Doctorant

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Titre de la thèse : Ecologie de la conservation des Rhopalocères et Odonates en France

Bourse CIFRE avec l'entreprise BIOTOPE

Filière doctorale: EERGP
Champ disciplinaire: Biologie de la conservation

Les Rhopalocères (papillons de jour) et les Odonates (libellules) sont deux taxons présentant une diversité importante et constituant un maillon important dans le fonctionnement des écosystèmes (pollinisation, réseaux trophiques, interactions multipartites, …). Leur présence et leur maintien dépendent étroitement des caractéristiques de l’environnement (par exemple, via une dépendance plus ou moins spécialisées pour les Rhopalocères et leurs plantes nourricières), ils montrent une vulnérabilité accrue face aux changements globaux. Faisant partie des groupes d’insectes les plus étudiés, notamment du fait de leur qualité de bioindicateurs, ils ont récemment permis de mettre en évidence les conséquences de changements environnementaux, par des réponses biogéographiques (modifications d’aire de répartition, …), biologiques (adaptations de biocycles, …) ou morphologiques.

            En lien avec ces constats, plusieurs évaluations récentes de ces deux taxons mettent en évidence un déclin généralisé d’un nombre croissant d’espèces, dont environ 15% des Rhopalocères et 27% des Odonates considérés menacés d’extinction en France. Ces données révèlent l’enjeu important que représente leur conservation et la nécessité d’améliorer la prise en compte de ces organismes dans les politiques de protection de l’environnement et d’aménagement du territoire. Dans cette optique, il apparait également essentiel d’être capable de quantifier leur présence le plus précisément possible, afin d’évaluer au mieux la répartition et l’importance de leurs populations et de planifier des stratégies de conservation pertinentes.

L’objectif principal de ma thèse CIFRE est d’évaluer l’état de conservation de ces deux groupes d’espèces et d’identifier les moyens et les priorités de conservation. Pour cela, mon travail propose d’étudier la réponse des Rhopalocères et Odonates face aux changements globaux à l’échelle de la France, en intégrant les principaux facteurs conditionnant leur présence (gradients environnementaux, traits biologiques, …). Les relations entre les Rhopalocères et leurs plantes-hôtes constituant une composante essentielle de leur cycle biologique, ce travail porte également sur une construction et une analyse du réseau d’interactions bipartite papillons-plantes comme entrée opérationnelle et intégrative pour leur conservation (identification des principaux modules, espèces centrales et périphériques, impact de la dynamique du paysage sur sa structure, …).

Reposant sur un lien entre les aspects fondamentaux et opérationnels, cette thèse a aussi pour but d’évaluer l’exhaustivité des protocoles d’échantillonnage de ces taxons (richesse spécifiques, cortèges, statut des espèces, …), notamment dans le cadre des études réglementaires conduites lors de l’élaboration de projets d’aménagements. A partir d’une identification des facteurs influençant significativement cette exhaustivité et d’une analyse de la détectabilité des espèces de Rhopalocères et Odonates en France méditerranéenne, ce travail permettra de proposer des pistes d’amélioration afin de construire un protocole d’inventaire standardisé et optimal.

Liste de publications

Belenguier L., Delpon G. (2015) Sur la détection de Somatochlora arctica et l’estimation de ses populations : l’exemple de la tourbière de la Pignole dans le Cantal (Odonata : Corduliidae). Martinia, 31(1), 35-46.

Delpon G., Costes A., Alquier D., Haber E., Polisset P., Pelozuelo L. (2014) Nouvelles observations de Macromia splendens en région Midi-Pyrénées (Odonata: Macromiidae). Martinia, 30 (2), 47-58.

Delpon G., Belenguier L., Krieg-Jacquier R., Boeglin Y., Blanc C. (2014) Comportement adaptatif de Leucorrhinia pectoralis lors de l'émergence en conditions de hautes eaux: conséquences pour la gestion conservatoire des populations (Odonata: Libellulidae). Martinia, 30(1), 1-6.

Read more: Marine EL ADOUZI

Post-doctorante
UMR-CEFE
CNRS
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Activités de Recherche

Dynamique évolutive des espèces en réponse aux changements climatiques passés.
Les événements historiques responsables de la fragmentation des populations suivie d’événements de recolonisation ont fortement modifié la structure de la diversité génétique des espèces. La glaciation ou l’aridification au cours du Dernier Maximum Glaciaire (DMG) ont été très intenses et les tailles des populations survivantes probablement très réduites. J’ai eu l’occasion d’étudier l’importance des événements historiques associés à de fortes réductions démographiques sous deux latitudes extrêmes : en Afrique centrale équatoriale, en confrontant la distribution de la diversité génétique de l’okoumé (Aucoumea klaineana Pierre) aux patrons de diversités spécifiques et à travers l’Océan Austral, en analysant la structure spatiale de la diversité génétique de deux plantes Azorella selago Hook et Acaena magellanica (Lam.) Vahl sur l’ensemble de leurs distributions continentales et insulaires subantarctiques.
Au sein de l’UMR-CEFE, j’étudie actuellement, l’importance des changements climatiques passés sur des espèces en interactions obligatoires. La stabilité de ces mutualismes dépend directement de la survie de chaque partenaire lors des changements climatiques passés or ces espèces ont souvent des traits d’histoire de vie très différents. Plus particulièrement, j’étudie l’influence des changements climatiques passés sur association symbiotique obligatoire entre une plante, une fourmi et un champignon d’Afrique centrale : l’arbre Barteria fistulosa se caractérise pas des branches creuses, les domaties, dans lesquelles vivent et se reproduisent une colonie de fourmi de l’espèce des Tetraponera aethiops qui y cultivent un champignon de l’ordre des Chaetothyriale.

