en évidence le rôle potentiellement majeur des interférences acoustiques sur la niche sensorielle des espèces ainsi que celui de la prédation sur les changements de coloration en milieu insulaire. Dans le dernier chapitre de cette thèse, je me suis intéressé à un phénomène complémentaire en étudiant les liens entre l’extravagance des signaux et la dynamique des populations au sein des communautés aviaires. Cette thèse produit des éléments forts pour affirmer que la composition des communautés détermine une part des pressions évolutives conditionnant la communication mais qu’à l'inverse, les liens entre caractéristiques des signaux et la composition des communautés sont complexes et difficile à déterminer.
 
Mots clefs : communication, communautés, évolution des signaux, bioacoustique, insularité
 
Abstract
 
            Communication efficiency is related with many essential functions determining the fitness of individuals. Mating signals leads to reproductive isolation, and hence to speciation and a huge amount of studies focused on their evolution. However signals are shaped by environmental properties including the composition of signalling community but this have been understudied. Here, I examined the link between different components of communities’ composition and the evolution of two mating signals: song and coloration in birds. Taking advantage of the particular conditions found in oceanic islands, I studied how species richness, conspecific density, and predator presence were likely to alter communication behaviors and the peculiarities of the transmitted signal. In doing so, I adopted an ecological approach of communication study which I believed to be necessary to understand the evolution of signal within sensory spaces. In the last chapter of this thesis, I focused on a complementary phenomenon by studying how such signals can be deleterious for species decreasing the life expectancy of populations. Overall, this thesis produces additional evidence that the composition of communities partly determines evolutionary pressures conditioning the communication and that conversely, signal characteristic can affect the composition of the communities by determining the viability of certain populations.
 
Keywords: communication, communities, signal evolution, bioacoustic, insularity
 
Membres du jury:   
 
 Dr. Clémentine VIGNAL   Prof., IEES-Sorbonne Université   Rapporteur 
 Dr. Jérôme SUEUR  MCF, CNRS-MNHN-UPMC-EPHE  Rapporteur
 Dr. Bruno FAIVRE  Prof., Université de Bourgogne  Examinateur
 Dr. Pierre-André CROCHET  DR2, CEFE-CNRS  Examinateur
 Dr. Claire DOUTRELANT  CR, CEFE-CNRS  Directrice
 Dr. Doris GOMEZ  CR, CEFE-CNRS  Co-Directrice
 
 
 
 

Louis Thaler Seminar - Human evolution

Virpi

Virpi Lummaa

University of Turku, Finland

Le vendredi 28 juin 2019 - 11h30 Amphithéâtre de la délégation du CNRS (route de Mende)

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Soutenance de Thèse : Pierre Denelle

Soutiendra publiquement ses travaux de thèse intitulés
Nature et signature de l’optimalité dans l’assemblage des communautés

Soutenance prévue le mardi 4 juin 2019 à 13h30
Lieu : Amphithéâtre de la délégation régionale – CNRS

What drives taxonomical and functional turnovers of the assembly of organisms along environmental gradients? The idea that persistence and coexistence depend upon the adaptation to local environmental conditions constitutes a fundamental hypothesis. A phenotypic combination associated to a maximal per capita growth rate value then defines a local functional optimality. This notion of optimality motivates the study of trait ~ environment relationships in ecology and biogeography, and implies that a spe-cies with a phenotype close to the local optimum will be more abundant or have a more important biomass locally. Under this hypothesis, we expect that three funda-mental facets of performance, local abundances, per capita growth rates and ecologi-cal generalization, to be shaped by the distance to optimality along environmental gradients. However, other ecological processes such as competitive interactions be-tween species and dispersion from a regional pool of species can modify the ranking of local performance. How these processes affect the dimensions of performance of organisms is still misunderstood. This thesis then addresses the following questions: (i) how the functional composition within a regional pool of species and the local func-tional optimality jointly influence the functional composition of communities?, (ii) what is the functional signature of generalization along environmental gradients?, (iii) how additional processes can modify the trait ~ environment relationships?, (iv) how to infer the relative contributions of these processes from taxonomical and functional composition of communities? Mechanistic models and observed plant communities are used to answer these questions.

