Unité Mixte de Recherche 5175

Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive

 

 

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Directeur de recherche au CNRS.
Membre de l'Académie des Sciences.

Directeur du CEFE
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
UMR 5175, Montpellier (France).

Equipe de recherche :
Biométrie et Biologie des populations

Tél : +33/0 4 67 61 32 00 et 32 01
Fax :+33/0 4 67 41 21 38

 

Mots-clés : Organisme biologique : Mouette rieuse - Milieu : Terrestre - Discipline : Ecologie - Technique : Modélisation - Thématiques : Dynamique des populations, Ecologie statistique - Autres mots clés : Démographie animale,  Espèces à longue durée de vie, Ecologie de la conservation, Biodiversité, Modèles multi-états de capture-recapture.

Thèmes de recherche
Modélisation en dynamique des populations.
Écologie de la conservation et de la gestion des populations.


Discours de réception à l'Académie des Sciences (19 juin 2007)


Publications sélectionnées

Thèses

LEBRETON, J.D. (1974).- Quelques modèles en temps discret de la dynamique des populations. Application à la Mésange charbonnière et au Fuligule milouin. Thèse de spécialité, Université Lyon I, Villeurbanne, 28p.

LEBRETON, J.D. (1981).- Contribution à la dynamique des populations d'oiseaux. Modèles mathématiques en temps discret. Thèse de doctorat ès-sciences, Université Lyon I, Villeurbanne, 211 p.

Articles sélectionnés (1992 à 2005)

Lebreton, J.-D., Burnham, K.P., Clobert, J. & Anderson, D.R. (1992). "Modelling survival and testing biological hypotheses using marked animals: a unified approach with case studies." Ecological Monographs, 62:67-118.

Lebreton, J.-D. & Gonzalès-Dàvila, G. (1993). "An introduction to models of subdivided populations." Journal of Biological Systems, 1 : 389-423.

Lebreton, J.-D. & Gerdaux, D. (1996). "Gestion des populations de Grand Cormoran (Phalacrocorax carbo) hivernant en France." Rapport au Ministre de l'Environnement, Septembre 1996. Document polycopié Ministère de l'Environnement, 45 p. http://ftp.cefe.cnrs.fr/biom/Cormoran/

Prévot-Julliard, A.C., Pradel, R., Lebreton, J.-D. & Cézilly, F. (1998). "Evidence for birth-site tenacity in breeding Common Black-headed Gulls, Larus ridibundus." Canadian Journal of Zoology, 76 : 2295-2298.

Prévot-Julliard A.C., Lebreton, J.-D. & Pradel, R. (1998). "Re-evaluation of adult survival of black-headed gulls (Larus ridibundus) in presence of recapture heterogeneity." The Auk, 115: 85-95.

Pradel, R. & Lebreton, J.-D. (1999). "Comparison of different approaches to the study of local recruitment of breeders." Bird Study 46(Suppl.): 74-81.

Besnard, A., O. Gimenez & J.-D. Lebreton (2002). "A model for the evolution of creching behaviour in gulls." Evolutionary Ecology 16: 489-503. 

Besnard, A., O. Scher, J.-D. Lebreton & N. Sadoul (2002). "Forced copulation attempts on gull chicks." Ibis 144(4): 684-685.        

Crespin, L., P. Berrebi & J.-D. Lebreton (2002). "Spatially varying natural selection in a fish hybrid zone." Journal of Fish Biology 61: 691-711.  

Crespin, L., R. Verhagen, N. C. Stenseth, N. G. Yoccoz, A.-C. Prévot-Julliard & J.-D. Lebreton (2002). "Survival in fluctuating bank vole populations: seasonal and yearly variations." Oikos 98(3): 467-479.       

Crochet, P.-A., J.-D. Lebreton & F. Bonhomme (2002). "Systematics of large white-headed gulls: patterns of mitochondrial DNA variation in Western European taxa." The Auk 119(3): 603-620. 

Frederiksen, M., T. Bregnballe, M. R. Van Eerden, S. Van Rijn & J.-D. Lebreton (2002). "Site fidelity of wintering cormorants Phalacrocorax carbo sinensis in Europe." Wildlife Biology 8(4): 241-250.        

Lebreton, J.-D. & Pradel, R. (2002). "Multistate recapture models : modelling incomplete individual histories." J. Appl. Stat. 29: 353-369.

Spendelow, J. A., J. D. Nichols, J. E. Hines, J.-D. Lebreton & R. Pradel (2002). "Modelling postfledging survival and age-specific breeding probabilities in species with delayed maturity: a case study of Roseate Terns at Falkner Island, Connecticut." Journal of Applied Statistics 29(1-4): 385-405. 

Tavecchia, G., R. Pradel, F. Gossmann, C. Bastat, Y. Ferrand & J.-D. Lebreton (2002). "Temporal variation in annual survival probability of the Eurasian woodcock Scolopax rusticola wintering in France." Wildlife Biology 8(1): 21-30.           

Tavecchia, G., R. Pradel, J.-D. Lebreton, L. Biddau & T. Mingozzi (2002). "Sex-biased survival and breeding dispersal probability in a patchy population of the Rock Sparrow Petronia petronia." Ibis 144(2): E79-E87 (online).  

Besbeas, P., J.-D. Lebreton & B. J. T. Morgan (2003). "The efficient integration of abundance and demographic data." Applied Statistics 52: 95-102. 

Crochet, P.-A., J. Z. Chen, J.-M. Pons, J.-D. Lebreton, P. D. N. Hebert & F. Bonhomme (2003). "Genetic differentiation at nuclear and mitochondrial loci among large white-headed gulls: sex-biased interspecific gene flow?" Evolution 57(12): 2865-2878.    