Syndromes de dispersion et dynamique de colonisation.
Les syndromes de dispersion ont une importance cruciale pour la dynamique de colonisation et la survie des espèces. Je me suis plus particulièrement intéressée aux conséquences de l’anémochorie et l’anémophilie, processus de dispersion fortement orientés sur la structure des populations fragmentées, en Afrique centrale et en région sub-Antarctique.

Formation et Recherches

o   2012-2013 : Projet post-doctoral à l’UMR5175-CEFE de Montpellier. Stabilité d'un mutualisme complexe le long d’un gradient climatique.
o   2010-2011 : Projet post-doctoral dans le département de Botanique et de Zoologie, Université de Stellenbosch (Afrique du Sud). Comment les changements climatiques affectent les capacités de dispersion des plantes ? Étude de la structure génétique spatiale d’Azorella selago sur l’île sub-Antarctique Marion.
o   2008-2009 : Projet post-doctoral dans le département de Botanique et de Zoologie, Université de Stellenbosch (Afrique du Sud). Importance des événements de dispersion longue distance à travers l’Océan Austral.
o   2007 : Doctorat en Écologie et Biologie Évolutive, Université de Montpellier II. Diversité génétique et dynamique des forêts d’Afrique centrale. Une étude multi-échelles de la structure de la diversité génétique d’un arbre pionnier Aucoumea klaineana (Burseraceae).
o   2002-2004  : Ingénieur d’étude en Écologie à l’UMR5175-CEFE de Montpellier. Caractérisation de l’introgression génétique entre deux espèces de chênes méditerranéens.
o   2001-2002 : DEA en Biologie Forestière de l’Université de Nancy I & Magistère de Génétique de l’Université de Paris VII. Analyse des associations entre statuts successionnels, discrimination isotopique et traits fonctionnels foliaires des arbres forestiers amazoniens (UMR-EcoFoG, Kourou).

Bourses

o    2010 : Bourse post-doctorale des Fonds de Recherche AXA (AXA Research Fund) dans le Département de Botanique et de Zoologie, Université de Stellenbosch (Afrique du Sud).
o    2008-2009 : Bourse post-doctorale SANAP-NRF dans le Département de Botanique et de Zoologie, Université de Stellenbosch (Afrique du Sud).
o    2006-2007 : Bourse doctorale de l’Agence Universitaire de la Francophonie, Unité de Génétique Tropicale, CIRMF (Gabon).

Publications

Blatrix R, Debaud S, Salas-Lopez A, Born C, Benoit L, McKey DB, Atteke C, Djiéto-Lordon C (In press). Convergent evolution of fungal cultivar specificity in independently evolved ant-plant-fungus symbioses. PLOS One.

Hardy OJ, Born C, Budde K, Daïnou K, Dauby G, Duminil J, Ewédjé E-E, Heuertz M, Koffi G-K, , Lowe A, Micheneau C, Ndiade Bourobou D, Poncet V (In press) Comparative phylogeography of African rainforest trees: a review of genetic signatures of vegetation history in the Guineo-Congolian domain. Comptes Rendus Geoscience.

Blatrix R, Born C, McKey D (In press) Consequences of past climate change on population and evolutionary dynamics of obligatory interacting species. Comptes Rendus Geoscience.

Benoit L, Blatrix R, Djiéto-Lordon C, Atteke C, l Mezui-M’Eko J, Dubois M-P, McKey DB, Born C (2013) Characterization of microsatellite loci for a fungal symbiont (Ascomycota, Chaetothyriales) in an ant-plant-fungus symbiosis. Molecular Ecology Resources, 13 : 760-762.

Peccoud J, Piatscheck F, Yockteng R, Garcia M, Sauve M, Djieto-Lordon C, Harris DJ, Wieringa JJ, Breteler FJ, Born C, McKey D, Blatrix R (2013) Multi-locus phylogenies of the genus Barteria (Passifloraceae) portray complex patterns in the evolution of myrmecophytism. Molecular Phylogeny and Evolution, 66: 824-832.

Born C, le Roux PC, Spohr C, McGeoch MA, Jansen van Vuuren B (2012) Plant dispersal in the sub-Antarctic inferred from anisotropic genetic structure. Molecular Ecology, 21: 184-194.

