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Mots-clés :
Organisme biologique : Mouette rieuse
- Milieu : Terrestre - Discipline :
Ecologie
- Technique : Modélisation
- Thématiques : Dynamique des populations,
Ecologie statistique
- Autres mots clés : Démographie animale, Espèces à longue durée de vie, Ecologie de la
conservation, Biodiversité, Modèles multi-états
de capture-recapture.
Thèmes de recherche
Modélisation en dynamique des populations.
Écologie de la conservation
et de la gestion des populations.
Discours de réception à l'Académie des Sciences
(19 juin 2007)
Thèses
LEBRETON, J.D. (1974).- Quelques modèles en temps
discret de la dynamique des populations. Application à la Mésange charbonnière
et au Fuligule milouin. Thèse de spécialité, Université Lyon I, Villeurbanne,
28p.
LEBRETON, J.D. (1981).- Contribution à la dynamique
des populations d'oiseaux. Modèles mathématiques en temps discret. Thèse de
doctorat ès-sciences, Université Lyon I, Villeurbanne, 211 p.
Articles sélectionnés
(1992 à 2005)
Lebreton,
J.-D.,
Burnham, K.P., Clobert, J. & Anderson, D.R. (1992). "Modelling
survival and testing biological hypotheses using marked animals: a unified
approach with case studies." Ecological Monographs, 62:67-118.
Lebreton,
J.-D. & Gonzalès-Dàvila, G. (1993). "An
introduction to models of subdivided populations." Journal of Biological
Systems, 1 : 389-423.

Lebreton,
J.-D. &
Gerdaux,
D. (1996). "Gestion
des populations de Grand Cormoran (Phalacrocorax
carbo) hivernant en France." Rapport au Ministre
de l'Environnement, Septembre 1996. Document polycopié Ministère de
l'Environnement, 45 p.
http://ftp.cefe.cnrs.fr/biom/Cormoran/
Prévot-Julliard,
A.C., Pradel, R.,
Lebreton,
J.-D.
&
Cézilly, F. (1998). "Evidence for birth-site tenacity in breeding Common Black-headed Gulls,
Larus ridibundus."
Canadian
Journal of Zoology, 76 : 2295-2298.
Prévot-Julliard
A.C., Lebreton, J.-D. & Pradel,
R. (1998). "Re-evaluation
of adult survival of black-headed gulls (Larus
ridibundus) in presence of recapture
heterogeneity." The Auk, 115: 85-95.
Pradel,
R. & Lebreton, J.-D.
(1999).
"Comparison of different approaches to the study of local recruitment of
breeders."
Bird Study 46(Suppl.): 74-81.

Besnard, A., O. Gimenez
& J.-D. Lebreton (2002). "A model
for the evolution of creching behaviour in gulls." Evolutionary Ecology
16: 489-503.
Besnard, A., O. Scher, J.-D. Lebreton
& N. Sadoul (2002).
"Forced copulation attempts on gull chicks."
Ibis 144(4): 684-685.
Crespin, L., P. Berrebi
& J.-D. Lebreton (2002).
"Spatially varying natural selection in a fish
hybrid zone." Journal of Fish Biology 61: 691-711.
Crespin, L., R. Verhagen, N. C. Stenseth, N.
G. Yoccoz, A.-C. Prévot-Julliard
& J.-D. Lebreton (2002). "Survival in
fluctuating bank vole populations: seasonal and yearly variations."
Oikos 98(3): 467-479.
Crochet, P.-A., J.-D. Lebreton
& F. Bonhomme (2002).
"Systematics of large white-headed gulls:
patterns of mitochondrial DNA variation in Western European taxa." The Auk
119(3): 603-620.
Frederiksen, M., T. Bregnballe, M. R. Van
Eerden, S. Van Rijn
& J.-D. Lebreton (2002). "Site fidelity of wintering
cormorants Phalacrocorax carbo sinensis in Europe." Wildlife Biology
8(4): 241-250.
Lebreton,
J.-D.
& Pradel, R. (2002).
"Multistate recapture models : modelling incomplete
individual histories." J. Appl. Stat. 29: 353-369.

Spendelow, J. A., J. D. Nichols, J. E. Hines,
J.-D. Lebreton
& R. Pradel (2002). "Modelling postfledging survival and
age-specific breeding probabilities in species with delayed maturity: a case
study of Roseate Terns at Falkner Island, Connecticut." Journal of Applied
Statistics 29(1-4): 385-405.
Tavecchia, G., R. Pradel, F. Gossmann, C.
Bastat, Y. Ferrand
& J.-D. Lebreton (2002). "Temporal variation in
annual survival probability of the Eurasian woodcock Scolopax rusticola
wintering in France." Wildlife Biology 8(1): 21-30.
Tavecchia, G., R. Pradel, J.-D. Lebreton,
L. Biddau
& T. Mingozzi (2002). "Sex-biased survival and breeding dispersal
probability in a patchy population of the Rock Sparrow Petronia petronia."
Ibis 144(2): E79-E87 (online).
Besbeas, P., J.-D. Lebreton
& B. J. T. Morgan (2003).
"The efficient integration of abundance and demographic data." Applied
Statistics 52: 95-102.
Crochet, P.-A., J. Z. Chen, J.-M. Pons, J.-D. Lebreton, P. D. N. Hebert
& F. Bonhomme (2003). "Genetic
differentiation at nuclear and mitochondrial loci among large white-headed
gulls: sex-biased interspecific gene flow?" Evolution 57(12):
2865-2878.
Gimenez, O.,
R. Choquet & Lebreton, J.-D. (2003).
"Parameter
Redundancy in Multistate Capture-Recapture Models." Biometrical Journal
45(6): 704-722

Lebreton, J.-D.,
Hines, J.E.,
Pradel, R., Nichols, J.D. &
Spendelow, J.A. (2003).
"Estimation
by capture-recapture of recruitment and dispersal over several sites."
Oikos
101: 253-264.