Keywords : Community assembly, Biodiversity scaling, Local functional optimality, Functional traits
 
Membres du jury:
M. Franck Jabot      LISC IRSTEA de Clermont-Ferrand    Rapporteur           
 M. Mathew Leibold  University of Florida           Rapporteur
 M. Nicolas Gross    UMR Ecosystème prairial INRA – Clermont-Ferrand   Examinateur
 M. David Mouillot    Um1 UMR - MARBEC Montpellier  Examinateur
 
 

Séminaire CEFE : Bottom-up conservation, engaging with the local com-munity to develop better conservation actions

Mardi 18 juin 2019 – 11h00
Grande salle de réunion du CEFE | 1e étage, aile C

Hernan Caceres-Escobar
The University of Queensland, Australia

The World’s biodiversity faces major threats which have resulted in an extensive crisis. Invasive species have been identified as one of the main threats to biodiversity worldwide and Australia is no exception. Managing the impacts of invasive species requires that conservation managers spend limited time and economic re-sources understanding the multiple dimensions of species management. Overlooking the local economic, eco-logical, and social dimensions could jeopardise the project before it is even implemented. In essence, the path seems to be straightforward: “1) gather some information, 2) create management alternatives, 3) implement some actions, and 4) celebrate success”. In this talk, my aim is to discuss the multidimensional challenge that conservation managers face and present some of the work I did in Australia to help decision-makers with two of the most threatening species to the native Australian fauna: feral cats and red foxes. I will start by introducing an approach to create, assess, and select competing management actions alongside the local community, based on adaptive management principles and INFFER, a cost-benefit analysis tool. To then discuss two modelling approaches to assess the possible ecosystem outcomes from implementing the preferred conservation actions. By following this approach, we were able to provide valuable information to local practitioners regarding local conservation preferences, financial requirements, and the effort needed to manage invasive species; before jeopardising limited funding to actions that may not achieve local conservation goals. More importantly, it helped us to secure long-term commitment by empowering the local community to participate in species man-agement planning.


Recent paper:
Caceres‐Escobar, H., Kark, S., Atkinson, S.C., Possingham, H.P., Davis, K.J. (2019). Integrating local knowledge to prioritise invasive species management. People and Nature. DOI: 10.1002/pan3.27

 

(Seminar in English)


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Changement climatique et estuaires: le prix du sel

Mbaye TINE

 

Mbaye TINE

Université Gaston Berger – Saint-Louis, Sénégal

Le vendredi 14 juin 2019 - 11h30 Campus Triolet Univ Montpellier: amphi 23.01 - Bât. 23

Le réchauffement climatique soumet les écosystèmes aquatiques dont les écosystèmes côtiers à des contraintes fortes, dont l'une est une tendance à la sur- ou même l'hypersalinité. Les fonctions biologiques des organismes soumis à ces contraintes sont fortement affectées et des conséquences peuvent être observées au niveau des individus, des populations et des écosystèmes. Dans cet exposé, nous nous focaliserons essentiellement sur le cas d'un fleuve et d'un estuaire complexe d'Afrique de l'Ouest, le Sine Saloum, et d'un tilapia euryhalin (Sarotherodon melanotheron) et nous proposerons une revue des impacts causés par le stress salin sur les traits de vie de ce poisson ainsi que des corrélats au niveau moléculaire. Nous présenterons quelques résultats originaux et esquisserons des pistes pour des études éco-évolutives.

Contact of the inviting person : Bruno GUINAND (ISEM) Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. & Jean-François BAROILLER (ISEM) Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

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The P-element invasion of Drosophila simulans

Andrea Betancourt

Andrea Betancourt

Institute of Integrative Biology, University of Liverpool, UK.

Le vendredi 21 juin 2019 - 11h30 Campus Triolet Univ Montpellier: amphi 23.01 - Bât. 23

Transposable elements are widespread genomic parasites, and the archetypal example of a selfish gene, which can impose large fitness costs on their hosts. The key to their long-term persistence may therefore be the ability to spread between hosts, as exemplified by the invasion of Drosophila melanogaster by the P-element. This transposable element originated in a distant relative and spread through D. melanogaster in the latter half of the 20th century.  Recently, we discovered a second invasion of a Drosophila species by the P-element.  We find that the P-element spread through D. simulans rapidly and nearly simultaneously on three continents, with strains containing P-elements being rare in 2006 and common by 2014. Remarkably, the flies appear to have evolved to adapt to the presence of the P-element in this short time frame: fly strains collected from the early phase of this invasion are vulnerable to DNA damage from the P-element, while those from the latter phase are not.  We investigate the genetic basis of this resistance, and find it appears to have little to do with the small RNA defence usually invoked in transposable element suppression.

 

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Séminaire CEFE : Why do organisms grow?

Jeudi 6 juin 2019 – 14h00
Grande salle de réunion du CEFE | 1e étage, aile C

 

Dustin MARSHALL
Monash University, Melbourne, Australia.
 

This seems like a simple question that was answered a long time ago. The more I read howe-ver, the less confident I am that we actually know why organisms are the size they are. I have been trying to understand the proximate and ultimate drivers of biological size. Using a se-ries of artificial selection experiments, experimental evolution and comparative analyses, I have been exploring both the causes and consequences of size, mostly using fish, E. coli, and phytoplankton. In this talk, I will argue that many of the more famous models of growth have assumptions that don’t match reality, with calamitous consequences for the management of exploited species. Hopefully, I will show that better understanding of growth and size is es-sential if we are to predict the impacts of human activities on biology.


(Seminar in English)


Contact au CEFE :  LM Chevin