Webber BL, Born C, Conn BJ, Hadiah JT, Zalamea PC (2011) What is in a name ? That which we call Cecropia peltata by any other name would be as invasive ? Plant Ecology and Diversity, 4: 289-293.

Cerfonteyn ME, le Roux PC, Jansen van Vuuren B, Born C (2011) Cryptic spatial aggregation of the cushion plant Azorella selago revealed by a multilocus molecular approach suggests frequent intraspecific facilitation under sub-Antarctic conditions. American Journal of Botany, 98(5): 909-914.

Benoit L, Born C,Vignes H,Chevallier M-H,Todou G, Debain C, Joly HI (2011) Polymorphic microsatellite loci from Dacryodes edulis (Burseraceae), a central African rainforest and fruit–tree species. American Journal of Botany, 2011:e74-e75.

Groenewald CW, Born C, Chown SL,Jansen van Vuuren B (2011) Development of a microsatellite library for the flightless mothPringleophaga marioniViette(Lepidoptera: Tineidae).ConservationGeneticsResources,3(2):291-294.

Born C,Alvarez N,McKey D,Ossari S,Wickings EJ,Hossaert-McKey M,Chevallier MH (2011) Insights into the biogeographical history of the Lower Guinea Forest Domain:  evidence for the role of refugia in the intraspecific differentiation of Aucoumea klaineana. MolecularEcology, 20:131-142.

Bout N, Born C, Spohr C (2010) Evidence that the spotted hyena is present in the rainforest-savannah mosaic of south-east Gabon. Mammalian Biology-Zeitschriftfur Saugetierkunde,75:175-179.

Born C, McGeoch M,Jansen van Vuuren B (2010) Eight polymorphic microsatellite markers developed to study the genetic diversity of Azorella selago (Apiaceae),a keystone species on sub-Antarctic Marion Island. In MERPD Consortium, Molecular Ecology Resources,10,232-236.

Born C, Kjellberg F, Vignes H,Wickings EJ,Chevallier MH,Hossaert-McKey M (2008) Colonization processes and the maintenance of genetic diversity:insights from a pioneer rainforest tree,Aucoumea klaineana.Proceedings of the Royal Society of London, B, 275 (1647):2171-2179.

Born C, Hardy O,Ossari S, Attéké C, Wickings EJ, Chevallier MH, Hossaert-McKey M (2008) Small-scale spatial genetic structure in the Central African rainforest tree species, Aucoumea klaineana: a stepwise approach to infer the impact of limited gene dispersal, population history and habitat fragmentation. Molecular Ecology,17:2041-2050. See also Dick (2008) Molecular Ecology,17:1873-1874 for aPerspective on this paper.

Bonal D, Born C, Brechet C, Coste S, Marcon E,Roggy JC,Guehl JM(2007) The successional status of tropical rainforest tree species is associated with differences in leaf carbon isotope discrimination and functional traits. Annals of Forest Sciences, 64:169-176.

Born C, Vignes H, Wickings EJ, Hossaert-McKey M,Chevallier MH (2006) Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci from Aucoumea klaineana Pierre (Burseraceae), a tropical tree endemic to the Congo Basin. Molecular Ecology Notes, 6: 1054-1056.

Alvarez N, McKey D,Hossaert-McKey M, Born C, Mercier L,Benrey B (2005) Ancient and recent evolutionary history of the bruchid beetle, Acanthoscelides obtectus Say, a cosmopolitan pest of beans.Molecular Ecology,14:1015-1024.

Coste S,Roggy JC,Imbert P,Born C,Bonal D,Dreyer E (2005) Diversity in leaf traits related to photosynthesis among seedlings from 14 rainforest tree species: is there a relationship with the ecological grouping of the species? Tree Physiology, 25:1127-1137.

Lumaret R,Tryphon-Dionnet M, Michaud H, Sanuy A,Ipotesi E, Born C, MirC (2005) Phylogeographical variation of chloroplast DNA in Cork Oak(Quercus suber). Annals of Botany, 96:853-861.

Alvarez N, Born C ,Risterucci AM,Sourrouille P,Benrey B,Hossaert-McKey M (2004) Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in Acanthoscelides obtectus Say (Coleoptera:Bruchidae).Molecular Ecology Notes, 4:683-685.

Chapitre de livre

Ouwe Missi Oukem-Boyer O, Migot-Nabias F, Born C, Aubouy A, Nkenfou C (2012) Application of PCR Technologies to Humans, Animals, Plants and Pathogens from Central Africa. In Polymerase Chain Reaction (Eds Hernandez-Rodriguez and Ramirez-Gomez), InTech, 566pp.

Thèse de doctorat 

Born C (2007) Diversité génétique et dynamique des forêts d’Afrique centrale. Une étude multi-échelle de la structure de la diversité génétique d’un arbre pionnier, Aucoumea klaineana. Université Montpellier II, Montpellier, France.