Pons, P., P.-Y.
Henry, G. Gargallo, R. Prodon
& J.-D. Lebreton (2003).
"Local survival after fire in
Mediterranean shrublands: combining capture-recapture data over several bird
species." Population Ecology 45: 187-196.
Reed, E. T., G. Gauthier, R. Pradel
&
J.-D. Lebreton (2003). "Age and environmental conditions affect recruitment
in greater snow geese." Ecology 84(1):
219-230.
Choquet, R., A.-M. Reboulet, R. Pradel, O. Gimenez
& J.-D. Lebreton
(2004). "M-SURGE: new software
specifically designed for multistate capture-recapture models." Animal
Biodiversity and Conservation 27(1): 207-215.
Espuno, N., B. Lequette, M.-L. Poulle,
P. Migot
& J.-D. Lebreton (2004).
"Heterogeneous response to preventive
sheep husbandry during wolf recolonization of the French Alps." Wildlife
Society Bulletin 32(4): 1195-1208.
Gauthier, G.
& J.-D. Lebreton (2004).
"Population models for Greater Snow Geese: a comparison of
different approaches to assess potential impacts of harvest." Animal
Biodiversity and Conservation 27(1): 503-514.
Lebreton, J.-D.
& K. H. Pollock
(2004). "Methodological advances."
Animal Biodiversity and Conservation 27.1: 147-148.
Schaub, M. et J.-D. Lebreton (2004).
"Testing the additive versus the compensatory hypothesis of
mortality from ring recovery data using a random effects model." Animal
Biodiversity and Conservation 27(1): 73-85.
Schaub, M., R. Pradel
& J.-D. Lebreton (2004). "Is
the reintroduced white stork (Ciconia ciconia) population in Switzerland
self-sustainable?" Biological Conservation 119: 105-114.
Gaillard, J.-M., N. G. Yoccoz, J.-D. Lebreton, C. Bonenfant, S. Devillard,
A. Loison, D. Pontier
& D. Allainé (2005).
"Generation time: a reliable metric to measure life history
variation among mammalian populations." The American Naturalist 166:
119-123.
Lebreton, J.-D. (2005). "Dynamical and statistical
models for exploited populations." Australian and New Zealand Journal of
Statistics 47(1): 49-63.

Niel, C.
& J.-D. Lebreton (2005).
"Using demographic invariants to detect overharvested bird
populations from incomplete data." Conservation Biology 19:
826-835.
Lebreton, J.-D. (2006). "Dynamical and
statistical models of Vertebrate population dynamics."
Comptes Rendus Biologies in press.
Choquet, R., Reboulet, A.-M., Pradel, R., Gimenez, O. & Lebreton J.D.
(2004).- M–SURGE: new software specifically designed for multistate capture–recapture
models. Animal Biodiversity and Conservation.
27(1): 207-215.

Choquet, R.,
Reboulet, A.-M., Pradel, R., Gimenez, O., Lebreton, J.-D. (2003).
User’s manual for M-SURGE 1.0. Mimeographed document, CEFE/CNRS, Montpellier
ftp://ftp.cefe.cnrs.fr/biom/Soft-CR/.
Choquet, R.,
Reboulet, A.-M., Pradel, R., Gimenez, O., Lebreton, J.-D. (2003).
User’s manual for U-CARE. Mimeographed document, CEFE/CNRS, Montpellier
ftp://ftp.cefe.cnrs.fr/biom/Soft-CR/.
Pradel, R., O. Gimenez, J.-D. Lebreton. (2003). Principles and
interest of GOF tests for multistate models. EURING conference.
Radolfzell,
Germany.

Choquet R., A.-M.
Reboulet, R. Pradel, O. Gimenez, J.-D. Lebreton. (2003). M-SURGE
- New software for multistate recapture models. EURING conference.
Radolfzell,
Germany.

Ecole doctorale
Biologie des Systèmes Intégrés Agronomie Environnement
Université
Montpellier II.
Master
Mathématique
Informatique du vivant
Université Lyon I.

ANALYSIS OF
MULTISTATE CAPTURE-RECAPTURE DATA:
modelling incomplete individual histories
POPULATION
PROJECTION MATRIX MODELS
La mouette rieuse
Larus ridibundus est une espèce
typique du groupe des "mouettes à capuchons". La plupart de ces espèces
nichent à l'intérieur des terres dans des zones humides. La population étudiée
niche dans la plaine du Forez, 60 km à l'ouest de Lyon
(France). Chaque année plusieurs colonies s'installent sur les étangs de la
plaine. La colonie la plus importante (sur l'étang de La Ronze à Craintilleux, Loire) attire plus de 5000 couples nicheurs. Dans le cadre d'une étude à long
terme (1976- ), les poussins sont bagués chaque année sur les colonies.
Les
méthodes d'échantillonnage, appelées CMR (Capture-Marquage-Recapture),
permettent d'estimer les paramètres démographiques : survie, fécondité, accès à
la reproduction .... Dans notre étude, le baguage et les lectures de bagues sur
les étangs de la plaine du Forez permettent de nous intéresser aux échanges et
aux mouvements dans l'espace et dans le temps des individus, et d'aborder les
problèmes de recrutement et plus généralement de fonctionnement d'une population
distribuée spatialement.
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