Gimenez, O., R. Choquet & Lebreton, J.-D. (2003). "Parameter Redundancy in Multistate Capture-Recapture Models." Biometrical Journal 45(6): 704-722

Lebreton, J.-D., Hines, J.E., Pradel, R., Nichols, J.D. & Spendelow, J.A. (2003). "Estimation by capture-recapture of recruitment and dispersal over several sites." Oikos 101: 253-264.

Pons, P., P.-Y. Henry, G. Gargallo, R. Prodon & J.-D. Lebreton (2003). "Local survival after fire in Mediterranean shrublands: combining capture-recapture data over several bird species." Population Ecology 45: 187-196.   

Reed, E. T., G. Gauthier, R. Pradel & J.-D. Lebreton (2003). "Age and environmental conditions affect recruitment in greater snow geese." Ecology 84(1): 219-230.           

Choquet, R., A.-M. Reboulet, R. Pradel, O. Gimenez & J.-D. Lebreton (2004). "M-SURGE: new software specifically designed for multistate capture-recapture models." Animal Biodiversity and Conservation 27(1): 207-215.      

Espuno, N., B. Lequette, M.-L. Poulle, P. Migot & J.-D. Lebreton (2004). "Heterogeneous response to preventive sheep husbandry during wolf recolonization of the French Alps." Wildlife Society Bulletin 32(4): 1195-1208.           

Gauthier, G. & J.-D. Lebreton (2004). "Population models for Greater Snow Geese: a comparison of different approaches to assess potential impacts of harvest." Animal Biodiversity and Conservation 27(1): 503-514.     

Lebreton, J.-D. & K. H. Pollock (2004). "Methodological advances." Animal Biodiversity and Conservation 27.1: 147-148.    

Schaub, M. et J.-D. Lebreton (2004). "Testing the additive versus the compensatory hypothesis of mortality from ring recovery data using a random effects model." Animal Biodiversity and Conservation 27(1): 73-85.     

Schaub, M., R. Pradel & J.-D. Lebreton (2004). "Is the reintroduced white stork (Ciconia ciconia) population in Switzerland self-sustainable?" Biological Conservation 119: 105-114. 

Gaillard, J.-M., N. G. Yoccoz, J.-D. Lebreton, C. Bonenfant, S. Devillard, A. Loison, D. Pontier & D. Allainé (2005). "Generation time: a reliable metric to measure life history variation among mammalian populations." The American Naturalist 166: 119-123.

Lebreton, J.-D. (2005). "Dynamical and statistical models for exploited populations." Australian and New Zealand Journal of Statistics 47(1): 49-63.

Niel, C. & J.-D. Lebreton (2005). "Using demographic invariants to detect overharvested bird populations from incomplete data." Conservation Biology 19: 826-835. 

Lebreton, J.-D. (2006). "Dynamical and statistical models of Vertebrate population dynamics." Comptes Rendus Biologies in press. 


Choquet, R., Reboulet, A.-M., Pradel, R., Gimenez, O. & Lebreton J.D. (2004).- M–SURGE: new software specifically designed for multistate capture–recapture models. Animal Biodiversity and Conservation. 27(1): 207-215.

Choquet, R., Reboulet, A.-M., Pradel, R., Gimenez, O., Lebreton, J.-D. (2003). User’s manual for M-SURGE 1.0. Mimeographed document, CEFE/CNRS, Montpellier
ftp://ftp.cefe.cnrs.fr/biom/Soft-CR/.

Choquet, R., Reboulet, A.-M., Pradel, R., Gimenez, O., Lebreton, J.-D. (2003). User’s manual for U-CARE. Mimeographed document, CEFE/CNRS, Montpellier
ftp://ftp.cefe.cnrs.fr/biom/Soft-CR/.

Pradel, R., O. Gimenez, J.-D. Lebreton. (2003). Principles and interest of GOF tests for multistate models. EURING conference. Radolfzell, Germany.

Choquet R., A.-M. Reboulet, R. Pradel, O. Gimenez, J.-D. Lebreton. (2003). M-SURGE - New software for multistate recapture models. EURING conference. Radolfzell, Germany.


 

Ecole doctorale Biologie des Systèmes Intégrés Agronomie Environnement
Université Montpellier II.

Master Mathématique Informatique du vivant
Université Lyon I.


Formation à la recherche 

Ateliers de travail

 

reunion.wmf (4950 octets) ANALYSIS OF MULTISTATE CAPTURE-RECAPTURE DATA:

modelling incomplete individual histories

POPULATION PROJECTION MATRIX MODELS

 


 La mouette rieuse Larus ridibundus est une espèce  typique du groupe des "mouettes à capuchons". La plupart de ces espèces nichent à l'intérieur des terres dans des zones humides. La population étudiée niche dans la plaine du Forez, 60 km à l'ouest de Lyon (France). Chaque année plusieurs colonies s'installent sur les étangs de la plaine. La colonie la plus importante (sur l'étang de La Ronze à Craintilleux, Loire) attire plus de 5000 couples nicheurs. Dans le cadre d'une étude à long terme (1976- ), les poussins sont bagués chaque année sur les colonies.
Les méthodes d'échantillonnage, appelées CMR (Capture-Marquage-Recapture), permettent d'estimer les paramètres démographiques : survie, fécondité, accès à la reproduction .... Dans notre étude, le baguage et les lectures de bagues sur les étangs de la plaine du Forez permettent de nous intéresser aux échanges et aux mouvements dans l'espace et dans le temps des individus, et d'aborder les problèmes de recrutement et plus généralement de fonctionnement d'une population distribuée spatialement.

 

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Mise à jour
27 décembre 2009

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